會議開完後，馬铖帶上自己的五千神機營，離開正陽門去自己的指揮部。

  這個指揮部的挑選可耗費了馬铖不少精力，這個地點要四通八達地處交通要道，還要距離和正陽門、聚寶門主戰場不遠不近。馬铖在輦圖上選了半天，終於挑選了應天府衙當這個指揮部。

  應天府衙在後世南京府西街和中華路的交匯處，這裡正好地處中城，和聚寶門、三山門、通濟門、正陽門都有主乾道聯通，同時這裡距離聚寶門五裡路，距離正陽門六裡路，完全可以保證出現問題時增援部隊可以在半個時辰內趕到。

  同時應天府對面就是承恩寺，這個由明宣宗時期的大太監王瑾建成的寺廟，佔地數百畝，裡面空地很多正好可以當成駐軍之所。

  馬铖帶著軍隊來到應天府門前，守門的衙役看到這麽多軍隊來了，嚇的趕緊進去稟報知府吳家周知曉。吳家周是天啟五年三甲進士，黨附東林才當上應天府知府，現在東林黨倒台了正在六神無主，聽馬士英的兒子馬铖來了，趕緊出來親自迎接。

  要知道應天是首都，應天府知府是從三品，和侍郎、布政使等高官同級，現在出來迎接馬铖這麽一個武將，吳家周真是丟了士大夫的臉。

  “馬大人，下官吳家周，恭迎馬大人大駕光臨！”吳家周滿臉媚笑，深施一躬後看著馬铖。

  馬铖騎在高頭大馬上撇著嘴點了點頭：“吳知府，本督奉皇帝陛下的聖旨負責抵禦北虜，你的應天府地理位置重要，所以本督決定在這建立本督的衙門，你可同意？”

  吳家周聽馬铖這麽說心中大罵：你不是自己有衙門嗎？跑城裡強佔我的衙門幹什麽？
  不過現在東林黨已經樹倒猢猻散，吳家周可不敢得罪馬士英的兒子，沒辦法隻好苦笑道：“馬大人既然有旨意，下官自然全力配合！”

  馬铖聽吳家周這麽說笑道：“好，不過你這裡地方不夠大，煩勞知府大人派出衙役溝通承恩寺，讓本督的士兵進駐！”

  吳家周沒辦法隻好叫來都頭，讓他帶領馬铖的士兵去對面的承恩寺。

  馬铖安排顧長衛帶著四千人去承恩寺，許大虎帶著一千人進駐應天府衙。吳家周看到這麽多人要進駐，趕緊說道：“大人，這些士兵能不能都去承恩寺，本衙實在沒有這麽多空房間啊！”

  馬铖一瞪眼睛罵道：“怎麽？沒空房間就讓你們的衙役書辦滾蛋，本督的士兵有一個沒地方安置就拿你是問！”

  馬铖說完不管吳家周，帶著親兵邁步進了應天府衙。馬铖手下的士兵則各個如狼似虎，將應天府中的衙役、書辦、師爺統統攆了出來。

  應天府的同知看馬铖鬧的不像樣子，站出來想要斥責馬铖不懂規模，那知道馬铖管你那些，讓士兵連抽這家夥十個大嘴巴，打的後槽牙都掉了兩個。

  看到這幫丘八如此蠻橫，府衙眾人不敢遲疑，隻好帶著自己的細軟逃出府衙。

  吳家周看這個樣子歎了口氣，反正現在兵荒馬亂的，吳家周隻好給那些衙役放假。

  馬铖看吳家周要給衙役放假，趕緊攔住說道：“正好城外徐沾處需要人手，你們這幫廢物都去幫忙！”

  徐沾是溧水縣令，歸應天府管理，現在讓上官去給下級當幫手，大家一個個都十分不滿。

  但是不滿你能怎麽地？人家馬铖有槍杆子，沒辦法吳家周隻好將十幾個有品級的官員留下，剩下的一百多個吏員都派出去歸徐沾管理。

  南京城裡寸土寸金，應天府衙原本就不大，馬铖的一千士兵在加上五百親兵進來後馬上擁擠不堪，就連大堂、二堂等重要地方都搭起了鋪蓋。

  馬铖帶著幾個將領往後走，來到三堂，這裡已經是屬於知府的私人空間，再往後就是內宅了。馬铖看了看這個三堂環境不錯，院子裡種了幾棵樹木，環境很是僻靜。

  馬铖點點頭說道：“好，這裡就是本督的指揮部，朱同，你安排一下，讓各司進駐。”

  中軍官朱同聽馬铖這麽說趕緊接令，出去開始安排提督衙門直屬各司進入，馬铖官職相當於後世的大軍區司令，他的直屬官也有一百多人，什麽中軍官、旗牌官、督糧官，還有軍情司、武庫司、糧運司等等下屬機構，在加上沒品級的書辦、大使、護軍，一共三百多人擠進了這個小小的三堂。

