在天穹沉睡的這段時間裡，木葉發生了許多大事。　　木葉的人除了三代與四代外，並沒有多少人知道天穹修煉一事。因為天穹為了以防萬一，在木葉留下了一個十分之一實力的分身，以防不測。

　　首先是中忍考試，大蛇丸依然實行【木葉顛覆計劃】，但因為四代火影波風水門的幫助，大蛇丸重傷逃脫。然而，三代火影猿飛日斬卻因為年老體衰，在於大蛇丸對抗中重傷昏迷，正在木葉的重症監護室中。

　　考試結束後，大蛇丸一如既往地派人來抓回佐助。而天穹囑咐佐助，先在大蛇丸處學習三年，然後回來接他。佐助自然是聽話，裝作與木葉小強等人訣別的樣子，到了大蛇丸的音忍村。

　　值得一提的是，雛田在中忍考試中並沒有被寧次打成傷，而是被天穹的分身救下並用生命之力為其恢復——即使力量僅剩十分之一，也不是現在的寧次所能匹敵的。

　　之後，由於成績太差，波風鳴人被他老爸波風水門抓去緊急訓練螺旋丸。由於波風水門政務繁忙，所以修煉由水門的師傅，三忍之一自來也負責。自來也為了給三代治病，帶上鳴人去找自來也，和原著一樣遇上了大蛇丸。三忍混戰，結局也和原著一樣。綱手回到木葉，三代也蘇醒了過來。

　　此後，神秘組織【曉】漸漸浮出水面，傳言各國人柱力均被抓去。作為風影的一尾守鶴人柱力我愛羅亦被藝術家二人組帶走。

　　木葉組織了特遣隊前去救回風影。長門按照天穹的吩咐，用幻龍九封禁封印了一尾一半的查克拉，然後藝術二人組與木葉等人大戰，詳裝不敵而撤退，留下我愛羅。於是，給外界造成“成功救回我愛羅”的假象，也瞞過了阿飛。

　　隨後，鳴人與自來也進行了為期三年多的修行，期間木葉與曉又有多次的摩擦，但雙方都沒什麽實質性人員損失，佩恩也沒有再毀滅木葉，但鳴人依然學習了仙人模式。

　　然後，鳴人體內的九尾開始不老實，四代派出了天藏(即大和)幫助鳴人作控制九尾的訓練，但效果不大。

　　各忍村的人柱力相繼被抓，僅剩下九尾和八尾了。所以為了保護人柱力，鳴人和奇拉比碰頭，奇拉比在真實之瀑傳授鳴人控制尾獸的方法。同時，為了解決曉的問題，五大國忍村首領在鐵之國開了個會……

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　　鐵之國，夾在五大國之間的小國家。國內沒有忍者，只有武士。

　　一張大圓桌，坐著五位當今世界最頂尖的戰力。

　　正北方坐著火之國木葉的四代火影，波風水門。現在，水門帥氣的臉龐上滿是嚴肅。和他一起來的是他的師父自來也，以及回歸木葉的綱手。三個影級強者，木葉不愧為五忍村之首。

　　緊挨著水門坐在東北的是風之國砂隱村的五代風影，砂瀑我愛羅。濃濃的黑眼圈，面孔左上角的愛字依然清晰，但臉上早已沒了當年的神經質與殺戮，取而代之的是少有的沉穩。砂隱村是五大國中實力最差的一個，但因為與木葉的緊密關系，沒有人敢輕視這個後起之秀。與他同行的是斟九郎與手鞠。

　　西北角的是雷之國雲隱村的四代雷影艾。面孔黝黑而粗狂，體格強壯，也在彰顯著雷之國的強大與彪悍。與他同行的是奇拉比的弟子三人組:薩姆依，奧摩依和卡茹依。

　　西南角是水之國霧隱村的五代水影照美冥，

其妖嬈與成熟的風韻及其誘人，但認識她的人都知道，藏在這美豔外表下的，是絕對的實力。與她同行的是【霧隱七人眾】的長十郎與老牌上忍青。　　東南角則是土之國岩隱村的三代土影兩天秤大野木。這個矮小的大鼻子老頭經常會扭到腰，看起來年紀比三代火影還要大，但他的獨特忍術【塵遁】絕對是頂尖的破壞力。與之同行的是他的兒子兩天秤黃土和兩天秤黑土。

　　五影會談，五哥忍村互有恩怨，之前一共經歷了三次大戰，平日裡都是相對敵對的關系，現在為了對付【曉】而坐在一起，實屬不易。五人都在沉默，並觀察者其他人的臉。四代火影保持微笑但眼神銳利，五代風影面無表情，四代雷影面露不耐之色，手指不停地敲打桌面，五代水影臉上掛著嫵媚的笑，三代土影一臉嚴肅。

　　“嘭！”四代火影終於不耐煩了，狠狠捶了下桌面大聲嚷嚷:“要說話就快點說！磨磨唧唧算什麽！”

　　“雷影大人稍安勿躁。”水門輕聲說道，又把頭轉向另外三位:“既然雷影大人等不及了，那麽我們還是快點開始吧。大家認為，該如何對待【曉】?”

