從第五章開始進入原來後續的主線劇情，由於參與征文需要，調整劇情順序。

　　這部分的子標題是:一劍凌雲，定三清

　　逐鹿之戰後，九黎族大部分族人遷徙至他處，部分九黎族族人與黃帝、炎帝部落融合共同發展。

　　聯合部落在黃帝的幫助下，加上新的棲息地居住條件改善，人口快速增長並獲得了文化方面的發展。

　　與蚩尤大戰之後，束縛軒轅劍神魂之力的極薄煙霧破裂，天女以血打開裂縫，以神魂湮滅為代價破除束縛煙霧，每想至此姬軒轅都痛苦不止。

　　破除束縛之後，軒轅劍似對周邊之靈氣有極強的吸引，所幸的是，當前手持軒轅劍的是黃帝姬軒轅。黃帝以其催動控制神魂的特殊力量，始終控制著軒轅劍對外界靈氣的吸收之力。

　　但是軒轅黃帝終究非神，或許這個世界真的存在過神嗎?

　　隨著黃帝的逐漸老去，其催動和控制萬物神魂的力量逐漸降低。