小智等人在經過漫長的旅行之後，所來到的地方是個看起來有點破敗的城市——黑雲市，從海面吹來的風聞起來帶著臭泥的氣息，影響路過的心情。　　“這個地方工廠林立，可是怎麽看起來冷冷清清的”，小智看著這個城市不解的問。

　　“這裡叫做黑雲市，這裡以前因為到處是工廠，所以很繁華，但是也因為這個原因，天空和大海都受到汙染，又沒落起來了”，小霞為大家解釋道。

　　“看來不大可能有神奇寶貝存在了”，小智頹敗的想到。

　　“不會啊，由於這裡的汙染，臭泥和臭臭泥是這裡的代表性神奇寶貝，而且還有小磁怪、三合一磁怪”，小霞想著這裡應有的神奇寶貝對小智說道。

　　“居然還有這麽多的神奇寶貝，好，讓我來收服他們吧”，小智聽到小霞的話後立刻高興的說，這樣自己又可以收服新的神奇寶貝了。

　　“小智，皮卡丘的情況好像不太對啊”，這時小剛發現皮卡丘好像有點不太正常，所以說道。

　　“啊，皮卡丘，你怎麽了”，小智聽了小剛的話後看著皮卡丘，而這時皮卡丘也搖搖晃晃的，小智立刻擔心的說道，並且抱向皮卡丘，“啊啊————”，可是皮卡丘馬上就放出電來，把小智給電到了。

　　“小智，我們還是趕緊去神奇寶貝中心吧”，雖然小霞有各種藥劑，但是那些只是恢復體力和異常狀態的，而生病這些藥顯然是沒有什麽用，所以小霞也擔心的說道了。

　　“嗯”，隨後三人組就向神奇寶貝中心跑去，只是他們沒發現的是有一隻小磁怪在後面關注著他們。

　　“有人在嗎?有沒有人在啊”，一路奔跑到神奇寶貝中心後，小智立刻按響急診鈴並問道。

　　“啊~，真受不了”，這時打著哈欠的喬伊出來了，不過是沒精打采的樣子，“你不知道現在幾點鍾嗎?普通好孩子這個時候都已經睡覺了”，喬伊小姐繼續說道。

　　“對不起啊”，小智也知道現在挺晚的，所以不好意思的說道。

　　“喬伊小姐，先看看皮卡丘吧”，這時小霞搶著說道，她實在是很擔心皮卡丘，這麽久的旅行，皮卡丘已經融入到自己的感情深處去了。

　　“是啊，我的皮卡丘的情況有點不對”，小智這個時候也立刻說道。

　　“啊~啊~，大概是感冒吧”，喬伊小姐繼續打著哈欠的說道，根本就沒有給皮卡丘檢查就直接下了定論。

　　“你仔細的看看呀，它是我最重要的夥伴，你的姐姐們都很照顧神奇寶貝耶”，看到喬伊小姐這麽的漫不經心，小智再次的發飆了，對著喬伊小姐喊道。

　　“啊~啊~，不要急，不要急”，喬伊小姐再次打著哈欠對小智說道，“你看皮卡丘的雙頰有放電出來呢，這個是電氣老鼠感冒的初期症狀，只要讓它在這裡待一個晚上很快就可以治好了”，隨後喬伊小姐指著皮卡丘對小智說道。

　　“我說……我想要說的是，有人跟我說你是眾姐妹中最怪的一個”，小智又對喬伊小姐說道，而小霞這時也發現小剛居然這次沒有犯花癡，難道是因為這個原因，看來小剛不是對所有的美女大姐都有興趣的。

　　“不對，他們才是奇怪的呢”，喬伊小姐聽了小智的話後笑著說道，小智和小霞、小剛頓時無語。

　　“怎麽回事?”可是就在小智剛把皮卡丘遞給喬伊小姐的時候，突然間燈熄掉了。

　　“好像是停電了”，小剛則是說道。

　　“這些是治療中的神奇寶貝，

電力如果在不快點恢復的話，它們就有危險了”，小智他們跟著喬伊小姐到了裡屋後，喬伊小姐看著許多的神奇寶貝擔心的說道。　　“這裡的發電廠在什麽地方?”小霞知道現在事情緊急，所以立刻問道。

