一日早晨，琴打著哈欠和由美走在街上，因為全警視廳裡最悠閑的就是琴，所以就因此被宮本由美抓出來巡邏，“喂，陪我出來，很丟你的臉嗎?”由美很不滿地說，“沒有啊，昨晚我很晚才睡覺啊，很困啊！”琴打著哈欠說道，由美靠在親的耳旁，輕輕說道:“是不是和美和子做的太久，所以今天很累啊?”還真的給她說對了！琴苦笑著，連忙說道:“我哪有啊?”“是嗎?”由美顯然很不相信，身體也快貼近琴了。　　汪！一聲狗叫打破了兩人間的暖昧氣氛，“啊，我去看看有什麽事”說著琴連忙逃開了。轉一個彎，琴看到柯南等人在和一個狗狗玩，而那個狗狗他也認識，就是叫做約翰。“柯南！”琴向他們打了個招呼，之後聊了一會兒便離開了。

　　一段日子後，琴在值班時，突然接到少年偵探團的報警電話，說是有一個人被狗咬死了。琴連忙通知等人前往事發地點。到了後，發現柯南頂著一個‘大包’思索著，這時從屋裡跑出一個的性感女郎，她叫做杉田早苗，是這裡的房客。杉田驚慌失措告訴警察，約翰攻擊人了，被攻擊的男子名叫前原剛，也是這裡的房客。而狗的主人阪口正義並不在家，正在伊豆出差。

　　目暮警官和高木警官也趕到現場，他們感歎毛利小五郎果然又在這裡。根據早苗敘述，今天晚上8點時，前原剛約她在客廳唱歌跳豔舞鬼混，在快要9點時，接到了阪口的電話，讓前原剛給樓梯上的約翰聽電話，隨後慘劇就發生了。後來毛利三人組就到了。目暮警官頗為奇怪，為什麽狗會無緣無故攻擊人，柯南極力反駁，認為約翰不會隨便傷人。目暮警官不以為然，高木警官也解釋如果狗隨便攻擊人的話要被藥物處理掉的，琴走過去看了一眼，便明白凶手的手法，但他不想這麽快，就告訴他們，這樣的話，會磨去柯南的志氣。

　　晚上，柯南到阿笠博士那裡，阿笠博士也認為豢養多年的狗不會隨意攻擊人，除非得到主人的命令。阿笠博士拿出了大量資料，柯南從報紙上找到線索，阪口正義的兒子阪口正人在上國中一年級時因被不良同學欺負而自殺。

　　第二天，目暮警官來偵探事務所喝茶，與毛利小五郎談起了案情，柯南在旁邊插嘴，結果被大叔直接爆頭。聽完目暮警官詢問阪口先生的情況，小五郎也確定了當年的不良同學就是死去的前原剛，他在上大學後再次來到東京，就租住在阪口先生的隔壁房間。毛利小五郎立即得出與柯南同樣的推斷，阪口先生依然懷恨在心，暗中訓練了約翰以特定的暗號攻擊敵人。但是，目暮警官說昨天他也做了同樣的判斷，讓阪口先生對著約翰說了“約翰你好嗎，你好嗎約翰?”，可是約翰安靜地蹲著，一點反應也沒有。毛利偵探有些泄氣，仍覺得不可思議。

　　柯南單獨到阪口家調查了些情況，知道了無線分機電話和鍾聲的線索，明白了阪口先生的手法。在回到事務所後，柯南拐彎抹角地提示給大叔，小五郎也明白了，阪口先生是利用子機的電話才能發出暗號，而剛巧那時時鍾敲響了，這是另外一個暗號。大叔自認為名偵探毛利小五郎把謎題輕易破解了，然後哈哈大笑，柯南無語了。隨後大叔約了目暮警官等警方人員前去進行現場推理實驗，很多人都聞訊敢來觀看，結果完全出乎小五郎和柯南的意料，約翰還是沒有反應，大家都一陣哄笑。

　　小五郎惱怒，“奇怪，不可能，難道我真的想錯了嗎?”小蘭惱怒，

“父親怎麽可能利用愛犬給兒子復仇呢。爸爸，你想太多了。”千鈞這次堅決站在小五郎這邊，“毛利叔叔的判斷不會錯，肯定是利用了條件反射，只是不知道具體的引誘條件是什麽。”偵探團不明所以，步美問什麽是條件反射，柯南解釋起來，這是俄國生理學家伊萬·巴甫洛夫發現一種生物現象，條件反射就是:原來不能引起某一反應的刺激，通過一個學習過程，就是把這個刺激與另一個能引起反應的刺激同時給予，使它們彼此建立起聯系，從而在條件刺激和無條件反應之間建立起的聯系。當時經典的案例就是用狗來做的實驗，非常出名，現在各國生物學課本裡幾乎都有記載，當然偵探團在一年級還沒學到。幾個孩子奇怪為什麽柯南知道的這麽清楚，柯南急忙解釋說是電視上演過了。　　這天晚上，在偵探事務所，目暮警官提到了阪口先生最近三個星期一直帶約翰帶野外活動，毛利小五郎立即道，“一定是阪口先生在訓練約翰。”目暮警官搖頭，“我們沒有證據，這樣的話，明天傍晚約翰就要被處決了。”柯南非常失望，身穿粉紅色睡衣的小蘭回憶起新一，也露出難過的表情，柯南在邊上看得口水都流出來了， 小蘭這樣的打扮太美了。

　　第二天，在帝丹小學，孩子們在游泳，柯南告知了大家約翰將要被處決的消息，偵探團都非常難過，讓柯南想想辦法救救約翰，柯南搖頭，他也一晚上沒睡好。今天柯南也沒有心情欣賞步美和文乃的泳裝秀。這時，柯南看到了游泳老師指揮大家跳水，進行游泳比賽的過程，恍然大悟，明白了問題出在哪裡，原來是順序不對。

　　於是下午，大家都再次接到通知，前來觀看小五郎的推理實驗，小五郎指揮高木進行實驗，對約翰使用暗號，就像運動員那樣，次序千萬不能錯，否則約翰就無法理解。首先，是電話鈴響起相當於各就位，然後是21點的鍾聲相當於預備，最後就是阪口先生說的話“約翰你好嗎，你好嗎約翰?”，於是天真無邪可愛爛漫純真善良乖巧幼稚的約翰就撲向了目標。

　　在事實面前，阪口正義不得不承認了自己的罪行，他的兒子因被前原剛欺負而自殺，本以為小剛只是個小孩子，還能悔過，沒想到長大後反而變本加厲，於是他利用了約翰殺死了小剛報仇。柯南大聲地指責阪口，不顧約翰死活，說的話很重，讓大家都驚奇地看著他，柯南隻好說他太喜歡狗了，才會語無倫次。所有人都驚歎毛利偵探的精彩推理，這次也是毛利偵探在清醒狀態下解決的案件，因而他更加得意，放聲大笑，“什麽條件反射詭計陷阱，在我名偵探毛利小五郎面前都不值一提，哈哈”柯南不住的吐槽，還不是我提示你才發現的。

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