馬燼在和娜姿進行了四年的旅程之後便回到了真新鎮，繼續和大木博士以及花子姐姐做著鄰居，成為了大木博士的助手，並且在第五年的時候靠著伊布的不同進化方式，成為了聯盟認可的最年輕的博士，而馬燼也做著小茂和小智的知心大哥哥。

　　而娜姿也是跟著馬燼一起回到了真新鎮，此時的娜姿眼裡只有馬燼一個人，馬燼強大的實力已經讓她傾心，只是馬燼心裡已經有了蘇小狸，所以拒絕了她，但是娜姿也是不放棄，一直跟著馬燼後面。

　　而馬燼再和娜姿一起遊歷整一個精靈世界的時候，兩者都闖出了偌大的名號，一個被稱為年輕一代最強訓練師，另一個則是被稱為世界第一超能力者，馬燼在遊歷這個世界的時候，已經連著一些小島和一些山脈加上這裡面的小精靈，全部移動到了自己的小世界之中。

　　馬燼和娜姿在挑戰各地的同時，也在不斷的擴充著自己的小精靈數量，馬燼把目前聯盟已知未的各種不同的小精靈全部收集了起來，而娜姿則是把大部分強力的超能力小精靈全部收集了起來，有一點弱的都不要。

　　馬燼捕獲的這一些小精靈，全部放入小世界之中，小世界之中科學家和小精靈世界之中各種被馬燼克隆出來的科研人員，一同改良了小世界完整的基因複製系統，開始對各種小精靈進行了基因複製，馬燼捕獲的這些小精靈數量種類都是極其的負責，就連迷你龍等亞神獸馬燼也是捕獲許多。

　　而馬燼自己的小精靈不是經過大蛇之力的洗禮，就是成功接收那符文之力的能量，至於失敗者，對不起，這裡沒有失敗者。

　　馬燼再集齊自己的六隻精靈之後，便是回到了常磐市，和此時的常磐道館館主阪木進行了鬥爭，而阪木不負馬燼的期望，擊敗了馬燼的兩隻神奇寶貝之後，被馬燼的王牌——成功進化的哥達鴨一舉擊破。

　　馬燼除了之前的比雕，黑色暴鯉龍和他的哥達鴨以外，他的主力精靈多了由水晶大岩蛇進化之後可以MEGA進化的大鋼蛇，以及等離子隊打造的最強獵手赤紅的蓋諾賽克特，和火箭隊打造的並且目前可以MEGA進化的超夢！

　　但是任誰都沒有想到這個所謂的知心大哥哥，聯盟最年輕的博士，以及年輕一代最強的訓練家竟然是在暗地裡與聯盟分庭抗爭的天啟集團幕後Boss。

　　而這個天啟集團則是明面上則是利用資金或是各種拉攏(多數為靠著馬燼娜姿修改記憶)聚集了各個種類不同的科學家，科研人員進行各種科研項目，他們的產品分布在世界各地，而且一些特別重要的東西，也只有他們這邊才能生產，而這個世界個個的財團也和他們交接，平常普通的民眾也離不開他們的各個產品。

　　但是在暗地裡則是同樣聚集了各個地區的精英犯罪團夥或者是遭受聯盟打壓的強力訓練家，他們以板木等各地區最強的犯罪團夥為主，對聯盟各個地區的認可道館和各處警備組織進行了各種襲擊，聯盟雖然強大，但是受襲地區太多，根本來不及應對。

　　久而久之，有一些比較偏遠的地方就直接投靠了阪木他們的勢力，這些地區在聯盟地圖上被稱為黑暗區塊，而各個地區的聯盟，因為這一些黑暗區塊被完全的隔開了。

　　雖然聯盟可以強行打擊一方，但是這些人數太多了，而且有很多都是因為大蛇之力，變得實力非凡，一般的聯盟訓練家都沒有用，而派遣的精英級別的訓練家過多，這些犯罪集團就會對被抽調人員的地區再次進行襲擊。

　　而阪木等人則是因為馬燼小世界之中那些超級科研人員，根據這個世界科技所製造的那些堪比大師球的精靈球，帶著他們的手下，根據馬燼所提供的信息對於那些究極異獸，以及一些三級神的神奇寶貝進行了捕捉。

　　(總不能按照遊戲裡面的數據說話，我是按照他們的能力進行分等級的，比如萊希拉姆捷克羅姆兩個是二級神，酋雷姆是一級神，那麽焰白酋雷姆暗黑酋雷姆兩個就是超級神，此外三神鳥這種就是三級神，然後創世神就是至高神。)

　　閃電鳥，急凍鳥，火焰鳥，雷公，炎帝，水君，雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯奇魯，九隻三級神，被阪木的火箭隊所抓到了，但是馬燼和他們的目標可不是這些啊，而是他們的主神洛奇亞，鳳王和雷吉奇卡斯！

　　馬燼此時的小世界已經很是強大了，但是還不是最強盛的時候，這個小世界屬於馬進的時候，在本源世界，這個小世界足足擁有著銀河系的大小，而馬燼這裡目前只有著因為冉閔和符文的力量，才開啟了兩個地球的大小，現在馬燼需要這些神獸的力量來加強自己的小世界，不過不是這些特級的神獸還是不要做為好，畢竟這個世界可是有著自己的意識！

　　馬燼只是一直在做著支線任務，目前的馬燼一共完成了十幾個任務，而馬燼則是在做任務的時候，讓自己的可達鴨對戰城都地區的水君，並且搶奪了它的神職，而馬燼的可達鴨在奪取了它的神職之後則是進化到了哥達鴨，但是這個世界的世界意志和創世神阿爾宙斯都沒有再去關注或是盯著馬燼了。

　　馬燼發現除了第一個任務是無理由的任務以外，其他的所有任務都是為了這個世界的發展而行動的，比如說是幫助這個世界更新他們的民用科技，然後還有什麽擊敗天外來客代歐奇希斯等等，都是針對世界的不穩定因素或是發展這個世界所發布的任務，但是馬燼卻是一直沒有領取到主線任務，若是沒有領取到，馬燼就真的要在這個世界呆滿十年！！！

　　馬燼和他小世界的科學家，已經把這個世界所有的科技都吃透了，而且還在不斷的升級著，就連聯盟內部的所有科技也是被馬燼打包帶走了，只是馬燼在這個世界呆的更久，越發的覺得一種不舒服的感覺。