　　“發電廠?”小智聽了小霞的問話，立刻重複的說道，有點稍微的不解。

　　“小智，停電的問題是出在發電廠，小霞說的沒錯”，小剛給小智解釋說道。

　　“就是那個有大煙囪的工廠”，喬伊小姐通過窗戶指著一座又高大煙囪的工廠說道。

　　“好，我們走”，小智這時也知道要馬上去，不然神奇寶貝就又問題了，所以立刻說道。

　　“皮~卡~丘——”，可是就在小智他們要走的時候，在喬伊小姐懷裡的皮卡丘突然叫了起來。

　　“皮卡丘，你要呆在醫院裡好好休息啊”，小智則是看著皮卡丘說道。

　　“皮卡~”，可是皮卡丘卻搖著頭叫道。

　　“這是怎麽回事啊”，小智看到皮卡丘這個樣子非常的不解。

　　“小智，皮卡丘可能是以為我們會把它遺棄在醫院裡了”，小霞對小智回答說。

　　“皮卡~”，皮卡丘聽了小霞的話，點著頭叫道。

　　“好，我知道了，你可以跟上來，不過你現在生病，可不能勉強自己”，小智沒有辦法，雖然想要皮卡丘休息，但還是讓皮卡丘跟著來了，說完就從喬伊小姐那裡接過了皮卡丘。

　　“這裡是發電廠”，經過一路奔跑，小智等人終於到了發電廠。

　　“有人在嗎?有沒有人在裡面啊?如果沒人在的話，我們就要進去了”，打開門後，看到黑漆漆空蕩蕩的屋子，小智就大聲的喊道，可是卻沒有人回應，便向裡繼續行走。

　　“我猜這裡應該是有員工在某個地方管理的吧”，小剛邊走邊說道。

　　“那個地方是中央控制室”，小霞則是在看完牆上的地圖後指著前方的房間說道。

　　“好像有東西跟著我們”，走在去往中央控制室的走廊上，小剛突然對小智和小霞說道。

　　“沒有東西啊，是不是你過敏啊”，而小智在四處看了看之後發現沒有什麽東西，於是對小剛說道。

　　“可是我真的感覺有東西跟著我們啊”，小剛則是堅信自己的想法。

　　“皮卡丘——”，這時皮卡丘也突然的叫了起來。

　　“怎麽了皮卡丘”，小智知道皮卡丘在生病，所以立刻擔心的問道。

　　“啊，那是什麽”，可是就在小智看向皮卡丘的時候，突然發現皮卡丘的後面有一個黑黑的影子，而且還有一個圓點發著藍光，小智立刻害怕的靠到了牆上，而小剛也是。

　　“那是小磁怪，電系和鋼系雙系的神奇寶貝，有什麽好怕的，之前還說要收服神奇寶貝呢，現在就怕成這個樣子了”，小霞看著露出真面目的小磁怪，對小智說道。

　　“原來是小磁怪啊，可是它來幹什麽啊”，小剛這時也看出是小磁怪，所以鎮靜下來說道，不過對於小磁怪出現在這裡，小剛很是不解。

　　“那是因為皮卡丘現在處於放電狀態，這隻小磁怪的特性應該是磁力，所以才會被皮卡丘所吸引”，小霞猜測著對小智他們解釋說。

　　“原來是這樣，好，就由我來收服吧”，小智在知道了原委後，就打算收服，“小火龍，決定是你了”，小智這次派出的是小火龍，而且火系克制鋼系。

　　“小火龍，使用噴射火焰”，小智上來就讓小火龍使用了火系的絕招，而小磁怪還在對皮卡丘感興趣，所以噴射火焰準確的命中了，效果拔群，小磁怪受傷很重，不過這也使小磁怪發現了對手，然後就聽到小磁怪發出刺耳的聲音。

