在距離不動高校的校慶只有不到一個月的時間了，而學校卻決定拆除北館，但是在北館裡住著一個名叫做放學後的魔術師的家夥，他說他將會利用學校的七大不可思議來阻止那些要拆樓的人，而不動高校的推理小說部會長櫻樹琉璃子決定讓金田一一來調查，但金田一卻並沒有想到，一場危機正在降臨。

　　當下金田一叫上美雪一同來到不動高校，伴侶剛好路過一間房間。金田一問道:“哎，美雪，你知道這裡是什麽地方嗎?”

　　美雪想了想，說:“我記得這裡好像是印刷室，同樣也是七大不可思議上演的舞台之一吧，以前有一個學生在這裡印刷東西的時候手被切斷了，第二天老師叫上學生們去找但卻怎麽也找不到。於是從那之後這裡每天晚上就會傳來手的爬動的聲音。”

　　金田一大致了解了，然後便和美雪來到了推理社，但是裡面卻沒有一個人而牆上卻寫著幾句話:

　　“開啟第七扇門者，將成為儀式之貢品，吾乃，放學後的魔術師也。”

　　金田一不太理解這幾句話，這時，從門口傳來了一個聲音:“你們在幹什麽?”

　　金田一轉過身去，竟然是拿著攝影機的佐木龍太。而在他的身後還跟著尾之上貴裕與鷹島友代。

　　金田一問道:“難道你們也是被櫻樹學長叫過來的?”

　　佐木龍太剛想回答，突然，一個拿著手電筒的男人出現在他們身後，問道:“喂！你們是幹什麽的?這麽晚還在學校?”這個男人名叫立花良造，是學校的警衛員。

　　隨後，立花良造將眾人帶到警衛室，聽他們說了大致的情況後便決定和金田一去找一下櫻樹琉璃子。這時，金田一似乎注意到了在桌子上放著的推理小說會的周刊，想要拿來看看，可剛一伸手，就被立花良造一把甩開:“喂！這裡的東西都不要亂碰！”

　　金田一向立花良造道了歉後便一同與立花去尋找櫻樹琉璃子。

　　當他們路過走廊的盡頭時，突然，從盡頭的窗戶外面傳來一束很強烈的光芒，差點照瞎了兩人的眼睛。

　　金田一緩過神來，看向燈光的源頭。只見在窗戶對面的一個教室裡大開著門，而在門後是一個人被吊在天花板上，金田一很清楚地看出那個人就是失蹤的櫻樹琉璃子！而在櫻樹琉璃子的腳邊，是一個披著黃色的長發，拿著一束蠟燭的人，那個人轉了過來，那張臉頓時讓金田一和立花感到不快，因為那是一張面目猙獰，張著大嘴，露出兩排恐怖的牙齒。而這個人，正是“放學後的魔術師”！

　　金田一意識到那個地方正是生物教室，便和立花良造一同朝那裡奔去。當他們趕到之後，門已經被鎖的死死的，根本就打不開。這時，真壁誠路過，見金田一正在撞門。問道:“金田一?你怎麽會在這裡?”

　　金田一急忙地說:“我，我剛才看見放學後的魔術師把櫻樹學長吊在這裡面！”

　　“你說什麽?！”真壁誠不敢相信金田一的話，然後便一同上來撞門，只聽“砰”的一聲，生物教室的門被打開了，但是裡面卻只有雜亂無章的桌子，並沒有其他東西。

　　“不，不見了?”金田一不敢相信眼前所看到的場景，這時，其他人都趕到生物教室來。真壁誠問道:“喂，金田一，會不會是你看錯了?”

　　金田一堅定的說:“不！我沒有看錯！我真的看到櫻樹學長被吊在這裡！不信你們可以問立花先生！”

　　真壁誠不屑地看著金田一，

冷笑道:“你該不會是被什麽東西嚇到了吧，行了各位，我們散了吧。”然後，眾人紛紛離開了生物教室。　　第二天，在不動高校的門口出現了一輛輛的警車，而在生物教室門口圍著一大群學生，似乎在看什麽熱鬧。金田一和美雪剛好遇到，便擠進人群，但金田一頓時愣住了，因為在生物教室的天花板上吊著昨晚被放學後的魔術師稱為祭品，而消失在生物教室裡的櫻樹琉璃子！

　　當下，一個穿著棕色西裝，個子很高的警察帶著手下的警察疏散人群，而金田一見到那個警察，疑問道:“大叔，你怎麽會在這裡?”

