正親町天皇之所以敢召集兵馬對付幕府，主要是島津忠直在和朝廷討價還價，一開始朝廷給出的是關白的位置，但是關白之位不是什麽人都能做的。
　　島津忠直一眼能看出這是沒有誠意的條件，天子會這麽傻嗎?這不過是天子的一次試探罷了。
　　所以島津忠直希望天子可以賜下一個與五攝家同等家格的姓氏，如此就可以當關白了。當然這也是忠直給天子的虛招。
　　雙方還在接洽，但是天子要對幕府動手的野心是藏不住了。
　　不過對於島津忠直要做關白一事，攝關家的幾位公卿是強烈反對，畢竟要是島津忠直做了關白，以後這位置還不是島津輝忠的?然後島津家代代相傳。
　　若是朝廷沒有實權也就罷了，朝廷恢復了實權，這可是割走了攝關家的心頭肉。
　　於是朝廷和島津忠直這邊談起了新的條件，那就是由島津忠直成為新的征夷大將軍，不過幕府要搬遷到關東去，而且以後朝廷掌管本州的京畿西國，四國和九州，而島津家掌管東國，陸奧以及蝦夷島。
　　經過這番談判，島津忠直這才松口同意與朝廷合作。
　　永祿七年七月八號，這是不同尋常的一日，天子突然下達討伐幕府的詔令，宣布足利幕府為朝敵叛賊。
　　詔書一經頒布，頓時讓附近諸侯嘩然，而皇室與公卿們十分興奮。
　　朝廷募集了四千兵馬，從京都出發進攻二條禦所，禦所內的三淵藤英等人急忙召集兵馬，僅有一千多奉公眾進入城內籠城備戰。
　　朝廷大軍與幕府軍立刻展開激戰，雙方暫時不分勝負。
　　這時候菊亭晴季跑來，帶來了天子冊封島津忠直征夷大將軍的詔令，並讓他速速起兵平叛。
　　島津忠直大喜，這詔令可是有天子親筆書寫，又有玉璽大印，如此足利幕府的正統性被朝廷否定。
　　而他島津忠直可以開新的的幕府。
　　這一年多來的折騰總算沒有白費，他總算是離間了幕府與朝廷，讓他們互相攻伐，如今還將足利幕府的正統性剝奪，接下來只要降服足利義直，他就可以開幕。
　　雖然說自己這個幕府將軍暫時不能治理全國，但是他可以頂著幕府將軍的旗號辦事了。到時候，上杉謙信還會與他作對嗎?
　　不過他好像是足利幕府的關東管領吧?他開幕不就是島津幕府，這本朝的主君如何管得了前朝的官?要遭，上杉謙信估計要和他死鬥了！
　　當然這也是以後的事了，征夷大將軍的印璽並沒有送來，如今還在足利義直的手中。
　　島津忠直當即率領一萬余島津軍協助朝廷大軍，包圍二條禦所，新田義信抵達城外，喊道:“我乃征夷大將軍殿下的使臣，前來與足利大人談判！”
　　城牆上，明智光秀大怒道:“馬鹿野郎！征夷大將軍乃足利大人！”
　　新田義信笑道:“明智大人，如今朝廷已經讓殿下擔任征夷大將軍，況且如今的足利大人兵不過萬，困守一城，天下諸侯有幾人跟隨，如此將軍有何威嚴，而殿下雄兵五萬，領國百萬石，實力雄於眾諸侯，如今得朝廷正朔認可，比起足利大人更有資格當征夷大將軍。”
　　“況且當年足利大人的先祖不也是背叛了鐮倉府?在朝廷和天子的支持下擔任征夷大將軍之位?你足利做的，殿下自然也做的。明智大人最好去問問足利大人，若是負隅頑抗，就休怪殿下不念舊情了！”
　　明智光秀大惱，但是也不敢擔下此事，他立刻對身邊的明智光春說道:“左馬助，你在這看著，我親自去匯報。”
　　明智光秀連忙跑回禦館，向三淵藤英和足利義直等人匯報此事，大部分幕臣臉色慘白，三淵藤英和細川藤孝也是相顧無言。
　　年幼的足利義直說道:“事已至此，也沒必要做無謂的掙扎，若是侍中能佑我足利家宗祠，我願投降。”