　　“小智，這是音爆”，小霞看到小智和小火龍在噪音下支撐著，於是提醒道。

　　“小火龍，堅持住，衝上去，使用火箭頭槌”，小智知道要趕快攻擊，不然會陷入苦戰，所以讓小火龍繼續攻擊，而小火龍也很爭氣，在噪音下撞向小磁怪，再次的命中了，小磁怪本來中了一發效果拔群的噴射火焰就已經露出疲態，在中了一招，支持不住了，向地上墜來。

　　“去吧，神奇寶貝球”，而小智也在這個時候扔出了寶貝球，小磁怪應聲進入了寶貝球，寶貝球開始紅燈閃爍，然後就在小智的期待中，“噔”燈滅了，小智收服了小磁怪。

　　“我收服小磁怪了”，小智高興的拿起小磁怪的寶貝球，然後寶貝球就被傳送了出去。

　　“好了，趕快走吧，神奇寶貝中心的神奇寶貝們還等著我們呢”，小霞看到小智收服新的神奇寶貝也很高興，不過想到生病的神奇寶貝還在等著，於是就立刻說道。

　　“你們有沒有聞到什麽臭味啊”，而就在這時小剛突然捂著鼻子對小智和小霞說道。

　　“好像有耶”，小智和小霞這時也聞到了。

　　然後就聽到後面‘砰’的一聲，天花板上的通風窗欄杆掉了下來，然後就出來了好多的神奇寶貝。

　　“臭死了，就是他們”，小剛看著這些神奇寶貝說道。

　　“這些是臭泥，是毒系的神奇寶貝，這些臭泥的臭味這麽醜，應該是惡臭特性”，小霞也捂著鼻子對小智他們說道。

　　“嗚啊~”，而這時隨著越來越多的臭泥的出現，一隻比臭泥大的神奇寶貝出現了。

　　“啊，這麽大，是臭泥的老大嗎”，對於成群神奇寶貝恐懼症的小智看到後立刻說道。

　　“那是臭臭泥，是臭泥的進化型”，小霞也看到了臭臭泥，於是繼續說道。

　　“我們快點逃吧”，小智聽完小霞的話後，就想要逃跑。

　　“小智，一味的逃跑是解決不了問題的，臭泥也和臭臭泥大量的出現在這裡，看來這次發電廠的停電應該就是他們造成的，只有打敗了他們才能是電力恢復啊”，小霞看到小智又想要逃跑，為了使小智堅強起來，以後面對各種困難，於是對小智說道。

　　“好，我知道了”，小智覺得自己要努力了，不能讓小霞看不起，“妙蛙種子、小火龍、傑尼龜、3D龍，出來吧”，然後小智就派出了神奇寶貝，“妙蛙種子，飛葉快刀;小火龍，噴射火焰;傑尼龜，水槍;3D龍，幻象術”，然後就讓神奇寶貝出招了，“皮卡丘，你現在生病了，就不要勉強自己了”，然後小智看到皮卡丘也想要攻擊，但是皮卡丘在生病，於是就想要皮卡丘休息。

　　“皮卡~”，可是皮卡丘看到其他的同伴在努力著，所以也要加入戰鬥。

　　“小智，讓皮卡丘戰鬥吧，皮卡丘這次好像不是感冒，小磁怪對它感興趣，應該是皮卡丘吸收電力過多，而電磁鐵化了，讓皮卡丘釋放出多余的電力，應該就會恢復了”，小霞這時通過小磁怪跟著皮卡丘而推斷出是皮卡丘的電力過多，所以就對小智說道。

