武藤遊戲的時代數十年後的童實野町，演變成了階級社會的未來都市——新童實野市。主人公不動遊星駕駛著決鬥盤的進化型D輪摩托以從下層區到上層區為目標奔馳。以奪走對自己和朋友很重要的卡星塵龍的為所欲為的競敵·騎乘決鬥的冠軍人物傑克·阿特拉斯所在的決鬥競技場為目標，終於遊星和傑克對峙了。懷著各自的堅定信念的他倆的王牌怪獸——星塵龍與真紅魔龍展開激烈衝突！在二龍之戰中忽然出現的神秘紅龍，讓遊星的手臂浮現出了龍之痣。由龍之痣所引導的各自的命運在這一刻開始了。到底為朋友而戰的遊星前面等待著他的會是什麽?！龍之痣所帶來的到底又是什麽呢?時代是遊戲王GX後的幾十年。編織著遊戲王歷史新一頁的新生動畫今春開播！！武藤遊戲等人曾活躍過的，數十年後的童實野町就是舞台。到底會是個怎樣的故事呢！?舞台是未來的童實野町！?超高層大廈聳立的未來近代都市——新童實野市。運用了高科技的競技場上召開以最尖端決鬥盤展開激鬥的決鬥大會！！決鬥盤進化！?騎乘決鬥大為流行！！在5D'S的時代，結合了摩托競速與卡片遊戲的競技騎乘決鬥，以騎乘型最新決鬥盤D輪進行的高速感決鬥十分流行，讓觀眾也跟著狂熱起來！！新怪獸陸續登場！！新動畫當然也是充滿各種決鬥場面！！從沒見過的怪獸們正極度活躍之中。敬請密切留意千萬別錯過強力怪獸！！

　　故事的舞台就是武藤遊戲等人曾經活躍過的、幾十年後的童野鎮。在未來的童野鎮擁有最新式設備的體育場中，流行的是一種以騎乘最先進的決鬥卡片，通過賽車的形式進行比賽的「RidingDuel」，故事就是以新主角不動遊星展開的……《遊戲王5D’S》以遊戲所在時代的數十年後的未來世界為舞台，地點在“新童實野町”，講的是18歲的主角不動遊星集結5龍卡的全新故事！在「5D'S」的時代，十分流行以騎乘型最新決鬥盤進行的高速決鬥！遊星與使用決鬥盤和卡片遊戲組合的競技之王傑克?阿特拉斯進行對決。另外還有一旦戰鬥就會發揮出超能力的謎般少女十六夜，以及仰慕遊星的雙生子:哥哥龍亞與妹妹龍可，從小就投入到了激戰中去。他們會為大家帶來什麽樣的精彩戰鬥場面呢?