Seele的會議室裡，見到這一幕的眾人都沉默了下來。

　　此刻即便是他們，也不知道碇源渡那個‘叛徒’想要做什麽了，而此刻，在他們眼前正好有一個人能夠解開他們的疑惑。

　　“碇源渡，這個男人真是讓我感到難以理解，難道這一切全都是為了保護他的兒子嗎?”01沉聲問道。

　　碇真嗣被選為初號機的駕駛員，自然不是偶然。應該說，他的到來是seele為了確保碇源渡忠心的一道保險。不過這一步棋顯然沒有多大作用，因為根據後來的觀察，碇源渡對他兒子的態度可實在不怎麽好，甚至隻把他當成一件道具來使用。這個男人似乎完全抹殺了自己的感情！在這點上，seele確實被碇源渡的表現給欺騙了。

　　但這也並沒讓seele放棄對碇真嗣的利用，他們意外的發現他的內心同樣存在巨大的精神缺陷。同時，在幾個作為‘神之憑依’的候選者中，碇真嗣的條件也是最佳，甚至超出最高標準不少。所以很自然的，碇真嗣就成為了人類補完計劃的核心。

　　冬月副司令點點頭:“保護真嗣確實是我們最初的目的之一。不過卻並不是如你們想象的那樣。可以說，讓真嗣成為補完的核心，並不是你們選擇的結果，而是碇唯的安排！”

　　“你說什麽?碇唯，她不是早就死了嗎?”02顯的很氣憤:“難道這一切都是你們早就計劃好的，演給我們看的嗎。”

　　冬月點點頭又搖搖頭，面帶懷念，視線看向天花板，開始回憶:“一切都是從真嗣出生的那一刻開始改變的……”

　　Seele當初在初步制定出人類補完計劃後，就開始四處收羅各個領域的人才，準備‘迎接’十二使徒的到來。很快的，擁有驚世之才的碇唯就進入了他們的視線。通過秘密調查，他們意外的發現她居然在研究靈魂的數據化，而且已經取得了不錯的進展。所以他們極力邀請，三顧茅廬之後才讓她同意加入這個神秘組織。

　　這裡提一下，seele並不是一個‘反派組織’，他們建立的初衷就是為了人類未來的延續。只是很多事情都是高度機密，所以他們雖然做事一向都是神神秘秘，不過並不會強人所難。當然，像碇唯這種急需的人才，他們還是得用了很大的心思的。

　　也許是他們的誠意感動了碇唯，也或者是碇唯對他們的目的和條件感到好奇，在思慮幾天后，她答應了seele的邀請。

　　碇唯的加入，對seele來說可謂如虎添翼，極大的加快了seele的研究步伐。尤其是她貢獻出改良版的靈魂數據化技術後，碇唯獲得了seele高層的認可，於是他們把人類補完計劃告訴了她。

　　當時的碇唯，並沒有表現出任何異常，只有知道世界真相後的震驚罷了。之後，碇唯繼續她的研究，而這個時候，六分儀源渡，也就是後來的碇源渡，這個男人進入了她的內心世界。

　　這個來歷頗為神秘的男人似乎知道seele的計劃，又不知從何處獲得情報，知道了seele的首席研究員碇唯的存在。

　　後來的事情大家都知道了，雖然有點狗血，不過這就是真實的人性！碇源渡愛上了碇唯，兩人很快從戀人發展成夫妻。不久，碇唯十月懷胎，生下了碇真嗣。

　　碇真嗣的出生是第一個重大的轉折，面對新生的兒子，他們堅定了心中的某個信念。碇唯認為，沒有身體的人類，就不再是完整的人類了。一旦補完計劃成功，人類與莉莉絲融為一體，人類就不再是人類。即便那時大家都獲得了永生，但同時也失去了無限的未來。

　　人類必須要有屬於自己的未來！即便那付出怎樣的代價，也不能取代他們‘兒子的位置’。於是他們私下開始制定屬於他們自己的人類補完計劃，並暗中開始為這項計劃做準備。

　　然後是第二次轉折，隨著碇真嗣一天天長大，某天，他居然如鬼附身般開始用筆在牆壁上寫滿密密麻麻的0和1的代碼。這讓看到這一幕的碇唯和碇源渡驚駭不已。

　　因為只要是稍微了解電腦程序的人都能看出，這並不是小孩的隨手塗鴉，而是某種加密過的某種信息，而且加密的算法還相當的高明。知道事情不簡單的兩人急忙在拍下照片後消除了‘證據’。

