O5議會:

　　SCP基金會的最高掌控者是O5議會。

　　O5議會是13名擁有最高掌控權的人員組成。所有O5議會成員的身份都是機密。所有議會員的稱呼全部都是數字代號，從O5–1到O5–13。每位O5議會的成員都近乎知道基金會的一切，及其所有活動。所有人加起來，他們知道基金會掌握的每個秘密。基金會的大部分人員，在整個職業生涯都不會見到他們。二級以下的人員甚至不知道他們存在。基金會外的人都沒聽聞過他們，或者不覺得他們真實存在。基本所有人都害怕他們。當一個O5走進房間，所有人都要嚇N。如果你掌握了世界史上，最可怕組織的頂級QL，情況就是如此。O5議會有自己的機動特遣隊“紅右手”，他們既是基金會研究員的好朋友又像是中世紀的審判廳，會讓O5們討厭的人消失。O5們很少乾預基金會的日常運作或是對scp的收容，他們一般隻關注Keter級的項目而實際上只會微處理Thaumiel級的項目。有些報告稱O5們會定期交換編號，可能是臨時也可能是某種制度。他們平凡的使用替身以及其他安保手段，還有假情報技術。還有報告稱至少一個O5要全天待在太空上，而這些報告或許都是虛假的。

　　MTF(機動特遣隊):

　　基金會的最高戰力是MTF(機動特遣隊)。

　　機動特遣隊是基金會除了設施保安力量之外，主要的戰鬥力量。同時也是其機動作戰力量，和主要的外部行動執行力量。因此，機動特遣隊完全都是由訓練有素且擁有特殊技能的特工組成。甚至基金會會抽調一些人型的scp加入機動特遣隊，以增強機動特遣隊的力量。比如scp-076(亞伯)帶領的“潘多拉之盒”，scp-2639(電子遊戲暴力)組建的“洗刷者”等。機動特遣隊一般被基金會的特遣隊主管，認為在有需要的時候提議組建。通常需要一名或者多名O5議員成員的直接批準。機動特遣隊的規模構成和目標各不相同，比如:Alpha-1紅右手是O5議會直屬，通常負責清除O5議會認為不穩定的因素。Nu-7落錘營集單位，按美軍編制有兩千人，常規部隊中規模最大。-九尾狐，負責基金會各個站點的安保，是基金會最強的守護者。Lambda-5白兔，專門對抗時空間異常的專家小隊，有能力收容可以操控時空間的異常。等等……