戰火席卷了一切……

　　馬元8230年，邪繭女王帶著她的新幻形靈大軍重回小馬莉亞。

　　她靠著精湛的幻形術，帶著一支精銳的部隊，悄悄的潛入了水晶帝國的城堡裡......

　　水晶之心被毀，黑晶王被解放，荒原影魔被放出了影之監獄，水晶帝國陷入一片混亂。

　　水晶帝國的統治者音韻公主與駙馬銀甲閃閃竭力拖住幻形靈大軍與荒原影魔的進攻以等到皇家衛隊的支援。

　　只可惜等到皇家衛隊抵達時，二馬已雙雙犧牲，水晶帝國被籠罩在黑晶王的暴政之下，血流成河，哀鴻遍野……

　　常年生活在和平年代的皇家衛隊在反攻戰中傷亡慘重，水晶帝國徹底淪陷。

　　但這遠遠不夠……

　　敵人的大軍一路南下，前線噩耗連連，馬國被悲傷與恐懼充斥著。

　　二公主帶著她的夜琪部隊四處奔波，大公主則竭盡全力穩住民心。

　　邪繭靠著幻形術屢次潛入軍隊內部竊取情報，裡應外合;黑晶王靠著精神控制項圈，將所有俘虜都送上了戰場，部隊越打越多;而同時和諧之樹又神秘失蹤，韻律元素不知去向。

　　眼看大軍逼近中心城，公主姐妹卻毫無辦法，而暮光與她的朋友們也紛紛投入戰場:瑞瑞與蘋果佳兒負責馬國軍用後勤。

　　星光熠熠，羲日與神秘博士攪盡腦汁來研發新型戰鬥武器。

　　小蝶與澤可拉成立了戰場醫療部隊。

　　萍琪和姐姐灰琪參加了陸馬軍隊，奔勞於前線。

　　雲寶和飛火帶著閃電飛馬隊征戰四方。

　　暮光與穗龍輔助公主姐妹進行全線指揮。EUP重新建立，小馬們踴躍參軍。

　　就在戰爭終於有所起色時，提雷克的逃脫令馬國措手不及，馬國又一次陷入不利狀態。

　　緊接著，萍琪在戰場上失蹤;雲寶在一次任務中負傷，失去一隻翅膀，後又在與邪繭的空軍作戰時被擊落，失去聯絡。

　　民心動蕩，士氣低迷，後勤資源補給嚴重不足，大批傷員因醫療藥品不足而慘死在醫療帳裡。

　　龍族趁火打劫，部分龍族隔三差五就在南方領土進行肆意搶掠。

　　科研部久無成果，星光熠熠也在一次實驗爆炸中去世，爆炸現場甚至未發現任何屍體碎片。

　　戰損越來越大，形勢逐漸緊迫。

　　直到最後，中心城失守，露娜連夜奔襲邪繭大本營，最終戰死沙場，塞拉斯締亞帶著殘余的皇家部隊拚死反抗，壯烈犧牲。

　　小馬國最後的領土也被敵人所踐踏……

　　作為馬國最後的領導者——暮光閃閃借著友誼學院的影響力，組建了一隻由各個種族組成的混合軍隊，又成功說服鸚鵡海盜們加入戰爭以增強馬國的空軍實力。

　　憑借這支“友誼大軍”，暮光輾轉於各個戰場，消磨敵人的實力。但她知道，這是馬國最後的部隊，是最後的希望了，絕不可輕舉妄動。小馬莉亞已經淪陷，能否復國，就全看她了……