永祿三年，二月六日。就當朝定準備派遣使者前去會津調遣會津諸將前去越中之時，大熊朝秀倒是傳來了一個好消息——宇佐美定滿能夠僅憑能登半國之力將長連龍等作亂的舊匠作畠山家家臣剿滅，暫時不需要主家的支援。

　　宇佐美定滿先是在永祿二年十月先後於免田、志雄兩地將前來進犯能登的加賀一向宗軍勢擊退，成功解救被困的唐人親廣。隨後，宇佐美定滿又親自率五千軍勢北上大津，並且在此地布下了本陣。

　　由於宇佐美定滿是直接大張旗鼓的率軍北上，故而對富木城、西谷內城兩地進行襲擾的譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等地頭武士也很快得知了宇佐美定滿率軍北上的消息。他們自知不敵便立即解除了對富木城和西谷內城兩地的包圍，並且率軍火速退至西谷內城北部的支城越渡城去，意圖與是清館周邊的地頭武士阿岸掃部、阿岸五郎等人合流。

　　西谷內城城主神保覺廣見譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等人撤軍後並未作出追擊，僅僅只是出兵將自己領內的支城兵砦如木尾嶽城(木尾城)、町屋砦、根尾禦前山砦、桝形山砦等地奪回，並且做好本領的防禦。宇佐美定滿見神保覺廣做得中規中矩後也不多說什麽，很快便火速北上，準備與自己的次子宇佐美勝行合兵一處將是清館周邊作亂的舊匠作畠山家家臣剿滅。

　　由於事先舊匠作畠山家家臣阿岸掃部、阿岸五郎等人準備充足，所以他們在舉兵的短時間內便將是清館西南方的兩座支城馬場城和大泊城奪取，並且通過大泊的海港得到了不少加賀一向宗運來的軍械物資。

　　為了切斷能登一揆眾與加賀一向宗的海路聯系，宇佐美定滿只能先對固守在馬場城和大泊城的一揆眾發起攻擊。而退至越渡城的譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等一揆眾，宇佐美定滿則是令才奪回失地的神保覺廣負責牽製越渡城的一揆眾。

　　在岩倉寺城城主野呂彌左衛門的牽製下，使得之前倒向一揆眾的南志見城城主南志見光連無法對能登一揆眾進行有力的支援，反而被天堂城城主小島職鎮和野呂彌左衛門二人聯合起來率軍包圍了南志見城。

　　與此同時，率浪人、郎黨奪取穴水城舊領的長連龍見眼下局勢愈發不利起來後，隨即做出了攻打守備空虛的天堂城的決策。

　　然而，長連龍還是低估了宇佐美定滿。雖然奧能登的國人一揆一度波及到整個能登國，但是各重鎮大部分卻依舊在上杉軍的掌控之下。就在長連龍迅速率軍奪取天堂城東南方的支城渡合城同時，甲山城城主畠山將監便迅速率軍五百將穴水城東部的兵砦比良攻落，並且在穴水城周邊的村落放火。

　　二月九日，長連龍獲知自己的本據穴水城即將不保的消息後，火速與譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等人合兵一處後，並且迅速率軍兩千余回師穴水城，在比良原將畠山將監的先陣軍勢擊潰，討死畠山將監部百余人。畠山將監被迫退回自己的居城甲山城。

　　二月十一日，宇佐美定滿趁著長連龍率軍救援穴水城的同時立即率軍前往是清館，打算趁著這個機會將阿岸掃部、阿岸五郎等人一揆眾殲滅，這樣便能將能登西部平定下來。之後，孤立無援的阿岸掃部、阿岸五郎等人被宇佐美定滿和宇佐美定勝等人在荒屋擊敗，

一揆眾自阿岸掃部、阿岸五郎等人以下共三百余人被上杉軍討取。　　就當阿岸掃部、阿岸五郎等人全軍覆沒的消息傳到穴水城後，長連龍開始如坐針氈起來。因為他此刻意識到若是不將能登的上杉軍主力擊敗或是將能登守護宇佐美定滿討取，那麽自己將會一直疲於奔命，毫無結果。隨後，長連龍便聚集四千一揆眾前往越渡城，意圖與宇佐美定滿決一死戰。

