2004年2月23日，對陣老鷹隊獲得職業生涯單場得分最高41分和最高助攻7次。

　　2004-05年，姚明迎來了他在NBA的第三個賽季。

　　 2004年夏天，在與奧蘭多魔術隊的一次七人大交易中，火箭隊簽入特雷西·麥格雷迪，同時送出史蒂夫·弗朗西斯和卡蒂諾·莫布裡。

　　盡管姚明表示弗蘭西斯和莫布裡“在(他)前兩個賽季對(他)幫助很大”，但他補充到，“我很興奮能同特雷西?麥格雷迪並肩作戰。他能帶來驚喜。”

　　火箭隊贏得51場比賽，西部排名第五，並連續第二年衝進季後賽。

　　季後賽遭遇達拉斯小牛隊，火箭隊客場先勝兩場，姚明第二場14投13中，創下火箭隊史上季後賽最高投籃命中率。

　　然而接下來4場火箭隊不敵小牛隊，第七場更是落後40分，這是NBA歷史上季後賽第七場的最大分差。

　　姚明平均每場21.4分，投籃命中率65%，7.7個籃板球。

　　2005年3月11日，對陣太陽隊得到職業生涯單場最高籃板22個。

　　在他的前兩個賽季中，他沒有缺席任何一場比賽;在第三賽季僅缺席2場。

　　但是在第四賽季中，姚明被列入傷病休息名單中，原因是他的左腳拇趾患嚴重的甲溝炎。

　　2005年12月18日，當隊友們在洛杉磯與湖人隊客場廝殺時，姚明返回休斯敦進行腳趾手術。

　　在錯過了21場比賽之後，姚明重新回到了賽場，並在與孟菲斯灰熊隊的比賽中得15分。

　　在2006年的全明星賽第二輪投票過後，姚明以1，319，868票高居榜首，科比·布萊恩特以1，213，387票位居第二。

　　2006年11月14日，對陣馬刺獲得職業生涯最高搶斷次數4次;12月16日，對陣湖人獲得職業生涯最高蓋帽8個。

　　這個賽季姚明場均得到25分、9.4個籃板和2個封蓋，得分首次超過麥迪。

　　但由於在與洛杉磯快船隊的比賽中脛骨受傷，姚明這個賽季常規賽出場僅為48場。

　　在季後賽中，他場均貢獻25.1分、10.3籃板，不過火箭隊還是以3比4不敵猶他爵士隊止步季後賽第一輪。

　　 2008年2月26日，在率領休斯敦火箭隊獲得12連勝之後，被診斷舟骨裂縫，手術後需要休息4個月，07-08賽季剩余將無法出場，隨後火箭隊在麥迪帶領下，繼續贏下10連勝，創造NBA歷史最長連勝紀錄的第二位。

　　姚明在該球季出賽55場，平均取得22分，10個籃板及2個封蓋。

　　這個賽季姚明場均貢獻19.7分、9.9籃板和1.9封蓋。

　　另外，他的賽季總得分達到了職業生涯最高的1，514分。

　　他順利帶領火箭進入季後賽，並首輪淘汰波特蘭開拓者隊，火箭隊在時隔多年後再次進入季後賽第二輪。

　　值得一提的是，姚明在首輪對陣開拓者隊的第一場中，上半場24分鍾內，9投9中，6罰6中得到24分和9個籃板。

　　不過在第二輪對戰洛杉磯湖人隊的比賽中，姚明因腳傷導致休戰，甚至影響了2009-10賽季。

　　2009年1月18日，對陣熱火12投12中拿到26分。

　　2009年3月14日，對陣山貓投中賽季第1個3分。

　　2009年4月19日，

對陣開拓者姚明在24分鍾內9投9中得到24分。　　5月5日，對陣湖人的西部半決賽第一場中受傷，但經過調整後執意衝回賽場，並最終帶領火箭取得勝利。

　　5月10日，左腳骨裂，該賽季報銷。7月，他成為上海大鯊魚俱樂部老板。

　　2010年11月11日，傷愈復出不久的姚明在同奇才隊的比賽中再度受傷，隨後一直休戰。

　　12月18日，火箭官方宣布姚明左腳踝第三次應力性骨折，賽季報銷。

　　2015年12月21日，火箭隊正式提名姚明入選2016年的籃球名人堂。

　　2016年，姚明入選NBA名人堂，成為中國第一人。

　　2017年2月4日，休斯敦火箭隊舉行姚明球衣退役儀式。

　　姚明成為火箭隊史上第6位享受球衣退役殊榮的球員。

　　之前的5人分別是德雷克斯勒(22號)、凱爾文·墨菲(23號)、摩西·馬龍(24號)、奧拉朱旺(34號)以及湯姆賈諾維奇(45號)。

　　姚明被公認為NBA最全面的中鋒。

　　他的身高是一個顯著的優勢:他可以輕松的在防守隊員頭上投籃。

　　他可以在20英尺外精確跳投(在CBA時期和NBA時期他都曾投進過三分球)。

　　但是他的投籃主要集中在距離籃筐10-12尺的范圍內，通過勾手投籃、轉身投籃和灌籃得分。他的罰球命中率高達80%，在聯盟中鋒中數佼佼者。

　　他甚至可以自己運球到中場，並且作為一個高個球員，他的籃球基本功和傳球技能相當優異，球場視野和賽場感覺十分出色。

　　一些人批評他在場上缺少氣勢並且體力不夠充沛。

　　但是，姚明卻被公認為非常有團隊精神，他經常放棄自己投籃的機會而傳球給隊友。

　　相比其他明星隊友來說，他的投籃次數並不高，因此也就限制住了他平均每場的分數。

　　他的投籃命中率是令人印象深刻的，在2004-2005賽季，他的投籃命中率在全NBA排名第三，2010年姚明的身價已達10億美元。

　　姚明的商業活動主要分為三類:一是，商業代言;二是，投資;三是授權業務。

　　但除代言收入，姚明目前的投資中盈利的項目很少，而授權業務幾乎尚未起步。

　　防守方面，姚明的身高無疑是對對手的震懾，盡管不少人認為他的身材還不夠結實。

　　盡管他是聯盟中數一數二的防守中鋒，許多人批評說以他的身高，姚明的封蓋數據統計應該更好(第三賽季前，他的每場封蓋數在2個以下)。

　　一些分析家將此歸咎於姚明的翼展，不同於其他運動員，他的翼展比他的身高要短一些。但是，姚明的翼展依舊比平均水平要長很多。

　　由於火箭隊采用慢節奏的進攻模式，姚明其實並沒有太多時間發揮，這導致了他的技術統計不高。

　　在賽場上，姚明並不總是停留幾個固定位置上，火箭隊移動防守的戰術需要姚明的積極參與。