相對於李自成的大順軍而言，張獻忠的大西軍敗亡的速度就更快了。

　大西軍剛佔據四川大半個省以後，張獻忠也不是不積極進取。他在崇禎十六年秋冬，趁著李自成的大順軍主力攻略北京，而陝西、漢中等地，大順軍兵力空虛的機會，命孫可望往取漢中，想要來個虎口拔牙。

　可對於漢中這個西北地區的軍事要地，大順軍也是相當重視，再加上大西軍的實力實在是不如大順軍，所以孫可望部在漢中，被李自成部將賀珍擊敗。之後，張獻忠親率大軍前往救援，並命部將劉進忠入據保寧府，部將馬元利克順慶守之。由於懼於大順軍的兵鋒，兩軍也就互相對峙，暫時陷入了膠著狀態。

　接著，為了保證四川的安全，張獻忠派平東、虎威二將軍，向北平定漢南地區。又命都督張廣才早滅曾英，以便打開東下的道路。此年冬，大西軍其名、張廣才兩軍齊發，卻不知李自成早已用賀珍替換馬爌為主帥。結果大西軍的三萬兵馬又被賀珍部擊敗。

　屢屢慘敗之後，張獻忠也就沒了爭霸天下的雄心。再加上他的間歇性精神病頻繁發作，所以一手炮製了其控制區內，慘絕人寰的大屠殺。

　由於對農民軍的勢不兩立的立場，再加上張獻忠的大屠殺，四川各地的明將曾英、李佔春、於大海、王祥、楊展、曹勳等，紛紛聚集兵馬。襲擊大西農民軍，屠殺大西政權地方官員，給大西政權很大威脅。對此。張獻忠進行了嚴厲的鎮壓，但也在這種平叛中疲於奔命。

　張獻忠的大西軍，除了與明朝在四川的殘余軍隊對抗外，還要同四川的地主武裝作鬥爭。原川陝總督樊一蘅仍任原職，南明弘光朝廷又任命原大學士王應熊為兵部尚書，總督川湖雲貴軍務，並賜尚方寶劍便宜行事。駐扎遵義，主持對張獻忠作戰。

　崇禎十六年十一月，南明四川巡撫馬乾派副將曾英帶兵攻陷重慶。接著。閣部王應熊會兵遵義，副將楊展、屠龍、莫宗文、賈登聯等請複川南。並起甘良臣為總統，副以侯天錫、屠龍，合參將楊展。遊擊馬應試、余朝宗所攜潰卒。得三萬人。接著於三月攻陷敘州，大西軍損失一千余人。

　同時，副將曹英、參政劉鱗長及部將於大海、李佔春、張天相等，都受樊一蘅節製，有兵十余萬。他們不斷地向大西軍發動攻擊，想要恢復失地。所以在川南與川中形成了一條犬牙交錯的戰線，南明軍隊與大西軍展開了你死我活的戰鬥。

　穹源元年正月，全大山率兵九萬。出兵四川。一入川，原大順朝四川節度使黎玉田(原先是明朝遼東巡撫)、總兵馬科(投降大順後被封為懷仁伯)、副總兵馬德、高汝利、石國璽等官將領著士卒一萬多人歸順大平朝。接著。漢南副將胡向化所部士兵一萬余人也歸順大平。未發一彈一矢，全大山部就來了一個開門紅。

　接著，接連失去了兩支主力部隊的賀珍，覺得大勢已去，率殘余的大順軍入川主力二萬余歸降大平軍。這麽一來，大順軍在四川的遺產就被全大山部全盤接受。而且這四萬兵卒都是能征善戰的老兵，再加上那些官員、將領都熟知四川的人文地貌，使得全大山部的四川戰役就進行得更為順利了。

　而在此時，張獻忠正率大西軍主力在川南、川中地區，與南明的軍隊鏖戰。南明參將楊展領兵複奪川南州縣，率師北指，與張獻忠的大西軍主力激戰於彭山的江口，張獻忠大敗，退回成都。

　於是楊展由南面逼向成都。王應熊又派曾英為總兵，王祥為參將，聯師進攻，阻擋大西軍的東下。由於張獻忠的大屠殺，導致以川軍為主的南明軍瘋狂報復，他們也對沿途的“附逆”百姓也展開了大屠殺，四川民眾再遭厄運。川中百姓何其苦也！

　可是由於南下的大平軍威脅大增，三月，為了北上抵抗大平軍的南下，張獻忠決定放棄成都。並盡殺其妻妾子女，一子尚幼，亦撲殺之。

　並且張獻忠還對孫可望說:“我亦一英雄，不可留幼子為人所擒，汝終為世子矣。明朝三百年正統，未必遽絕，亦天意也。我死，爾急歸明，毋為不義。”

　而張獻忠這一瘋狂的舉動，也許是想要安撫孫可望這些義子之心，他要向孫可望他們證明:大西軍的遺產將不會傳給自己的兒子，而將由孫可望等人繼承。要以此來換取孫可望等人的忠心。不過虎毒都不食子，張獻忠這樣的行徑會否有用?那不得而知。但肯定能證明:此時的張獻忠，他的腦溝回路已經是異於常人了。

