再說清廷江浙一帶的最高統帥康親王傑書，在八月底收到了南京失陷的消息，經過與手下眾將商議，決定立刻揮兵北上奪回南京。此時在仙霞嶺和泰順等浙南一帶，集結了近十二萬清軍，為了馳援北線，傑書下令由平南將軍賴塔坐鎮衢州，總領南線軍事，拉哈達、穆赫林等將為輔佐，帶領八萬清兵駐防仙霞嶺、泰順、衢州等浙南要地，抵禦明軍;自己將率領四萬精兵，回師杭嘉湖地區，北上反擊明軍，力圖盡快奪回南京。

　　就在傑書出發前夜，其手下一名謀士給他進諫說道，如果他此時領軍北上作戰，則江浙的清兵實際上就陷入了南北兩線作戰的囧地，短期內恐怕難以扭轉戰局，而賴以維系的後方區域則僅有一省之敵，恐怕很難支撐長久;另外如果明軍先行奪佔皖南，進而依仗水師之利逆水而上進入江西，則整個江南的清兵都有被對手斬斷退路的危險，到時候整個江南的三十多萬清兵，都可能因為缺乏後勤保障，而被明軍圍攻蠶食消滅的可能。

　　聽了這個判斷，傑書十分震驚，越想越覺得其中的可能性很高，不由十分猶豫。其實深知明軍戰力的傑書，對於此次北上的反攻行動，面對沐劍聲這等名將，他也基本不報什麽獲勝的希望。可是在眼下這種不利的局勢下，作為清廷重臣，他必須這麽做才行，所謂明知不可為而為之，就是他現在的真實寫照。如果他坐視南京的陷落而沒有大動作，難免引起皇上的不滿，想必很快就會被革職問罪，所以哪怕就是洞察了對手的企圖，也必須望火坑裡跳。

　　不過傑書也不是完全坐以待斃之人，他隨後就修書一封，和江西的喇布、武昌的嶽樂進行溝通，會商後續行動計劃，指出了這個隱患，提議如果三人能夠達成一致意見，就有望改變這種困局。安頓好退路，傑書於八月底帶兵離開衢州，朝北線轉進，由於江浙地形崎嶇，山路蜿蜒，最終經過五天的急行軍，前鋒部隊就返回杭州。

　　這時候李之芳的求援書信也到了，在和守城的杭州將軍圖喇會商之後，傑書派出了一支偏師，前往太湖西岸的長興一帶駐防，防止明軍從太湖西岸進行突襲。另外，此前清兵有一支草台水師駐扎在太湖附近，不過隨著明軍水師分隊南下，之後雙方幾次交手，清兵水師完全處於下風，此後基本損失殆盡，最後勉強剩余了十幾破船，只能竄進太湖蘆蕩裡面藏身。消滅了對手之後，明軍水師完全控制了太湖北面和附近各處的湖河水面及運河航道，而無錫城也屢次受到攻擊，清兵只能嚴防死守城防，這樣一來，清兵只能沿太湖偏南一線布防，以免被明軍水師突襲。

　　傑書在杭州停留了三天，才收攏齊後續兵馬，加上調集附近各地的兵馬隨後北上，這樣總共經過了半個多月時間，傑書帶領了四萬多精銳抵達無錫城，接過了前線的指揮大權。這樣經過一番調整之後，蘇南的清兵總數達到七萬多人，去掉巡防各地和偏師，還有六萬人匯集在無錫大營，兵力幾乎是對面明軍的兩倍。

　　於是傑書下令出城，與明軍正面對決。劉進忠不愧是善守之人，眼見清兵勢大，於是全力防護，經過幾次交手之後，雙方都沒有得到明確的戰果。隨後明軍暫時退卻戚墅堰一線，依靠水師的援助，試圖依托河防，擋住了清兵的腳步。

　　雙方此後在附近一線展開多次交手，盡管傑書手下悍將不少，清兵數量上佔據優勢，不過明軍沿附近運河進行死守，水師的火力優勢作用很明顯，

使得清兵屢次進攻都沒有什麽效果，最後累計付出了數千人馬，也無法形成突破。　　再到後來，還是在沐劍聲的命令下，明軍為了加長對方的補給線，試圖分散敵方兵力，為後續反擊製造機會，於是進行了暫時的退卻，退回到了常州，然後借助已經完備的防禦工事進行防守。

