經過數年的調理，秀賴的視力逐漸恢復，心態發生了積極變化，和歌山的政務也開始接手處理。對此，不僅片桐且元等近臣，秀保也頗感欣慰。想起石田三成臨終前的囑托，秀保終於向朝廷奏請為秀賴晉升。

永寧五年(1621年)五月，豐臣秀賴晉升為正二位左大臣，這是他時隔九年再次晉升，心中不免百感交集，好在有千姬陪伴開解，才認定這是秀保釋放的善意，並於當日向秀保拜謝。同時也暗示自己心中已無繼任關白的打算，秀保顧左右而言他，兩人的交談也就點到為止。

同時，豐臣秀滿晉位從二位內大臣、長子豐臣秀賢為正三位大納言、三子豐臣秀清為正四位中納言、四子豐臣秀興、五子豐臣秀虎為從四位參議，六子豐臣秀晴為正五位中務大輔。

此外，秀賴之子豐臣秀忠(國松)晉從五位侍從，尾張名古屋藩藩主豐臣秀房晉從五位少納言。至此，大和、紀伊、尾張三豐臣皆有所得，豐臣氏已成為“公武一體”的重要紐帶和最大獲利者。

為表對朝廷的尊敬，幕府撥款在京都西郊、大阪、伏見為天皇修建離宮，並為公卿修建別院，增加對朝廷的貢奉，加之菊亭晴季從中聯絡，幕府與朝廷的關系甚為和睦。

次年年初，六十六歲的藤堂高虎生了一場大病，自感時日無多的他，將家督之位傳給藤堂高次。後雖康復，但體力精力已大不如前，便決定前往伏見屋敷修養，山口藩四十萬石交由獨子高次打理。

在伏見的日子裡，高虎常與秀保秉燭夜談，感慨幕府如今之氣勢之盛，但又憂心今後是否會重蹈鐮倉、室町幕府覆轍。

“開幕乃是武家之巔峰，但對於主公來說，並不適合。您正值壯年，不應安於現狀，應當多為後代打算。”藤堂高虎繼續說道:“幕府建立二十年，如今經過兩次大變故，目前禦領石高佔全國近四成，加上譜代佔五成，若是加上與力大名，則達到八成以上，這般比例，歷代幕府都不如，況且有《一城一國令》和《推恩令》加持，今後的比例只會越來也高。是時候想想如何更進一步了。”

“正如我意，‘公武一體’必須進一步推進，好在太閣在世時就與朝廷打好關系，才有了現在的局面，我們確實不該止步於此。”秀保回應道。

“營繕司修建新禦所的時候已經有所考慮了，只不過靜待時機。”藤堂高虎說道。

說罷，兩人相視一笑。

所謂時機很快就來了，四月初五，京都周邊發生地震，京都禦所因此受損，多名女官及大臣罹難，後花山天皇獨子也因驚嚇過度不幸夭折，秀保遣人將皇族接往京西禦所暫住，並主動負責禦所重建，天皇深感其忠。

未曾想兩天后的深夜，一聲巨響響徹天際，地動屋晃，眾人皆以為是余震，天皇也連忙跑到殿外。

遠遠望見禦花園方向閃爍一陣金光，正好奇時，便有侍女火急火燎地前來稟報:“陛下，神跡！神跡！”

“休得無禮！”中宮京極常子下意識地擋在後花山身前，厲聲斥責道。

“罷了罷了，”後花山天皇毫不在意:“別慌，細細說來。”

“剛才大震時，奴婢跑出房間，見禦花園有金光閃爍便跑去查看，只見草坪上陡然出現一塊兩人高的大青石，通體閃爍金光，更神奇的是花園水池中冒出汩汩泉水，順著石徑源源不斷流入大青石下！”侍女邊說邊比劃著，眉宇間流露的慌張和恐懼讓人難以懷疑這件事的真實性。

眾人聞之甚感神奇，便隨侍女前往查看，現場果如方才所述一般，後花山天皇也感到不可思議，便請陰陽寮之首、陰陽頭土禦門久修前來卜算。

久修觀測天象良久，隨後便閉目低聲自言自語，期間眉頭緊皺，不時還輕輕搖頭歎息。

“如何?”後花山天皇略有些焦急地問道。

久修睜開雙眼，歎了口氣道:“臣日前便覺察天象異常，今又現神跡，更加坐實心中猜想。”

“朕月前便心跳得厲害，不久便遭逢大震，皇子夭折，如今又天降異象，突生神跡，想必不是巧合。”後花山天皇對久修的話表示認同。

“青石、源泉乃是坐實之前觀天象所得，想必…正是清和源氏先祖作祟。”久修頗為嚴肅地說道。

“清和源氏?”後花山天皇一頭霧水。

“源氏始於清和天皇‘臣籍降下’，本意如何，想必陛下清楚。可如今經過近千載，已經枝繁葉茂，武家又以源氏為尊，三代幕府先後做大，朝廷威信日漸衰微。臣土禦門一族久觀天象，不敢欺瞞陛下，自郡山開幕以來，紫微帝星閃爍異常，光芒日趨暗淡，似有不利，今朝又有神跡和讖語相互印證，實在不得不信。”

說罷，久修提醒道:“這禦花園水池之水就如同皇室、如同陛下，如今泉水源源不斷本為幸事，顯示皇室之福延綿不斷，可泉水全部流向大青石，則意味著皇室之福正在被其他力量吸收，地震、禦所大火、皇子夭折這都是應驗……如今幕府勢力日漸強大，相國(指太政大臣，代指秀保)今日之威勢近千年無出其右，殿下覺得兩者沒有關系麽?”

“你說這大青石代表清和源氏?”後花山天皇驚惶不已，“幕府如今卻是如日中天，但對朝廷還算忠誠……怎會出現這種情況……”

“這就是症結所在了，皇室強則源氏亂，源氏強則皇室弱，近千年來都是遵循這個循環，可現在不同了，短期內臣看不到源氏衰弱的可能，這就意味著……”

“意味著皇室要遭逢大難?！”後花山天皇大驚道:“可有破解之法?”

“有是有，不過陛下不一定準允。”久修回答道。

“說說看，能做到的朕絕不推脫。”後花山天皇回答堅決。

“陛下可知‘皇籍複歸’?”說到這，久修眼神似乎變得複雜起來。