　　“是這樣啊，好，皮卡丘，十萬伏特”，得到小霞的回答後，小智很有氣勢的對皮卡丘說道，而後皮卡丘就使用了十萬伏特。

　　“這些臭泥，是不是太多了啊，雖然小智的神奇寶貝很努力，可是這樣下去不行啊”，小剛這時發現情況，於是對小霞說道。

　　“小剛，讓差不多娃娃幫一下忙吧”，小霞這時看到了小剛懷裡的差不多娃娃，突然想到了什麽，於是對小剛說道。

　　“可是它才剛出生不久，還不能戰鬥啊”，小剛看著在懷裡撒嬌的差不多娃娃對小霞不解的說道。

　　“它現在應該可以使用幫助絕招的，讓它對皮卡丘使用幫助就可以了，這樣會使皮卡丘的攻擊威力提升的，也會使皮卡丘盡快的排出大量的電力”，小霞一邊逗弄著差不多娃娃一邊對小剛說道，而且這樣差不多娃娃也會得到經驗，快速的成長，對以後的旅行會幫助更大的。

　　“還有幫助絕招啊，好，差不多娃娃，對皮卡丘使用幫助”，小剛隨後把差不多娃娃抱到皮卡丘的身邊，並且說道。

　　“塔布~”，差不多娃娃然後就把小手靠在了皮卡丘的身上，隨著一聲叫聲，就看到皮卡丘的身體周圍出現了黃色的光暈，而皮卡丘的十萬伏特也立刻就變得越來越粗，一下就覆蓋了所有的臭泥，大量的電力也隨著一起釋放了出來，臭泥被打敗了，全都跑掉了。

　　“好……好厲害啊”，看到皮卡丘的技能的威力後，小智在一旁呆呆的說道。

　　“小智回神了，燈亮了，電來了，事情解決了”，小霞看著小智的樣子笑著對小智說道。

　　“差不多娃娃的絕招好厲害啊”，而小剛則是把差不多娃娃抱起來高興的說道。

　　“事情終於解決了”，小智這時想到神奇寶貝中心的神奇寶貝沒事了，非常高興的說道。

　　“事情好像還沒有結束，這隻臭臭泥還沒有走呢”，小霞打斷了小智的高興說道。

　　“皮卡丘，使用十萬伏特”，小智這時也來了氣勢，對皮卡丘說道。

　　“皮卡~丘——”，然後黃色的電流打中了臭臭泥。

　　“去吧，寶貝球”，然後小智把寶貝球扔了出去，成功的收服了臭臭泥，而後臭臭泥也被傳送了回去。

　　“太好了， 我收服臭臭泥了”，小智再次收服了新的神奇寶貝，非常的高興。

　　“好了，皮卡丘也恢復了，我們可以回神奇寶貝中心了”，這下事情終於解決了，小霞高興的說道。

　　“皮卡丘，你真的好了”，小智這下也發現皮卡丘沒有那些症狀了，非常的高興。

　　不過事情真的結束了嗎?“…………(火箭隊經典台詞)”，就在小智他們走出發電廠後，火箭隊的暴鯉龍潛水艇登場了，而且上面還有一塊巨大的磁鐵。

　　“是火箭隊”，看到火箭隊，小智立刻說道。

　　“不過他們這塊磁鐵是要幹什麽啊?”小剛也看到了磁鐵於是說道。

　　“應該是想要趁著皮卡丘電磁鐵化的時候用磁鐵吸過去吧”，小霞則是看著已經開始發動的磁鐵說道，不過皮卡丘沒有被吸過去，而是大量的小磁怪和三和一磁怪被吸了，“好討厭的感覺啊”，火箭隊又快速的退場了，被重重的壓入了臭水裡。

　　“臭泥的大量出現就是環境被汙染嚴重造成的，所以以後的環境就靠你們了”，天亮後，回到神奇寶貝中心，小霞對喬伊小姐和趕來的君莎小姐說道。

　　“真是慚愧，我以後一定會和大家把環境早點恢復美麗的”，君莎小姐保證的說道。

　　“謝謝你們，都是托你們的福，神奇寶貝才能恢復健康的，我以後也會好好的照顧神奇寶貝的”，而後喬伊小姐也說道。

　　“哪裡哪裡……，我們要繼續旅行了，那再見了”，隨後告別了喬伊和君莎小姐，小智和小霞、小剛再次踏上了旅途。