  吳家周看到自己收藏的字畫書籍都被這幫不通文墨的丘八丟在一旁，沒辦法隻好歎了口氣回到自己後宅。

  馬铖算正式在知府衙門開始辦公，各條命令有條不紊的從這裡傳遞出去，傳達到城內各處的大小武官手中。

  馬铖在緊鑼密鼓的準備防守，事態卻越來越惡化。從二十七日開始，從江北陸陸續續逃難過來的人越來越多，他們傳來的消息也光怪陸離，有說滿清大軍已經過了江的，有說滿清大軍將揚州城屠殺一空的。雖然各種消息不一定準確，但有一個事實是正確的，那就是滿清大軍就在眼前，並且正在準備渡江。

  隨著逃難的人增多，南京城裡各種謠言也開始多了起來，在五月初一城裡開始有人散布謠言，說清軍的軍艦就在江中，並且發炮攻打城牆，靠江的儀鳳門已經被轟塌。這個傳言讓南京城裡在次掀起了逃難潮，馬铖一開始還派兵彈壓，最後沒辦法隻好殺了十幾個鬧事之人，才將城內的謠言將將壓製。

  雖然將謠言壓製，但是馬铖也知道清軍渡江迫在眉睫，只是馬铖還拿不準清軍會選定那個地方渡江。而這時滿朝文武除了馬铖，還對長江天險抱有希望。雖然江北四鎮投降，但是明軍的水師可是半點沒有損失，在長江上還有鄭鴻奎帶領的上百艘戰船嚴陣以待。

  可是讓朱由崧君臣大跌眼鏡的是，號稱水戰無敵的鄭鴻奎，在一天之內就被清軍打敗，鄭鴻奎帶著剩下的殘部從長江出海，逃回福建去了。

  在五月初五端午節這天，清軍終於來到長江北岸。五月初九豫親王多鐸命梅勒章京李率泰帶領南明降將張天祿、楊承祖等部，於黎明時分在瓜州以西十五裡處乘船渡江，在金山擊敗明江防水師鄭鴻逵軍，隨即登上南岸，佔領鎮江，後續滿、漢官兵二十多萬先後渡江。

  到這時候南京城裡都知道大勢已去，五月初十這晚，朱由崧像往常一樣在宮裡聽了半夜的戲，然後用密旨召馬士英進宮。

  馬士英不知道這個時候皇帝找自己幹什麽，趕緊匆匆進宮，進入乾清宮就發現皇帝朱由崧已經換上一身青衣小帽，連身邊的心腹太監尤二也已經換上普通人的衣裝。

  馬士英一看就知道這個皇帝想要逃跑，馬士英趕緊跪下勸說道：“陛下，現在城中還有十萬健兒，未嘗不可一戰啊！”

  朱由崧一邊在太監的幫助下穿衣服，一邊說道：“馬愛卿，朕感謝你的從龍之功，但是現在南都城裡這個樣子你以為還能堅守嗎？”

  “陛下，但是出去能去哪呢？現在北虜已經渡江，南直隸馬上就是一片火海！”馬士英還準備在勸說幾句，但是那知道人家朱由崧早已經安排好退路了。

  “馬愛卿，朕要去太平府，黃得功是忠義之輩，他還有數萬人馬，必定能護著朕南巡！馬愛卿，你也回家準備一下和朕一同走吧！”

  該說不說，朱由崧對馬士英還不錯，知道逃跑的時候帶上他。馬士英聽朱由崧這麽說也心動不已，事實擺在這裡，留在南都這裡要不投降要不就是死路一條。

  朱由崧不管馬士英心中怎麽想的，反正他自己是要逃跑的。在太監為他穿好衣服後，跟著尤二出了乾清宮，會和太后鄒氏，在四五十個健壯宦官的護送下，出了皇城，經過金川門出了城，趁著夜色往太平府方向逃去。

  皇帝都跑了馬士英能怎麽辦？看到皇帝離開後馬士英隻好起身出了宮，回到家中也開始準備跑路。

  馬士英為了今天早有準備，當年從貴州調來親信的貴州兵就是為了今天。馬士英回到府中馬上將門口的百戶丁謂找來，讓他給馬铖送信，將所有貴州兵集結到府門前等候命令。

  丁謂早已經得了馬铖的命令，府中有什麽異動都要稟報，現在府中人心惶惶，同時很多家人都在收拾細軟，這個馬老爺想幹什麽自然不用想了。

  丁謂將守門的任務交給副手，然後親自騎馬去應天府衙稟報馬铖。

  這幾天馬铖為了守城之事很是勞累，今晚上剛睡著，就得知丁謂來了。他來肯定有大事，馬铖這時睡意也沒了，親自接見了丁謂。

  等丁謂將馬士英的命令和馬府的異動說了一遍後，馬铖知道皇帝肯定跑了，現在自己老子也要跑路。想到自己謀劃已久的事情就要發生，馬铖精神大振，站起來叫道：“好，從今天開始就看老子的了！”