雨秋家的領地內風調雨順之時，近畿的局勢卻並不平穩。
　　三好家完成了對攝津一國的壓製之後，就把目光投向了攝津西邊的播磨。播磨國小豪族林立，西播磨赤松家和赤松分家、東播磨別所家、中播磨小寺家等諸多豪族都有著自己的勢力范圍，想要處理起來可以說是十分麻煩。而在備前地區擁有強大實力的浦上家，也因為浦上政宗、浦上青宗父子的死而對赤松分家懷恨在心。浦上家新任家督浦上宗景無時無刻不想著殺死赤松分家的赤松政秀，因而也已經染指播磨。想要壓製播磨，勢必要投入大量的軍力。
　　可是此時此刻，三好家卻發現原本安如泰山的四國大本營也發生了波動。土佐的長宗我部家在新當主“姬若子”長宗我部元親的帶領下一路高歌猛進，先後消滅了本山家，兼並了吉良家，幾乎統一了東土佐。如果不對他加以限制的話，日後說不定就會威脅到三好家在四國的大本營阿波國和讚岐國。
　　而在攝津國北方的丹波國，同樣發生了一件大事。三好家在丹波方面的重臣松永長賴，也是就松永久秀的弟弟，意外地在和丹波波多野家的戰鬥中被赤井直正討死，導致三好家的丹波軍團元氣大傷。松永長賴的兒子內藤如安還是一個15歲的毛頭小子，如何擋得住波多野家的攻擊?(松永長賴當年為了在丹波國獲得名分，娶了丹波守護代內藤國貞的女兒，並改姓內藤，他的兒子內藤如安也繼承了丹波守護代的官職。在雨秋平前世的歷史上，這位內藤如安可是成為了一個了不起的大名人。在豐臣秀吉發動的侵朝戰爭中，他多次作為日方的使節前去和大明談判。因為史料記錄的錯誤，內藤如安被大名和朝鮮方的史料誤記成了鼎鼎大名的“小西飛”。)隨著三好家在丹波不斷敗退，攝津國北邊的安全也受到了威脅。
　　於是，在這樣的情勢下，三好長慶作出了安排。他親自回到四國，支援正在和長宗我部元親作對的安藝國虎。而十河一存則帶領著讚岐眾、三好三人眾(三好長逸、三好政康、岩成友通)率領攝津國和部分來自河內、和泉的部隊與安宅冬康的淡路水軍一起試圖壓製播磨。三好家在的河內、和泉交由三好長慶的嫡長子三好義興負責。三好義賢則率領著渡海而來的阿波眾留守攝津，提防波多野家的進犯。
　　在看到三好家四處出兵，沒有留下多少預備部隊後，將軍足利義輝的心思立刻活絡起來。三年前，他聯絡六角家、北畠家和畠山家和三好家作戰，卻不幸落敗，辛辛苦苦積累了好久的實力再次受損。而六角家也在觀音寺騷動後元氣大傷，使得足利義輝失去了外援。臥薪嘗膽三年後，他終於等到了三好家大軍出動，無力照顧近畿的機會，這位劍豪將軍再次為了複興室町幕府的權威而活動起來。
　　而他選擇的切入點，就是大和。
　　足利氏的室町幕府，設立在二條禦所，位於日本六十六國之一的山城國內。而大和國，正位於山城國的正南方，此刻正控制在松永久秀手中。
　　足利義輝趁著三好家無暇顧及他的時候，插手大和，支持先前被松永久秀擊敗的興福寺筒井家再次起兵。不過，筒井家之前就不是松永久秀的對手，這次更加不是。足利義輝的奉公眾和筒井家的聯軍被松永久秀打得打敗，落荒而逃。
　　不過，足利義輝也不是特別擔心。靠著足利幕府將軍尚存的權威，足利義輝也不是第一次進行這樣的扶持操作，大家也不敢對他太過無禮。他之前就曾經三次逃離京都，流亡在外，最後卻依然能夠重返京都。然而這一次，等待的他卻並不是三好家或者松永家發來的警告，而是三好義賢和松永久秀的大軍。
　　不管是松永久秀，還是三好家，早就對這個足利將軍看得不爽了。他們想要的是一個甘於聽命的傀儡將軍，而不是一個每天上下活動，致力於恢復足利家昔日輝煌的劍豪將軍。松永久秀在這一次和筒井家的戰爭後，就寫信給三好義賢，邀請他一起出兵。
　　說來也是奇怪，三好家和松永家的關系居然沒有因為松永久秀的“謀殺未遂”而陷入冰點。不知道是松永久秀之前和三好家頗有淵源(比如三好義賢和松永久秀二人就都和堺町商人保持著良好的關系)，還是因為三好家也認同松永久秀的實力，亦或是他們不得不與松永家合作——反正現在松永家和三好家之間的關系，就如同英國和美國那樣緊密。不僅在之前組成聯軍擊敗了足利義輝和六角義賢等人，這一次有一同進兵包圍了二條禦所。