　　明智光秀跑到前面將新田義信帶進來，面見足利義直，隨後商討投降的條件，經過一日的談判，島津忠直接受了足利家提出的條件，足利義直出城投降，並上交將軍的金印。
　　足利義直改名為近衛義直，這是他母族的姓氏，足利義直的母親是近衛殖家的養女，來自鷹司家的子嗣。
　　不過等島津忠直統一整個和之國，足利義直的子嗣就可以改回足利氏。
　　同時足利義輝的女兒昭姬將作為次子熊若丸正室，待年長後就可成親。
　　島津忠直入主二條禦所成為征夷大將軍，繼位的儀式定在明年，在這期間他可以廣發書信，邀請各地諸侯前來參拜。
　　不過三好家第一個不承認島津忠直是將軍，他還打出足利義直的旗號，要光複足利幕府。
　　島津忠直立刻聯合松永久通出兵，進攻攝津，打的三好義繼和三好三人眾連連敗退。
　　被三好家擊敗的田山高政連忙投靠島津忠直，希望能奪回河內一國。
　　島津忠直連連戰勝三好家，田山高政拿著島津忠直資助的錢糧返回河內國，再一次召集舊臣，雇傭根來眾和雜賀眾出兵，攻打河內國的遊佐信教等人。
　　而在關東，上杉謙信決心不再理睬京畿的事情，致力於越後以及關東的發展，北條家在上杉謙信離開後就和裡見家打了第二次國府台合戰，裡見家先勝後敗，而北條家也戰死了富永直勝等大將。
　　上杉謙信一回到越後，就收到了裡見義堯的求援信，上杉謙信當即出兵與北條氏康作戰。
　　沒多久，朝廷的使者抵達，傳達了天子的詔令，廢除了足利幕府，由島津忠直擔任新的征夷大將軍。
　　這關東管領本就是足利幕府設置的官職，沒了足利幕府他這又算什麽呢?好在使者說道:“陛下之前賜予上杉大人的詔令依然作數，上杉大人可以討伐一切不義之人。”
　　另一邊北條氏康也見到了使者，對於島津幕府，他大怒道:“我不會接受這樣的亂命，必定是島津忠直禍亂朝廷！足利將軍才是我的將軍！”
　　北條氏康立刻派人聯絡上杉謙信，希望可以議和，然後共同對付島津忠直。上杉謙信考慮了很久，拒絕了北條氏康的提議，並且將上杉家督直接交給了勝千代，隱居佛堂。
　　勝千代改名上杉景勝，由直江實綱作為後見人進行輔佐。上杉景勝成為新家主，上杉謙信完全不理事，揚北眾某些人膽子就開始大了，但是上田的長尾喜平次揚言誰敢對上杉景勝不敬，他喜平次就出兵討伐。
　　再加上直江實綱等上杉謙信的心腹輔佐，揚北眾又老實了一些，但是北條高廣和本莊繁長二人不滿，直接進攻上田城，上杉景勝當即派兵支援。
　　雙方一開始不分上下，但是景勝還可以向上杉謙信求助，上杉謙信一出面，北條高廣和本莊繁長很快就戰敗。
　　兩人不知是死於亂軍之中，還是被死於亂軍之中，總之這倆人是死了，但是他們的親族被寬恕了。
　　隨後太田資家抵達春日山城下達征夷大將軍島津忠直的詔令，那就是封上杉景勝為越後守護，協助島津輝忠討伐北條等逆賊。
　　如今信濃內尚有兩萬大軍，進攻北條為首的三家聯盟肯定力有不逮，但現在有了越後的上杉景勝出手，島津輝忠就有了勝算。
　　不過了如今還有關東的諸侯要安穩，不然他們就會阻擋上杉景勝進攻北條，因此，島津忠直讓人前往關東，宣布長野業政，長尾當長等人為各地的番主。讓他們配合上杉景勝的行動。
　　除了房總地區的諸侯，上野的幾家國人認可了島津忠直的分封，歸入上杉景勝麾下。
　　北條有上杉牽製，島津輝忠這下可以攻略武田和今川兩家，武田家內對外很是團結，因此只能強攻，但是今川家內雖然有壽桂尼撐著，但是龐大的事物讓這位老人有些吃不消了。
