朱由檢想求助毛鈺，但是也有聰明人勸說他，毛鈺如今實際上已經控制了除了雲貴川以外的江南大部分，再加上東北遼闊的土地。根本不需要朱由檢大方。以前之所以沒反朝廷還乖乖遞降前兩上交是因為沒人威脅到大明朝廷。相反大明朝廷在李自成再次崛起之後，如果毛鈺封鎖長江，大明朝廷實際能夠控制的就只有直隸、山東以及半個遼西！再加上過往的種種，朱由檢沒有資本和毛鈺談判，毛鈺也不會替他擊李自成。

  不過朱由檢也知道毛鈺的野心，他希望的是毛鈺此刻也能出兵來京城，那樣李自成和毛鈺的也是一觸即發，雖然這並不能解決大明朝廷的危局，至少可以狗爺殘喘一段時間，再派遣得力人手前往各地喚醒當地鄉紳、百姓前來勤王。

  但他的最後幻想也螺口了，因為一直到李自成兵困京城，毛鈺也沒有動。東北沒動靜，海上沒動靜，南邊也沒動靜。毛鈺追趕者張獻忠到開封周王被殺的消息也是及時地傳到了京城。所有人都明白現在毛鈺和李自成一樣都在著急忙慌搶地盤哪裡還顧得上京城的大明皇帝。

  大順永昌元年，三月十五日農民軍抵達居庸關，監軍太監杜之秩、總兵唐通不戰而降，同時，劉芳亮率領南路軍，東出固關後，真定太守邱茂華、遊擊謝素福出降，大學士李建泰在保定投降。三月十六日，李自成部過昌平，抵沙河。十七日進高碑店、西直門，以大炮轟城，入午攻打平則門、彰義門、西直門。

  一路上大明朝廷的文官武將聞風而降，勝券在握的李自成成功包圍京城之後還是沒有失去理智。派在昌平投降的太監杜勳入城與朱由檢秘密談判。只不過此刻的朱由檢還是沒有意識到真正的危險。他提出的條件是封李自成為秦王，允許他割據西北，同時賞賜白銀兩百萬兩。要求李自成退守河南。朱由檢是有高人出謀劃策，但李自成也不是當年那個驛站的卒子。

  割據西北已經是既成事實並不需要朱由檢承認，秦王和大順皇帝那個更具有號召力就不說了。朱由檢還想李自成幫忙鎮守河南，其實就想讓他幫忙擋住河南群賊同時牽製江南的毛鈺。

  李自成也是帶著要求來的，他希望朱由檢能夠南遷，他願意派兵護送至南京！李自成的目的當然是想讓朱由檢做擋箭牌扣在毛鈺頭上。雙方的要求都十分離譜沒有任何誠意，自然就談不攏。隨後朱由檢也開始瘋狂了，他下詔封吳三桂為遼王，目的除了讓他以及手下賣命抵抗李自成外，還要將水攪渾，牽製毛鈺。如此一來大明境內有兩個而皇帝，三個王！吳三桂也不傻，一面接受詔令一面卻遲遲不肯和李自成對決。他也要看看風向再說，無論是大明朝廷還是李自成或者是毛鈺取得最後的勝利，只要他手中有兵就能獲得一定的地位。

  三月十九日清晨，兵部尚書張縉彥主動打開正陽門，迎劉宗敏所部軍，中午，李自成由太監王德化引導，從德勝門入，經承天門步入內殿。此時崇禎帶著太監王承恩上煤山瞭望，又返回乾清宮，大臣皆己逃散，到朱由檢煤山自縊之時雖然不算是眾叛親離也差不多了。

  這些年隨著局勢的日益嚴峻，因為不相信文武百官，朱由檢還頻繁地調整官吏，十幾年間他竟然換了17個刑部尚書和50個內閣大學士。造成國家人才匱乏，有心報國的志士既不肯也不敢請纓效命。無奈之下，朱由檢隻好培植私人勢力，重新起用大批太監。與此同時，朱由檢雖屢下罪己詔，然苛捐雜稅層出不窮，民不聊生，而明末的眾多農民起義也正是其貪財苛政最嚴重的後果。

  此外，在遼東戰局屢敗之時，不納周皇后遷都之諫而喪失了最後的機會；而從南朱由檢的濫殺也日趨嚴重，總督中被誅者七人，巡撫被戮者十一人。到了關鍵時刻哪裡還有地方官員願意跟隨這位剛愎自用的皇帝。

  毛鈺雖未穿越者，但也是朱由檢率先發難才導致毛鈺徹底背離的。當初李自成還沒有做大，毛鈺還沒有進入遼東，毛鈺控制了大明沿海，平定了大明東南，卻得不到應收的尊重。

  當初清軍還很強大，朱由檢亦知不能兩面作戰，私底下同意議和。但明朝士大夫鑒於南宋的教訓，皆以為與滿人和談為恥。因此朱由檢對於和議之事，始終左右為難。大好的機會就這樣白白流失，而東巡遼西導致了局勢變化，毛鈺也不得不提前出手。逼迫孫傳庭剿匪，也導致了孫傳庭倉促之間失敗，以至於李自成一發不可收拾。

  大學士李建泰投降，李自成部開始包圍北*京，明王朝面臨滅頂之災。明軍在與農民起義軍和清軍的兩線戰鬥中，屢戰屢敗，早已完全喪失戰鬥力。

  三月十七日，農民起義軍圍攻京城。十八日晚，朱由檢與貼身太監王承恩登上煤山，遠望著城外和彰義門一帶的連天烽火，只是哀聲長歎，徘徊無語。李自成軍攻入北*京。太監王廉急告皇帝，崇禎在宮中飲酒長歎：“苦我民爾！”太監張殷勸皇帝投降，被一劍刺死。崇禎命人分送太子、永王、定王到勳戚周奎、田弘遇家。回宮後寫下詔書，命成國公朱純臣統領諸軍和輔助太子朱慈烺。又命周皇后、袁貴妃和3個兒子入宮，簡單叮囑了兒子們幾句，命太監將他們分別送往外戚家避藏。他又哭著對周皇后說：“你是國母，理應殉國。”周皇后也哭著說：“妾跟從你14年，陛下沒有聽過妾一句話，以致有今日。現在陛下命妾死，妾怎麽敢不死?”說完解帶自縊而亡。朱由檢轉身對袁貴妃說：“你也隨皇后去吧！”袁貴妃哭著拜別，也自縊。朱由檢又召來11歲的長平公主，流著淚說：“你為什麽要降生到帝王家來啊！”說完左袖遮臉，右手拔出刀來砍中了她的左臂，接著又砍傷她的右肩，她昏死了過去。同時也揮劍刺死了自己年僅2歲的麽女—昭仁公主。

  朱由檢又砍死了妃嬪數人，並命令左右去催懿安張皇后自盡。