　　·
　　二條禦所被圍，狼狽不堪的足利義輝匆忙打算故技重施，搬出朝廷來進行調停。之前的教興寺之戰之後，就是朝廷為他調停了和三好家的戰爭，讓他得以重返京都。
　　然而，這一次三好義賢和松永久秀卻異乎尋常地頑固，一口回絕了朝廷的請求。他們挑好了代替足利義輝的人，那就是足利義輝的從弟——十二代將軍足利義晴之弟足利義維的兒子，足利義榮。此人毫無主見，足夠聽話，一看就是一個很好利用的傀儡。
　　足利義輝得知此事後才大驚失色，意識到這一次將軍之位很有可能不保。他匆忙派人叫來堺町的商人，靠著和三好義賢和松永久秀良好的關系來調停此事。然而，素來因為和堺町關系良好，而有著“三好家的錢袋子”之稱的三好義賢，這次卻沒有給商人朋友們面子，依舊拒絕了這一請求，看來是鐵了心要罷黜將軍了。
　　得知三好松永聯軍包圍京都後，一直對幕府和舊制度忠心耿耿的畠山高政勃然大怒。他再次從紀伊起兵，宣布討伐三好長慶，卻被三好義興在岸和田城城外擊敗。而六角家在觀音寺騷動後威望盡失，曾經作為近畿一霸的他甚至無法召集豪族的軍勢，隻得率領本家的直轄前去京都支援將軍，也被松永久秀擋在瀨田以東無法接近京都。無可奈何之下，足利義輝隻得妥協。
　　在雨秋平前世的歷史上，松永久秀正是在這一次行動中殺害了將軍足利義輝，史稱永祿大逆。他也憑借這次血腥火爆的“下克上”，成為了戰國亂世名聲最醜的陰謀家。然而，歷史上的那次永祿大逆，三好一方的參與者是被松永久秀利用了的三好三人眾，三好長慶等人早已先後故去。而在這一世，英明的三好長慶自然不會允許三好家犯天下之大不韙，背上殺害武士領袖——足利幕府將軍的罵名。因此，他授意三好義賢不準加害足利義輝。在三好義賢的堅持下，松永久秀也隻得打消了自己斬草除根，將足利義輝永久消滅的念頭。
　　永祿八年(1565)五月二十三日，歷史上永祿之變的四天后，足利義輝被迫屈服於三好家和松永家的大軍，將將軍之位讓與足利義榮。而他本人，則被松永久秀軟禁在槙島城內。而朝廷也很識時務，很快就下旨認可了足利義榮的將軍之位，還在松永久秀的暗中要求下賜予他山城守護代的職務。而山城國和京都，也被名正言順的松永久秀控制住了，三好家隻得退兵離開。
　　·
　　就當松永久秀以為大功告成之時，足利義輝卻再次證明了自己不是省油的的燈。
　　在家臣細川藤孝和六角家的和田惟正等人的營救下，足利義輝居然從戒備森嚴的槙島城裡逃了出來，而且還帶著嫡長子足利輝若丸一同離開！
　　氣急敗壞的松永久秀立刻派人追擊，卻受阻於六角家的軍隊，眼睜睜地看著足利義輝從他的眼皮子底下飛了。他立刻派出使者再次聯絡三好家，要求三好家一同出兵，同他一起討伐藏匿足利義輝的六角家——卻被三好義賢一口回絕。
　　松永久秀立刻意識到了足利義輝逃跑這件事，與三好家必定脫不了乾系。他派出忍者前去調查，居然發現槙島城的守衛有不少人在足利義輝逃走的那天玩忽職守放走了足利義輝，又在之後不久逃之夭夭。松永久秀本以為他們是畏罪潛逃，可是卻在三好家的居城飯盛山城之內發現了其中幾人的蹤跡。事情已經很清楚了，正是三好義賢指示他們放走了足利義輝到六角家。
　　而一心想要複興足利幕府的足利義輝，果然在逃離險境後立刻宣布松永久秀是叛逆，他所擁立的足利義榮也是“偽將軍”，要求各地大名騎兵討伐松永久秀，替他奪回二條禦所。
　　恍然大悟的松永久秀終於意識到了問題。三好義賢之所以拱手將山城國讓給他，就是想將他推到風口浪尖上，放在火上烤。可是當時的他權欲熏心，滿腦子想著都是控制天下的權力中樞——二條禦所和朝廷。靠著陰謀取得山城國控制權的松永久秀搬石砸腳，成為了各地大名的靶子，也成了足利義輝的目標。