　　島津輝忠想要拖垮這位老人，於是讓真田昌幸帶著銀錢收買今川的家臣，並且還和今川家打貿易戰，島津輝忠從越中加賀調來大量的食鹽，衝擊今川家的食鹽產業，這讓今川家內的動蕩增加，與武田家之間的貿易也出現了問題。
　　盡管壽桂尼一邊向北條求助，一邊擴大生產，但是今川家領內依然發生了土一揆。
　　今川家的動蕩讓不少家臣變異思遷，暗地裡向島津輝忠靠攏，島津輝忠開始收買壽桂尼身邊的人，特別是醫生，那醫生給壽桂尼開了些補藥，壽桂尼虛不受補，病倒了。
　　壽桂尼感覺自己不太行了，立刻讓人叫來了今川氏真，讓他隱瞞自己的病情，並且處理國政。
　　島津輝忠得知壽桂尼重病，立刻派遣弟弟島津忠虎為總大將，直接進攻駿河，而井伊等人在遠江牽製朝比奈泰朝。
　　同時，島津輝忠還派遣家臣潛入駿府與今川氏真談判。今川氏真也想領兵與島津大戰一場，但是很多家臣直接投降，只有岡部元信等少數幾人跟隨。
　　今川氏真無奈之下，隻好向北條以及武田求援，最終武田出動一千五百人的援軍，而北條家也出動了五千人支援。
　　今川氏真能夠求到援兵還是壽桂尼昏迷前已經寫好的書信起到了作用。沒多久，壽桂尼就病逝了。
　　沒了壽桂尼的今川氏真已經難以把持今川家，島津輝忠更是大肆宣傳壽桂尼之死，將今川氏真宣傳為壽桂尼扶持的阿鬥，沒了壽桂尼今川家必亡之類的。
　　今川家搖搖欲墜，但北條氏康是不允許駿河被島津攻佔，只能盡力支撐，但也不知道能撐幾年。
　　京都內，很多諸侯對於島津忠直成為征夷大將軍嗤之以鼻，織田信長確實被打開了一扇門，心中想道:島津忠直也可以做征夷大將軍，那我也可以掌控朝廷，做自己想做的事，先定個目標，拿下美濃，天下布武！
　　如今的美濃人心渙散的厲害，之前竹中半兵衛十七騎奪取稻葉山城，雖然沒多久就把城池還給逃跑的齋藤龍興，自己也引咎離開美濃，前往近江隱居，但是美濃大部分國人不再看好齋藤龍興。
　　織田信長抓住這個機會，立刻派人聯絡美濃的國人，同時讓收下木下藤吉郎修建墨俁一夜城，進攻美濃。
　　島津忠直廣邀天下諸侯，響應者寥寥，大家都在看著京畿爭鬥塵埃落定再說。
　　近江的六角家，淺井家都有動兵的跡象，越前的朝倉也在和本願寺來往頻繁。
　　島津忠直有感這些勢力聯手會對他形成一張包圍網，於是立刻傳令島津輝忠暫時停止南邊的攻略，並讓他進攻屯兵於加賀，隨時牽扯近江越前的勢力。
　　島津忠直的主力還在進攻攝津，並且還在聯絡播磨以及丹波的諸侯，不過這兩國的國人陷入了內部爭鬥，無暇顧及國外。
　　島津忠直隻好先一邊攻打攝津，一邊整合山城。
　　永祿八年三月，島津忠直在京都舉行繼位儀式，田山高政，松永久通，上杉家以及關東的幾位大小蕃主，都前來拜見，慶祝島津忠直擔任征夷大將軍。
　　當天，有竹中半兵衛前來拜見，島津忠直很是歡喜，收他為直臣。
　　隨後島津忠直繼續進攻攝津，攝津國人伊丹親興向島津忠直投降，島津忠直保留他十五萬石領地。伊丹親興大喜，為表忠心，主動領兵進攻池田勝正的領地，隨後島津家大軍也前來圍城。
　　池田勝正在重臣荒木村重的勸諫下向島津忠直投降，島津忠直保留他池田城附近的兩萬石領地。
　　至於真上、溝杭、茨木、能勢、鹽川等國人也在池田勝正投降後，紛紛投靠島津家。
　　三好義繼大驚失色，他連芥川山城都不敢久待，直接跑回阿波國。攝津還有一部分領地，隻留下了三好政康等幾人留守，三好長逸也跟著退回了四國。
　　隨著三好家敗退，田山高政也擊敗了遊佐信教掌握河內國，島津忠直與田山高政合流，進攻和泉的細川信良，細川家難以抵擋，只能投降。