　　後來他們經過一段時間的研究，也只是勉強分析出這可能是某種求救信息。而加密的算法，居然是‘智能化’的圍棋棋局。

　　要想解開這神秘信息，就必須破解這有著無數變化形式的圍棋棋局。而讓兩人為難的是，他們找遍能找到的所有圍棋高手，所有人在研究過後都對他們搖了頭。

　　“唉，沒想到這世界上還有這樣神奇的棋局。對手的境界太高了，我們的所有舉動都被他看穿了。如果對方不是先手搶佔天元就好了，一旦被它佔了這個位置，我們幾乎找不到辦法解開這個‘死局’。”

　　到最後，幾乎所有棋手都想看看是誰創造出了這樣的千古棋局。不過兩人並沒有向他們透露更多的信息。

　　經過這件事情，碇唯兩人自然知道碇真嗣身上隱藏著某種秘密。於是，為了兒子的安危，也為了弄清事實真相，碇唯狠下心來，利用她創造出來的‘靈魂探測儀’，試著想要解開兒子身上的謎團。

　　結果一出來，讓碇唯大吃一驚。因為她在碇真嗣的身上居然沒有檢測到人類的靈魂，取而代之的是一顆散發出某種能量場的透明多面體核心。就是這玩意，在不斷的散發出神秘信號，誘導碇真嗣做出了怪異的事情。

　　“沒有人類的靈魂?！這怎麽可能?只要是由生命之樹繁衍出來的生命，都應該有靈魂才對，也脫離不了‘生命的輪回’。地球上的生命都是……對了，那個‘變數’！”聽到這，01驚訝的不由得的打斷了冬月的回憶，但說著說著，他忽然明白了過來。現在在這個地球上，不是還有來自另一個世界的‘人類’嗎。

　　“是那段神秘的求救信號引來的那個異世界的‘怪物’嗎！?怪不得碇源渡一直在基地裡循環播放這段信號，難道你們連這個都計算到了?”02接著問道，語氣中帶著一絲畏懼和好奇。

　　冬月搖搖頭:“我們也只是抱著好奇的心態試試看罷了，所以才這麽做的。當然，高飛的到來，完全是個意外，而且他的戰鬥力也出乎我們意料。不過這並影響我們的計劃就是……他的到來，還幫了我們不少忙。最起碼，我們對於使徒的態度都是一致的，不是嗎?”

　　冬月繼續說了下去。‘靈核’的發現，讓碇唯欣喜若狂，因為這個跨時代的發現，讓她找到一條全新的挽救人類的道路。原來即便沒有靈魂，人類也能繼續生存下去！就像他的兒子一樣！

　　看著投影出來的外界圖像，冬月的眼神透露出一股留戀:“為了人類、為了真嗣，碇唯和碇源渡犧牲的太多太多了……”

　　十萬米高空中，初號機已經上升到了這個高度，同時GUF門扉也覆蓋了整個日本。這時，插在初號機身上的那把卡西烏斯之槍開始產生形態變化。

　　就好像開始快速生長的植物一樣，從槍頭處分化出幾根像藤蔓一樣的樹根，沿著生命樹圖的軌跡開始不斷生長。 其中有三根最粗的根系分別連接到了六號機、零號機和碇源渡的身上。最終和插在他們身上的長槍融為一體。

　　三者身上的長槍很快也開始了相似的變化，不過隻從槍頭分化出一根主根系。

　　碇源渡身上的卡西烏斯之槍分化的主根系直接向著天空蔓延而上，直直伸入了GUF門扉的中心，最終消失在‘輪回之門’內部。而零號機身上的朗基努斯之槍，分化的主根系直接插入量產機制作的代表莉莉絲神之國的反AT力場中，之後也是同樣消失不見。六號機身上的朗基努斯之槍也一樣，不過它插入的是代表亞當的神之國。

　　除了主根系之外，那些次要的細一些的側根則擴散出去，一一連到了量產機的身上。和它們身上的‘偽根’相連接。

　　這樣，生命之樹的復活條件終於滿足，作為核心的初號機身上的長槍的生長速度一下變快百倍，從尾部開始從主乾上不斷分化出新的枝乾。

　　最終，一棵以天空中的GUF門扉作為土壤，倒垂而下的血紅色大樹成型。沒有樹葉、沒有花、沒有果實，只有根系、主乾和分枝。高達幾十公裡，幾乎連接到地面。

　　這還只是生命之樹的幼苗形態，很難想象當他完全成長後的樣子，會有多巨大！

　　當生命之樹停止生長的時候，冬月望著它的樣子，喃喃自語:“終於要真正開始了！人類的未來，就托付給碇唯和碇源渡的兒子身上了！”