　　眼見明軍退卻，傑書自然緊逼，隨後進抵常州附近扎營，並對常州發起進攻。然而此時常州城早已經是森嚴壁壘，壕塹眾多，河溝縱橫，明軍借助各種工事，再加上水師艦艇的火力支援，給進攻的清兵以很大的殺傷。而且明軍大將劉進忠，更是一名擅長守城的將軍，如今有了威力巨大的火器，他更加從容自如，在經過連續三天持續高強度的進攻後，清兵死傷過萬人，卻只是突破了明軍外圍的兩道防線，距離常州城牆還遙遙無期。在這種局面下，為了保存僅有的兵力，傑書隻好下令暫緩進攻，前線的戰事暫時停頓下來。

　　此後為了打開局面，傑書改變招數，隨後派人暗中來面見明軍統兵大將劉進忠，獻上厚禮，而且許以高官厚祿，妄圖將對方策反。不過劉進忠此人，素來就有反清之志，而今更得沐劍聲看重，得以獨領幾萬大軍，正在得意之時，豈會臨陣反水，所以傑書的策略完全落空。

　　見此計不成，傑書又派人潛入常州，妄圖聯絡一些地方奸細，尋機裡應外合，可惜明軍的政策十分惠民，而且軍紀很好，因此甚得當地民心，所以他們還沒有聯絡到合適的人選時，反而被人將這些人的行蹤匯報給明軍，隨後這些內線大多被抓，讓傑書的意圖完全流產。

　　就在傑書帶兵返回蘇南時，江西的喇布在得知南京陷落，不久後蕪湖也陷落的消息，連忙傳下軍令，調兵遣將準備反擊，一路是駐守景德鎮的原雲貴提督周有德及麾下兩萬軍馬，他們領命後即刻北上彭澤，沿江而下增援池州，另一路則是駐防九江的尚善貝勒，帶領一萬精兵東下支援池州，力爭擊敗明軍的西征部隊，反攻南京。

　　八月底時，這兩路清兵搶在明軍西征部隊到來之前抵達池州，與駐守這裡的萬余人馬和五千安慶府援軍匯合，從而集結起了一支近五萬人的大軍，然後以貝勒尚善為主將，提督周有德為輔助，帶兵出城向東進發，欲圖反擊南京。

　　不久之後，這支清兵就與西征的明軍在銅陵附近遭遇，經過幾次接戰後，雙方各有損傷。雖然明軍人數佔優，但是大多是農夫，戰力有限，若不是有水師進行炮火支援，再加上中軍主力是訓練有素的火槍隊，幾次於危難關頭大顯身手力挽狂瀾，抵擋住清兵的攻勢，扳回敗局，恐怕這支大軍早就戰敗潰逃了。

　　眼看對手十分強悍，戰事趨於不利，於是明軍就退到獅子山一線，依托地勢進行固守，隨後兩家沿獅子山一帶扎營駐守，屢次交手之後互有勝負，然而卻都無法改變這種對此局面，戰局轉為相持階段起。這種局勢自然對明軍稍稍有利，因為只要守住戰線，那麽在水師的運輸下，明軍的實力自然會不斷得到加強，直到完全佔據優勢。

　　在這個時候，大周一方因為吳三桂依舊臥病在床，難以指揮作戰，他在得知明軍攻陷南京的消息之後， 連聲嗟歎良機錯失，恨不得立刻起身揮軍北上，攻城略地。只是他的身體此時已經病入膏肓，隻好小打小鬧的打打擦邊球，下達了幾個小規模騷擾的軍令，對於清兵的牽扯力度很有限，於是讓對手順利完成了一系列的調兵之舉。

　　吳三桂為何不放權給手下呢?就是因為他的身體已經很不好了，而派往大雪山去求取治病良藥的人遲遲沒有返回，加之他臥床日久，這時軍隊內部人心浮動，已經開始出現一些不穩定的跡象。如果在這時候放權給部屬，進行一些大規模的軍事行動，那就與自殺無異，誰知道這些丘八們心裡打什麽主意，萬一有人心懷不軌，暗結清兵搞些破壞，豈不是可以渾水摸魚?所以吳三桂才基本按兵不動，下令全軍戒嚴死守，又為了預防意外，暗中已經派人前往廣西，急調皇太孫吳世璠前來長沙，準備自己的身後之事。由於吳三桂的保守措施，加上清兵急於反攻南京，這樣以來，江南的西線戰局進入一個相對平穩的態勢，幾處戰線雖然交錯蜿蜒，戰場局勢更加複雜難料。

　　而就在這種局面下，康熙的聖旨也傳達到江南清兵各營，得到了他的命令，前線各將領就安心許多，而傳旨太監一看前線戰事也已經穩定下來，急忙回京複命，想著把這個消息帶回，讓康熙早日安心。

　　九月中旬，遠在北方溫都爾汗前線的平遠大將軍巴泰，接到京師傳來的加急命令，說是南京陷落，急調他和周培公回京面聖，巴泰大驚失色，連忙把周培公請來，詢問該如何應對才好。