　　三天后，宇佐美定滿在與唐人親廣、神保覺廣、宇佐美定勝等將在門前合流之後才率軍六千南下至越渡原。而長連龍所率領的一揆軍則是白白耗費了三天的糧草，所攜帶的軍糧也所剩無幾了，根本無法與上杉軍展開持久作戰。

　　當宇佐美定滿打探到長連龍所率領的一揆眾糧草所剩無幾之後便在越渡原西安營扎寨，準備等到長連龍所部耗盡糧草後再發起攻擊。

　　就在兩軍相持三四天后，長連龍所部的一揆眾因為糧草耗盡而產生了動搖。在短時間內，長連龍所統轄的一揆眾便迅速非戰鬥減員，使得長連龍不得不做出率軍退往穴水城固守的決定。

　　然而宇佐美定滿等待這個機會很久了，隨即下令神保覺廣、唐人親廣二人為先陣火速率軍追擊長連龍所部。而宇佐美定勝則是被宇佐美定滿命令率軍一千火速前往穴水城下，務必要趕在長連龍所部之前抵達穴水城，並且將穴水城攻落。同時，急於洗刷比良之戰戰敗恥辱的畠山將監也積極配合宇佐美定滿的攻勢，迅速率水軍進入七尾灣將穴水城沿海一帶封鎖起來。

　　由於糧草耗盡，長連龍所率領的一揆眾士氣低下，還遭到了上杉軍的追擊，行軍速度越來越慢。就連長連龍本人都親自斷後都無法擺脫上杉軍的追擊。

　　二月十三日，長連龍與譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等人率殘部百余人抵達穴水城時，望見城牆邊到處樹立著上杉家的竹雀紋旗後吃驚的連手中的太刀都掉在了地上。就連七尾灣中還停泊著數艘小早，船上也都豎著竹雀紋旗。

　　“看來是上天要讓匠作畠山家和長氏滅亡啊！”長連龍癱坐在地上，他此刻已經輸掉了一切，就連後路也都被宇佐美定滿斷了。

　　“就算我等得到織田家、加賀一向宗、武田家等勢力的援助還是無法與宇佐美駿河守匹敵啊！”國分左兵衛歎了一口氣後說道。

　　“我等僅剩殘兵百余人，如何與嚴正以待的上杉軍一戰?！”國分五郎兵衛先是看了看身旁的部下後無奈的說道。

　　“就算我等能夠逃出生天再次得到周邊大名的援助，依舊無法奪回我等的舊領，更別說光複匠作畠山家了，還是以我切腹為代價換取你們的活路吧。”長連龍已經絕望了， 他清楚自己不是宇佐美定滿的對手，如今的上杉家還沒集中力量來對付自己就已經兵敗如山倒，更別說謙信率大軍前來了。

　　“九郎左衛門殿，您為何如此?！我等還能拚死突圍啊！”浦野孫右衛門不甘心的說道。

　　“也許匠作畠山家和長氏是命中注定要亡於上杉家之手······”長連龍說完便抽出自己的肋差準備切腹了。

　　“你等還是放下武器向上杉軍投降吧，我隨九郎左衛門殿一同切腹。”浦野孫右衛門準備殉死。

　　“孫右衛門，到了那裡我們也好有個照應。”長連龍也不反對浦野孫右衛門切腹，說完他就緊握肋差朝著自己的腹部刺去。

　　在長連龍切腹自盡之後，先後有浦野孫右衛門、田邊七郎左衛門、小林十郎左衛門、上野甚七郎等長氏家臣為其殉死。而譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等人則是率部向上杉軍投降。不過，宇佐美定滿隨後便下令將譽田彈正、譽田勘解由左衛門尉、國分五郎兵衛、國分左兵衛等人斬首示眾，其一揆眾殘兵則是放歸故裡不做追究。

　　一揆眾主力在越渡、穴水等地被殲滅後，南志見光連見形勢不利於自己後向宇佐美定滿請降。但是，宇佐美定滿不再信任這個反覆無常的小人，直接令小島職鎮、野呂彌左衛門、長連龍等奧能登諸將將其攻滅。

　　至此，近半年的能登國人一揆被平定下來，長氏一族徹底被滅，奧能登大量有力豪族和地頭武士遭到毀滅打擊。宇佐美定滿在能登的統治便穩若磐石了。