唐晨當場罷免縣丞職務，著師爺擔任，廢掉原縣丞，典吏不聽，說非朝廷命令，殺不聽話的殺攢典，罷免正吏，命全部雜役為正吏，命張師爺為縣丞，唐晨掌握上海縣全縣文書檔案、倉庫、糧馬、征稅等權。這裡展開唐晨和師爺關於取利於民與取利於紳的矛盾。

　　縣丞和主簿找陸家，陸家讓他們隱忍，很快唐晨要被革職。

　　崇禎十五年十二月，夫人來上海。朝廷得到消息。

　　唐晨開始了瘋狂種田模式，繼續招募鄉勇兩百壯大護衛總隊，開始著縣丞師爺準備成立銀行，著李貴做工房典吏，協助縣丞師爺造錢。以及負責召回工匠，研製新的鋼鐵冶煉技術和燧發槍，成立紡織公司，開始一統紡織業。

　　兩月後，崇禎十六年正月，擠垮陸家紡織市場，陸家老太爺得知大怒，說唐晨擅殺官吏士子、禍亂上海，還與民爭利。加上被廢縣丞和主簿在一旁煽陰風點鬼火，又覺得唐晨很快就要被罷官，嚴斥唐晨如同謀反，無法無天，一命要命人去外面告狀，一面組織士子和被革官差大鬧縣衙，一面以金山衛千戶的官職為誘惑要求黃浦巡檢司派官兵來維持秩序，對抗縣衙，同時讓唐晨去他那裡請罪。唐晨則直接封鎖了城門，直接調令護衛隊官兵屠殺士子，擊退黃浦巡檢司的官兵，將場面鎮壓了下去。陸家老太爺這才知道自己一時也無法抵抗，只能在家中發脾氣。

　　崇禎十六年三月，唐晨趁機以通倭作亂之罪，革除黃浦巡檢司的官職，收黃浦巡檢司，擴兵至一千人，命楊忠領黃浦巡檢司，同時，陸家太老爺還要派人去告狀，說唐晨要謀反，稱帝自立，同時自己也要組織鄉勇，唐晨殺要出城的陸家仆人。以通倭謀反之罪強製羈押陸家太老爺，而且，朝廷旨令也到了，唐晨沒有被罷官，而且有便宜之權，唐晨更加肆無忌憚，說其包庇家奴，太老爺人又被羈押，陸家被滿門抄斬。鄭成功得唐晨之命，抄沒主簿全家。李章負責抄沒縣丞全家。三人被押解刑台處斬，士紳們觀看。

　　唐晨官威已立，士紳敢怒不敢言，崇禎十六年四月，唐晨命黃浦巡檢司征稅，隻想讓唐晨做高官的師爺反對，被唐晨熱血影響的鄭成功支持，唐晨決定在南門成立稅務司，本地鄉紳紛紛關門歇業罷市，外地鄉紳企圖頑抗，有董祖源家的和錢謙益家的以及王鐸家的。而本地鄉紳顧家則陰謀發動地方苦力造反。但唐晨以成立了工程司，開始招募大量苦力修城牆和建碼頭，解決了勞動力缺乏，讓鄉紳們功虧一簣，顧家人被賣了出來，崇禎十六年五月，被唐晨果斷抄家。人頭丟於各鄉紳家，同時，小販和中下層商戶被鼓勵經營，允許三月無息貸款，為官家采購木頭，開海允許各地番夷來南門外灘借居十年。於是南門外的商戶越來越多，有鄉紳趁機作亂，被唐晨用官兵打了回去，最終崇禎十六年八月開始，大量鄉紳實在是虧不起，隻得複市，按規矩繳稅。

　　崇禎十六年九月，唐晨招募西洋人購買戰列艦，製造戰艦，出售紡織品與鍾表等，漸成規模，此時外地士紳已經上海之事報於松江府知府陳亨(福建侯官人)，松江府知府已同吳淞副總兵官夏永德率兵兩千來攻，甚至勒令唐晨解散護衛隊和海防隊，除黃浦外，十一個巡檢司和鄉紳也組織官兵五千余來攻打縣衙。崇禎十六年十月，唐晨先滅了知府，俘虜了松江總兵官，又擊退了五千余官兵。唐晨殺知府，以發生倭亂上報，言護衛隊不能撤，獻人頭和繳賊白銀五千兩，

錢三萬，於巡撫衙門。　　崇禎十六年十一月，江南巡撫鄭瑄聽聞準備升任唐晨為兵備副使，被錢謙益乾預轉升為知府，而他自己的學生黃玉鼎升任兵備副使。黃玉鼎命唐晨平倭，唐晨獻上人頭，還有那知府的人頭和新任知縣的人頭，黃玉鼎被嚇到，知道唐晨是個狠角色，忙聽從唐晨建議推薦唐晨師爺做了縣令。

　　崇禎十七年二月，唐晨升任松江知府，師爺周良卿成為上海知縣，上海士紳聽聞唐晨不但沒把罷官，還直接升為知府，十分失望，只能認命。

　　崇禎十七年二月到五月大練兵馬，殺豪紳，坐穩松江，遣人北上獻銀，得封兵備副使，五月得知京師陷，支持馬士英擁立福王，得升應天巡撫，命駐蘇州，被張慎言等東林黨誣為國賊，率軍來攻，唐晨還擊，帶兵入南京，福王被嚇壞，群臣斥之，唐晨回蘇州，被升為江南總督。 三月，左良玉舉兵而來，唐晨自請禦敵，怕唐晨再入南京，被拒絕，唐晨隻得找史可法，願意援救史可法，但史可法不信任唐晨，認為唐晨要割揚州自立，拒城不讓唐晨進。

　　適逢徐州失陷，唐晨與揚州城下大戰清軍，卻被史可法襲擊，擊退史可法，唐晨怒奪揚州。於揚州大戰，清軍敗退，俘郡王。

　　清軍奪滁州南下，唐晨請守南京請統兵守南京，被拒，四月南京陷，五月初八日多鐸入南京，福王蕪湖被殺，潞王逃杭州，七月抗清軍，殺李成棟，十月救杭州，但潞王已降，。十二月救紹興，欲迎魯王於蘇州，張國維與熊汝霖拒絕，且與清軍媾和，意圖滅唐晨，唐晨擊敗清軍，殺魯王，以儆效尤。尊隆武為主，得授大學士，督師東南。

　　清軍避開唐晨，專攻隆武，鄭芝龍投降，隆武被滅，唐晨進兵福建，時浙江、南直隸、福建三地俱在唐晨之手。

　　紹武自立，封唐晨文淵閣大學士，永歷自立封唐晨文華殿大學士。紹武被清軍滅，唐晨奉永歷為主，得升武英殿大學士，國公之爵，唐晨平江西。李定國平廣西，南明形勢一片大好。但孫可望從中作梗，李定國大敗，孫可望投降，李定國退守雲南。唐晨無奈退保江西，獨自面對洪承疇十萬大軍，擊退洪承疇。

　　吳三桂南下滅雲南，唐晨被封常寧王，打湖廣交通線，但依舊未來得及，永歷逃入緬甸，此時唐晨早已派軍艦於升龍登陸，於緬甸殺退吳三桂，接永歷回南京。唐晨得封吳王。讓各方議政，制定臨時約法。然後北伐。征戰天下，一統中原。