蘇峻與太寧二年王敦之亂中平亂有功，威望日隆，且手握精兵，武器精良，變的驕縱，收容亡命之徒，隱匿逃犯。中書令庾亮誅滅意圖叛亂的南頓王司馬宗，其黨羽卞鹹的哥哥卞闡逃到蘇峻處，庾亮讓其送還，蘇峻並未聽命，認為其會引發禍亂，於是固執的堅持己見以明升暗降的手段欲奪其兵權，從而逼反了蘇峻，蘇峻同時聯合了，對朝廷已經心懷不滿的祖約聯手討伐庾亮，祖約也是不顧部下的勸阻，派侄兒祖渙與女婿許柳合兵一處，正式起兵。

　　溫嶠此前在蘇峻為受命下，打算率兵保衛建康，以防蘇峻起兵，庾亮不許，之後的一些抵抗策略也都被庾亮否定了，導致朝廷大軍節節敗退，丹楊令羊曼、黃門侍郎周導、廬江太守陶瞻、卞壺皆戰死，大軍已經組織不起抵抗，庾亮於是帶著三個弟弟和其他兵將逃往潯陽。①

　　之後庾亮與溫嶠一塊商議討伐蘇峻，倆人互推盟主皆辭，後推薦征西大將軍陶侃，接著聯絡各方將領共同討伐蘇峻、祖約。之後兩軍相持不下，蘇峻則分派諸將四處攻掠，群情恐懼。與此同時，晉軍大將毛寶打敗祖渙，攻佔合肥，壽春也被羯趙攻佔，蘇祖聯軍實力大損，但依舊不落下風。但是戰局卻頗具戲劇性的發生了根本性的轉變。

　　溫嶠與趙胤與盤踞石頭城的蘇峻對壘，他們聽說陶侃大軍已經挺進石頭城②，於是膽子就肥了，派出一萬步兵出戰，蘇峻看了毫不畏懼，立刻領八千精兵出戰。蘇峻自然沒將這些人放在眼裡，邊飲酒邊戰，初戰蘇峻的兒子蘇碩勇猛異常，率領十幾名親兵反覆衝殺，殺退溫嶠大軍大亂。蘇峻看到自己兒子那麽勇猛，心裡美滋滋的，喝了不少的酒，喝的醉醺醺的卻吧願甘居兒子之後，於是單騎縱馬衝向了敵軍，也許蘇峻忘了招呼手下，加上自己的坐騎本來就是快馬，所以都沒人跟上去，一看手下沒跟上來，馬上調轉馬頭，返回白木坡，結果因為喝醉的原因墜馬，而此時陶侃部將彭世和李千早已發現他就是蘇峻，於是投擲長矛，蘇峻被殺，討伐軍士氣大盛，蘇峻軍很快潰散。

　　蘇峻軍之後在任讓主持下，立蘇逸為主，閉城自守。於是討伐軍展開反攻，管商等人向庾亮投降，溫嶠設立行台③，命全國而千石以下故吏到台。後陸曄和尚書左仆射陸玩遊說匡術而降，而右衛將軍劉超侍中鍾雅等人則密謀帶走晉成帝，投奔陶侃軍，但計謀泄露，蘇逸於是派任讓入宮收捕二人，成帝抱著二人哭著說:“還我侍中、右衛！”不過任讓還是帶走並殺害了二人。趙銀還派遣甘苗攻擊歷陽的祖約，祖約連夜帶數百人逃往北方，之後歷陽投降。討伐軍向石頭城進攻，大破蘇逸之眾。溫嶠臨陣斬蘇碩，晉西軍又擊殺蘇逸，晉成帝乘機逃出宮城，投奔溫嶠，諸臣見帝，頓首號泣。隨後殺叛臣西陽王司馬漾並其二子及彭城王司馬雄。先前殺晉將劉超和侍中鍾雅的任讓亦被成帝處死。叛軍將領張健、韓晃、馬雄一路難逃，獲報被誅殺。至此，蘇峻、祖約叛亂全部平定。

　　蘇峻、祖約亂平後，建康被毀嚴重。溫嶠欲遷都豫章④，三吳之豪奏遷於會稽⑤，雙方爭論激烈。司徒王導以為“建康王者之宅”，今特宜鎮之以靜”，群情自安，於是遷都之議平息，建康仍為東晉都城。之後大賞群臣。陶侃因功大為侍中、太尉、封長沙郡公;郗鑒為侍中、司空、南昌縣公;溫嶠為驃騎將軍、開府議同三司，加散騎常侍、始安郡分;陸曄進爵江陵公，其余賜爵侯、伯、子、男者甚多。卞壺、桓彝、劉超、鍾雅等死難者均加贈恤。陶侃移鎮巴陵⑥，溫嶠還鎮武昌⑦。庾亮複與成帝相見，泥首謝罪，求外鎮自效，於是出任豫州刺史，領宣城內史，鎮守蕪湖⑧。與此同時，參與蘇峻叛亂的路永、匡術、賈寧等人中途叛峻歸朝，赦其罪不治，湘州刺史卞敦在蘇峻叛亂中首鼠兩端，受到朝廷冷落，憂愧而死。

　　注1:潯陽即九江

　　注2:石頭城最先築於楚威王七年，東漢建安十六年，吳國孫權遷至秣陵(今南京)，在石頭山金陵邑原址築城，取名石頭城。有“東吳第一軍事要塞”之稱。

　　注3:行台，尚書台(省)臨時在外設置的分支機構。

　　注4:豫章即南昌

　　注5:會稽各朝代有部分變遷，東晉轄境大致相當於今紹興市、寧波市除寧海、象山的其余地區及杭州市蕭山區一帶。

　　注6:巴陵即嶽陽

　　注7:國時孫權在今鄂城建都，名武昌，不久在現在的蛇山築城，稱夏口，後晉朝將江夏郡改為武昌郡，故非今之武昌

　　注8:蕪湖，安徽省境內。