洪承疇來到永寧後，他先拜見了巡撫朱燮元，宣了皇帝密旨，然後與秦良玉和魯欽交換了意見，借了部分白杆兵和近衛軍後，就開始乾活了。

　　他先將關押著的土司及頭目們進行甄別，大家相互檢舉揭發，然後把被迫加入叛亂的集中在一起，明確告訴他們，如果想回家，就要讓家中出錢來贖罪。當然，根據加入叛軍時間長短和造孽的多少，出的贖金數目當然也是不同的。

　　至於主動投誠或者與官軍暗通款曲的土司或頭目，則給予嘉獎，也是根據投誠的時間來論功行賞。最後的那些死硬分子，則宣布於明日午時，一起斬首示眾，並要求所有土司及頭目必須要在現場觀看。

　　這一天在永寧最寬大的街道上，搭起了一個大台子，台子周圍站立著幾十個近衛軍步兵，火銃都上好了子彈，而台子旁邊的房間裡和街道兩頭更是布滿了步兵，以防有人借機生事。

　　午時三刻到，洪承疇先宣讀聖旨:“皇帝詔曰:永寧宣撫司奢賊崇明，不思皇恩，妄殺天朝官吏，攻佔重慶，對抗天兵。爾等助紂為虐，辱我邊民，殺我邊兵。普天之下，莫非王土，特諭各地軍民，凡有參與奢賊造反者，皆斬其首，夷其三族，抄其家產。欽此。”

　　殺氣騰騰的聖旨宣完後，洪承疇下令開斬，每一次提上台二十個人，劊子手手起刀落，一顆顆頭顱飛上天空，然後落在木板上，滾了幾下後，終於靜止不動，那張開到極致的雙目，似乎在言說自己的悔恨或者不甘。

　　二十人殺完再換二十個人上來。一千多人一共殺了快兩個時辰，換了幾茬劊子手才殺完。濃烈的血腥味充斥在街道上，台子旁邊觀禮的土司們看得面色慘白，有些人屎尿齊流，更有人被嚇得暈了過去。連一直主張殺人的魯欽都不忍再看下去，只有洪承疇面色如常，還有滋有味地品著當地的香茗。等人殺完後，他陰沉著臉看著眾土司道:“爾等當引以為戒。”說完轉身離去。

　　幾天后，洪承疇查明了大明官吏們盤剝土司土兵情況，他多年在刑部任職，這種事對他來說不要太簡單，然後根據官吏行為的程度，分別給予斬首，下獄，抄家等不同的懲罰。依舊是在前幾天的大台子上，殺了一批官吏，那些陪殺的官吏表現得比土司更為不堪，幾乎是個個失禁。而那些旁觀的土民則是大聲叫好。

　　然後由朱燮元宣旨:廢除永寧宣撫司，永寧地方設立道府治理，任命洪承疇為永寧知府。這兩場殺戮，第一場將土人嚇住，第二場則出了土人心中的一口氣，使得永寧的人心迅速地安定了下來，朱燮元再派出流官的過程就很順利了。相信在洪承疇的血腥手段下，流官們應該也是不大敢再激怒土民的了，而大量土司及頭目被殺，不但使土民組織不起來，也使得當地人談知府色變，一動也不敢亂動。

　　魯欽在給皇帝的奏折中，大大將洪承疇讚揚了一番，其中有一句話是這樣寫的:“臣以為論到殺伐果斷，唯有孫傳庭可與之相比。”朱由校看了後，將這句話念給近衛軍眾將聽，並嗤笑道:“不就是說他們兩個是屠夫嗎！魯欽說得自己好象很仁慈似的，他殺的人比孫洪兩人加起來都要多得多，戰場上殺人和刑場上殺人其實沒有區別，殺人只是手段，達到了目的就可以了，你們在戰場上以後要記住這一點，不要把手段當成了目的。”眾將都點頭稱是。

　　這時貴州的局勢急轉直下，貴州宣慰司同知安邦彥，水東土司宋萬化聯合貴州各地土司，

帶兵十萬，於二月圍住了貴陽。　　朱由校得到消息後，下旨讓貴州巡撫王三善前去解圍，並命秦良玉和魯欽周遇吉一起救援貴州。

　　秦良玉帶領六千白杆兵，加上近衛軍七千多人(連上輜重營)，浩浩蕩蕩地開往貴州。

　　不一日，大軍行至赤水衛，而這時候王三善還在沅州調集兵馬，向鎮遠而來。赤水衛的白撒所這時還被奢軍殘兵佔據，眾人商議之後，決定先拔掉這個釘子再往貴陽去，先把自己的後路清理乾淨。

　　白撒所位於一座山峰上， 三面全是懸崖，只有當面有一條小路通往峰頂，硬攻上去顯然很難，重要的是大炮拖不上去，死傷會很多，所以周遇吉先帶幾個懂夷話的白杆兵去勸降，不料白杆兵才開口，上面一陣箭雨就射了下來，幸虧周遇吉他們的甲好，所以只聽到箭射到甲上的聲音，倒是沒有人受傷。

　　奢軍見箭射不倒他們，就開始用石頭砸，幾個人狼狽不堪地退了回來。周遇吉恨聲道:”沒用，換第二套方案吧。“

　　周遇吉點了一個司的步兵向上走去，到了石頭可以砸到的地方停了下來，排成兩排，開始用燧發火銃對著牆頭射擊，先倒是打倒了幾個奢兵，後來奢兵學乖了，都躲在城牆後面，抽冷子射幾箭，當然一般都射不到步兵身上。

　　於是兩邊就開始了無聊的射擊遊戲，周遇吉不停地換人上來，看樣子是想用火銃將此地攻下，城牆內不斷地響起嘲笑聲。

　　兩方僵持快一個小時後，峰頂突然冒出大量濃煙，步兵們齊聲歡呼，而奢兵不明所以，往後看才知道後院起火了，想往上趕吧，這裡又不敢放棄，不往上趕吧，家人又在上面，不過很快他們的猶豫就沒有必要的，因為大量的白杆兵從上面開始往下衝。周遇吉這次來皇帝讓他帶了鐵鱗甲三千具，賞給了白杆兵，白杆兵穿上了鐵鱗甲，那可真的是如虎添翼，又是從上往下殺，所以很快將奢兵殺得四處逃散。

　　一起只有這麽大的地方，又能逃到哪裡去呢?所以大量的奢軍隻好跪地請降，很快白杆兵殺到城牆，將門打開，近衛軍進去後，已經看不到抵抗的奢軍了。