　接著，張獻忠分兵四路，並命令四位將軍，各率兵十余萬向北進發。三月間，張獻忠率大西軍主力十萬離開成都，北上迎擊大平軍。五月，張獻忠大軍扎營於西充鳳凰山。

　當然，這時候大西軍的總兵力也只不過有十多萬，那些軍隊的數量其實都是號稱罷了。

　當張獻忠帶兵北上，路過金山鋪時，他再次狂性大發，任意斬殺百姓，甚至包括自己的部隊，欲肅清新附不堅者。而在大平軍大軍壓境之時，有些大西軍將領就看不下去這樣的瘋狂舉動了。於是劉進忠就諫曰:“生靈不可妄殺也。”

　對於這樣的諫言，張獻忠當然不納，他反而要調動劉進忠部回金山鋪匯合。劉進忠疑之，之後毫不猶豫地率其部二萬兵馬向北，全軍歸降了全大山的四川軍。

　好家夥！全大山進入四川仿佛不是來打仗，倒像是武裝巡遊，去接收和改編歸降的部隊去的。

　全大山的四川軍以劉進忠為向導，帶領四川軍進入川北。穹源元年五月二十六日，全大山派賀珍、馬科等將領，分三路率四川軍騎兵部隊輕裝疾進，出其不意，對大西軍發起突然襲擊，大敗大西軍主力。

　二十七日晨，四川軍隔太陽溪與張獻忠的大西軍相遇。面對這意外的突然來襲，張獻忠臨急應戰，指揮大西軍馬步兵分兩面抗擊四川軍。

　這時，全大山率四川軍主力趕到，遣將領高汝利等向大西軍右翼進攻，將領石國璽等攻擊大西軍左翼。戰鬥伊始，一度打得非常激烈，高汝利等戰死，大西軍也遭到了慘重的損失。

　可是當全大山中軍處，原汝寧軍的戰旗徐徐展開時，大西軍將士又發現了原戰友——劉進忠率其部衝鋒。飽收張獻忠猜忌濫殺的大西軍將士頓時崩潰，全軍潰逃。

　而張獻忠根本是猝不及防，他沒想到潰敗得是如此之快。就是猶豫的一瞬間，停留在原地的張獻忠，就與他的二十幾名親兵護衛都裸露到了陣前。

　由於張獻忠身著蟒袍，又有劉進忠的指認，這樣明顯的目標，頓時引來四川軍的萬槍齊射，萬箭齊發。張獻忠隨即轟然倒斃，時年僅四十歲。

　張獻忠死後，一些忠心耿耿的大西軍將士從陣中搶奪回屍首，並以錦褥裹屍，埋於僻處，隨即遠遁。而四川軍就從俘虜口中得知了張獻忠屍體的下落，梟其首，獻於京師。

　此戰過後，大西軍殘留的十余萬兵馬，被四川軍斬殺、俘虜、歸降了五萬多。除了一部分潰散民間以外，張獻忠的部將孫可望、劉文秀、艾能奇、馮雙禮等，率領大西軍殘部二萬余向南，並在重慶受到明軍曾英部的阻擊。

　而此時的大西軍顯出了困獸猶鬥的狠勁，一番激戰以後，大敗南明軍，並擊斃守將曾英。之後，這支大西軍殘部繼續向貴州方向轉移。後與南明聯合，在西南地區共同抗擊大平軍。

　而趁著大西軍與全大山的四川軍決戰，南明軍趁虛進入了成都平原，並佔領了成都。之後，四川的戰局就演變為四川軍與南明軍的對戰了。

　不過這樣的對峙也並沒有延續多長時間。在幾個月之後，南明也土崩瓦解。這使得在四川的南明軍也大多歸降了大平朝。只有一小部分的人馬，繼續南下貴州、雲南等西南省份， 以此來做最後的抵抗。

　而江澄、趙德功和薑瓖率領的大平軍，他們一直尾隨追擊著高一功、李過部，在很短的時間之內，也平定了甘肅等西北邊陲之地。由於也有大批的大順軍歸降，他們的部隊總人數也很快膨脹到了近七萬。

　在短短十個月的時間內，大平軍以原汝寧軍二萬五千多人為核心，橫掃了整個大西北和四川省。最終的兵力竟然膨脹到了五十六萬之眾。雖然這些部隊分為了三部在各自行動，戰鬥力也參差不齊，但從人數上來說，這已經是大平朝中最龐大的一支部隊了。

　而李自成的大順軍和張獻忠的大西軍，當他們面對著大平軍的進攻時，簡直就像倆個虛弱的巨人般轟然倒地。而大平軍也摧枯拉朽般，接連摧毀了這兩大勢力。

　當這樣的戰果呈到吳世恭和大平朝廷時，大平君臣都為之怎舌。而朝中一小撮懷疑大平朝難以長久的問號，都為之一掃而空。

　可是大平朝在穹源元年正月，出征的部隊還不僅僅是征西軍這一路，圍繞山海關與滿清的戰鬥也同樣是打響了。