　　那個警察驚訝地看著金田一:“金田二?”

　　金田一鄙夷地看著那個警察，說:“喂，大叔，我叫金田一！”

　　那個警察撓撓頭，尷尬地笑道:“對不起啊，因為太久沒有見到你了。”這個警察叫做劍持勇，是東京警視廳的警部。

　　隨後，劍持警部便和金田一開始對現場進行調查。

　　過了一會兒，金田一和劍持警部的調查結束了，突然，金田一好像想到了什麽，匆忙地朝推理社衝去。

　　劍持警部和美雪似乎也意識到了事情的不對勁，便跟上了金田一。

　　金田一來到推理社，然後便開始在推理社裡開始亂翻起來。這時。劍持警部和美雪也趕到這裡，美雪問道:“阿一，你在幹什麽?”

　　金田一一邊翻著櫃子，一邊說:“目前學校的七大不可思議我已經知道了六個。我想昨晚櫻樹學長應該是在打電話給我的時候就被殺了，所以在那之前，她應該有留下什麽關於第七個不可思議的線索。”

　　這時，金田一仿佛注意到了桌子上的電腦，便打開查看了一下裡面的內容，說:“果然櫻樹學長查到了，但是就差一步便可以將事情全部梳理清楚了。”

　　此時，尾之上貴裕走了進來，問道:“你們在幹嘛呢?”

　　金田一傻笑道:“啊，沒事，只是一些東西忘記拿了！”隨後，金田一朝帶著美雪離開了。但是他們卻忘記關了電腦。

　　尾之上貴裕似乎也注意到了電腦，便湊近去查看，突然，他好像明白了什麽東西，急忙將電腦畫面上的內容全部記下來。

　　金田一和美雪離開之後，正好遇上了劍持警部，金田一問道:“大叔，出什麽事了?”

　　劍持警部說:“那個名叫真壁誠的家夥說他已經知道了櫻樹死時密室的手法了。”

　　“什麽?！”

　　隨後，三人便朝生物教室走去，此時，在生物教室門口圍著一大群學生，而真壁誠正站在裡面。金田一等人擠進人群，真壁誠仿佛注意到了他們，說:“既然大家都到齊了，那我就長話短說吧。其實凶手構造這間密室的主要物品就是鋼絲！”

　　劍持警部驚訝的問道:“你說什麽?！”

　　真壁誠笑了笑:“當時凶手先把窗鎖的鎖柄上系上鋼絲， 然後另一段從煙囪口伸出並垂下。之後凶手在我們撞門的同時將屍體和其他東西全部搬出去，然後自己在從窗戶出去，之後再把外面的鋼絲一拉，窗戶就鎖上了。這樣就能夠輕易的將鋼絲從鎖柄上拿下來，構造密室了。”真壁誠說完便不屑地看了在場的所有人一眼，然後離開了生物教室。

　　劍持警部憤怒地看著真壁誠那得意離去的背影，說:“這個家夥可真是可惡啊，破解密室這件事不應該是我們警察做的嗎?關他什麽事?”

　　這時，金田一好像注意到尾之上貴裕沒有來，他認為尾之上可能正在推理社裡找什麽東西吧。

　　時間到了晚上，尾之上貴裕依舊在破解櫻樹琉璃子死前留下的訊息，但是他所並不知道，自己將要大難臨頭了。

　　當下尾之上貴裕坐在電腦前，認真的破解櫻樹琉璃子的死亡訊息。這時，一個拿著鐵錘的人出現在了他的身後。

　　尾之上貴裕仔細地琢磨電腦上的訊息，而那個人正在尾之上貴裕的身後用繃帶慢慢地纏繞著鐵錘的錘頭。突然，尾之上貴裕站起身，說:“原來如此，看起來第七大不可思議就是……”

　　尾之上貴裕話還沒說完，腦後就感到一陣重重的疼痛，因為那個人早已抬起手裡的錘子，砸向了尾之上的後腦。

　　尾之上癱倒在地，當他看到凶手的臉時，不禁呆住了:“你……是你殺了櫻樹學長?！”但是已經晚了，凶手早已一錘下去，讓尾之上貴裕成為了第二個犧牲品。