按照木葉紀年，此時的世界步入了木葉46年的風起雲湧。
　　對於忍界各地的人們來說，在第三次忍界大戰進行的過去三年間，他們看到了太多同伴的犧牲，整個陸地上被破壞殆盡的場景隨處可見。
　　比起宇智波花月在水之國小島上渡過的與世隔絕修煉隱居生活。
　　現在，小島外的忍者世界正在陷入更大的混亂中。
　　戰火，硝煙，陰謀…
　　數雙隱藏在黑暗中的手，正在推進著第三次忍界大戰的進一步升級。
　　這一切仇恨與對立的最大幕後boss，無疑是自認為書寫了忍者歷史，天下第一孝子黑絕。
　　而他在這個時代選擇的兩名代言人:想重現無限月讀為世界帶來和平的宇智波斑;和一心為漩渦一族復仇，不惜花費數十年在忍界各地一磚一瓦布局，終於迎來收獲期的漩渦宗河，都完美地完成了各自的使命。
　　……
　　兩年前，一直想為父母報仇的赤砂之蠍，收到了漩渦宗河提供的關於木葉白牙旗木朔茂的位置情報。
　　作為陰謀者提供給他消息的報償，蠍殺了三代目風影，襲擊了火之國邊境小村莊，並重傷了木葉白牙旗木朔茂，由此引起了砂忍和木葉的誤解和大戰。
　　雖然這場上升到出動砂忍村人柱力的戰爭以木葉的勝利告終，但也無疑拉開了忍界大規模戰爭——第三次忍界大戰的序幕。
　　這是忍界歷史上前所未有的戰爭規模。
　　數萬忍者，數百萬平民卷入了這場戰爭，造成了無數失去家園的流民和失去家人的孤兒。
　　戰爭的第一階段，砂忍與木葉的戰爭以木葉獲得正面戰場的勝利和捕獲了一尾人柱力結束，雙方宣告休戰後，砂隱因村子空虛而被岩隱進攻。
　　岩隱參戰，戰爭規模進一步擴大。
　　戰爭第二階段，岩隱與砂隱，木葉，三方對峙。
　　一時間，忍界大陸西北陷入三國混戰的局面。聯盟與背叛戰與和，和與戰，在這三方之間反反覆複。
　　而進入木葉46年後的1月，一直作壁上觀的雲隱村終於按捺不住趁火打劫的心態，毅然加入混戰圈。自此戰爭進入第四階段。
　　虛弱的砂隱退出戰爭。
　　雲隱村與木葉村，雲隱與岩隱村展開對峙。
　　第三次忍界大戰全面爆發，迅速蔓延至了整個忍界大陸。
　　原本，雷影和土影曾經有秘密計劃，同時進攻木葉，形成對木葉的重重包圍，最大限度消耗木葉的實力，讓木葉成為最大的輸家。
　　但誰知道，三代目火影猿飛日斬更是個老狐狸中的精怪，他派出了傳說中的三忍中其二:大蛇丸，綱手，以及宇智波一族前往木葉與岩忍前線，進行防禦。
　　大野木一看這個木葉的超強陣容，果斷決定反戈雲忍，柿子當然要撿軟的捏。
　　……
　　雲隱村也不是什麽正義之師。雲隱村看到了岩隱村遇“木葉不敵”，另一面遭遇他們的情況後，在與岩隱村世仇的推動下，派出奇襲部隊進攻岩隱村。帶領雲隱進攻岩隱村的，正是三代目雷影。
　　其實，由三代目土影兩天秤大野木這隻老狐狸主導的岩隱村，進攻木葉是假，在土之國邊境虛位以待等著雲忍們送上門是真。
　　於是，在木葉紀年46年，2月5日，埋伏已久的岩忍們成功把打上門來的雲忍們包了餃子。
　　這場在兩個忍者村三代目影領導下的岩隱與雲隱大型會戰，岩隱方面出動了人柱力，在雙方各自傷亡巨大後，以雲隱失敗而告終，死傷達2000眾。
　　對比起在忍界大陸北方發生的老一輩影之間的戰鬥，第三次忍界大戰，也進入了年輕人的時代。
　　為什麽雲隱對岩隱的正面戰役失利?
　　因為他們還年幼的二尾由木人留守雲隱村，而正值壯年的完美人柱力八尾奇拉比，並沒有被派到對岩隱作戰前線，而是到了雷之國與火之國的邊境，對火之國與木葉村防線虎視眈眈。
　　木葉與雲忍村的對峙前線有新出名的木葉新一代強者“黃色閃光”和自稱成仙的自來也，善謀的奈良鹿久，以及秋道等各大忍族，雙方爆發著大大小小的衝突。
　　木葉邊境哨所裡，帶著小隊巡邏的，已有“金色閃光”之名的波風水門，與雲隱村新一代AB兄弟更是已經交手過招數次。
　　……
　　2月9日，在土之國被埋伏，傷亡慘重的雲忍們準備從中立的湯之國撤回雷之國。
　　沒人想到，在他們的這條回家生路上，漩渦宗河早已在雲隱必經的湯之國布置好另一個大陷阱，勢必要向漩渦一族滅族事件罪魁禍首的三代目雷影復仇。
　　岩忍和隱藏在暗中的漩渦復仇者們聯手，驚心動魄的殺影之戰，已然開始。
　　2月10日
　　湯之國·無盡草原。
　　面對著上萬名岩忍以及旋渦特供多重結界的圍困。
　　為剩下的雲忍返回雷之國而殿後的三代目雷影，遇到了此生最危險的時刻。
　　他是擁有最強之矛——雷遁，一本貫手，和最強之盾——雷遁護甲，的當界頂級強者，但他卻無法突圍。
　　這些隱姓埋名了數年的漩渦遺族們，創造了前所未有堅固的防禦結界，讓他就算以再快速度突圍，都無法離開這片無盡草原。
　　一身忍界頂級的雷遁無疑陷入了某種憋屈至極的情況中，
　　狡猾的岩忍們輪番使用風遁猛攻他，風克雷，三代目雷影被查克拉屬性克制，查克拉每分每秒都在消耗，
　　“大野木在哪裡！！你這個背信棄義的家夥，來當當正正對決啊！！”又一次打退了進攻的一批岩忍後，三代目雷影發出了憤怒的咆哮。
　　“哼，莽夫，想用激將法可太天真了，一點都沒有影的風度。”三代目土影兩天秤大野木就在不遠處的空中觀戰。
　　由於圍攻的岩忍眾多，大野木不能使用塵遁，但這不妨礙他為周圍的火遁忍者使用土遁超·輕重岩之術，助他們飛在空中，360度對困獸般的三代目雷影進行火遁圍攻。
　　在包圍圈外的漩渦宗河與旋渦洵一起加厚著層層結界，絕不讓雷影這隻困獸再有任何突圍生還的可能。
　　這位頭髮白中帶紅的老者漩渦宗河眼中，帶著報仇終成的快意:“你的時代結束了，三代目雷影。”