　　“當然是TMD滅了他們！”雷影大聲吼道，顯然十分憤怒，“大搖大擺進入我們村子，光明正大地抓捕人柱力，他們以為那是自己家?來了就想走?！”

　　“實行製裁是肯定的，不過老夫認為此事應謀定而後動。”兩天秤大野木撫了撫短小的胡須，沉聲說道。

　　“我曾被他們抓去，他們的實力如何我再清楚不過。”我愛羅開口，“當初來的是兩個叛忍——想必大家都知道，是砂隱叛忍蠍與岩隱叛忍迪達拉……兩個人每個都有著影級的實力……”

　　“而據可靠消息……”水門接上話頭，“曉組織一共有十人，個個在影級以上！”

　　會堂裡一陣沉默。十個影級，這是什麽概念?就算是五大忍村之首的木葉，仔細算來影級強者也不過六人(不包括天穹)。

　　也就是說，曉組織已經具備了與一整個忍村抗衡的實力！

　　“正因如此，我們要把這個危險的組織消滅！”波風水門攥緊了拳頭。

　　剩余四影紛紛點頭。

　　唉~他們到現在為止都不知道曉是天穹安插在阿飛身邊的一顆暗棋，不然他們也不用緊張了。

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　　與此同時，雨之國，曉組織的某個秘密空間裡，兩個戴著兜帽的人正在交談。一個人還帶著只露出一隻眼的旋渦狀面具，那只露出來的眼睛，赫然是寫輪眼！另一個則是戴著眼鏡，灰白色頭髮，身上有著蛇一樣的白色鱗片。

　　“你的意思是……你要幫我?”阿飛緩緩說道，獨眼緊緊盯著對面的兜。

　　兜扶了扶眼鏡:“正是。但是相對的，戰後的利益，我要一半！”

　　“……為什麽?”

　　“為什麽?哈！”兜怪笑了一聲，“因為我要報復！我要把整個世界踩在腳底下！我要讓他們知道，當初那個不起眼的小人物，現在爬到他們的頭上！”

　　“哼……你願意幫我，我很高興……但是，這個世界的主人，一個就夠了！”

　　“哦……你覺得拒絕我真的好嗎?你覺得僅靠你和那個【曉】就可以對抗整個世界?”

　　“不試一試怎麽知道呢?”阿飛的眼睛裡閃爍著危險的光芒。

　　“……好吧，既然你對自己的實力這麽有信心我也就不說什麽了。”兜起身。

　　“慢走不送！”阿飛連頭都沒抬。然而兜笑了一聲。

　　“走?哈！我什麽時候說過要走?”兜手上迅速結印，“我讓你看個東西，為了得到它我可是花了不少功夫呢……秘術·穢土轉生！”

　　“嘭！”從地上冒起一個樹立的棺材，顯然，裡面裝著某個人的屍體。

　　“哼，大蛇丸那一套你倒是學的很快……”阿飛明顯很不屑。

　　“嘿嘿，希望看過這個後你還能保持那個態度……”兜手中一動，棺材蓋掉了下來，裡面一具屍體出現——赫然是數十年前，與初代火影千手柱間決鬥的傳說中的忍者，宇智波斑！

　　“什麽！?”阿飛一下子站起來，眼中震驚之色掩飾不住，“你……從哪裡得到它的！”

　　“嘿嘿……無可奉告……”兜舔了一下嘴唇，“不過，你自稱是‘宇智波斑’，這個事可就……”

　　“夠了！”阿飛肩膀起伏了幾下，情緒漸漸平複，“……我答應你就是……”

　　“哈哈，那我們可就合作愉快了！”兜瘋狂地大笑起來，阿飛只是冷冷地看著他，面具下浮現出一個冷笑。

　　“哼……自以為得手的蠢材……他的計劃，豈容你來摻一腳……無知！”阿飛暗自搖了搖頭，不管還在大笑的兜，轉身走出密室，身影漸漸消失在一片黑暗之中……