經過漫長的旅途，小智他們今天來到了抹茶市。　　“皮卡~”，因為迷路，所以是走過了一段比較波折的路，大家這是坐在公園的椅子上，皮卡丘顯得很累的叫著。

　　“知道了啦，皮卡丘，馬上就帶你去神奇寶貝中心”，而小智則是討饒的對皮卡丘說道，小霞則是和波加曼、可達鴨在一旁喝冷飲，非常的愜意。

　　“發生什麽事了啊”，到達神奇寶貝中心後，就看到喬伊小姐正在接著左一個電話右一個電話，非常的忙，而吉利蛋也在到處急匆匆的跑，小剛非常不解的說道。

　　“是這樣的，從早上就接到好多的投訴電話，說傳送的神奇寶貝沒有傳送過去”，喬伊小姐解釋說。

　　“這不可能，這套傳送裝備是我親自製作的，不管硬件還是電腦程序都是沒問題的”，而這時一旁帶著老花鏡的一個看起來像科學家的大叔突然說道。

　　“啊——，這是——，可能——”，這時大叔看著電腦屏幕中的紅點驚訝的說道。

　　“秋葉原博士，發現什麽了嗎?”喬伊小姐聽了大叔的話立刻問道。

　　“啊，沒什麽~”，博士有點不自然的說。

　　“可能是由電腦病毒引起的吧”，小剛這時在一旁猜測說。

　　“不可能，傳送裝置使用的最先進的技術，絕不可能進入病毒的”，而博士這時大聲的喊道。

　　“但是，事實上……”，而喬伊小姐在一旁則說道。

　　“不可能的，不可能的——”，不過博士這時大叫著跑出去了。

　　“好了，就是這裡了，這裡就是秋原博士的研究所”，因為被喬伊小姐拜托來看一看秋原博士怎麽了，所以按照喬伊小姐給的指示，小智他們來到了一所房子前，看著這所有點舊的房子，小智說道。

　　“小智，等一等，先把3D龍放出來”，就在小智和小剛想進入房子的時候，小霞這時說道。

　　“哦，好”，小智雖然不解，為什麽小霞要自己放出3D龍，不過還是立刻就把3D龍放了出來。

　　“好了，收起來吧”，在把一個道具給3D龍戴上後，小霞又再次說道。

　　“小霞，你給3D龍戴的什麽?”小智一邊收回3D龍，一邊問道，而小剛在一旁也是很好奇。

　　“是升級卡片，效果嗎，待會兒就知道了”，小霞一邊笑著一邊說道。

　　“隨意進入人家的房子不好吧”，小智、小霞和小剛隨後進入了秋原博士的研究所，小剛這時說道。

　　“不要在意了嘛”，而小智則是嘻哈的回答說。

　　“啊~，這是……”，這時突然在他們眼前出現了一個大大的秋原博士的頭，小剛吃驚的喊道。

　　“你們看，這只是一個機器，把逼真的影像投射到空中罷了”，而小霞則是指著這個頭像說道，隨後小智和小剛才松了一口氣。

　　“被你識破了嗎?”那個頭像尷尬的說道，“你們幾個似乎很聰明嗎，很好，跟我來”，隨後小智他們就在秋原博士的邀請下向裡走去。

　　“進去裡面吧，沒問題的”，隨後到了一些機器旁，秋原博士讓小智他們進入一個大大的玻璃罩內，而小智他們則是連想也沒想的進入了，隨後就把門關閉了。

　　“這是怎麽回事，你想把我們關起來嗎?”這時小智才慌亂的一邊錘著玻璃罩，一邊立刻問道，然後就在秋原博士的解釋下，小智他們知道了自己進入了一個神奇寶貝傳送的機器裡，而且也知道了神奇寶貝傳送出錯的原因，

原來是火箭隊偷走了博士製造的神奇寶貝3D龍零號，而後進入了網絡中進行盜竊，並且被委托進入網絡去把火箭隊抓起來。　　“好了，我們趕緊啟程吧”，知道了原因，小智這個熱血的人立刻就同意了博士的話，然後說道，小霞和小剛隻好跟著同意了，然後三人及皮卡丘和波加曼就被傳送進了網絡世界，當然小霞已經把可達鴨收回去了。

　　“這是哪兒?”小智一邊下落著，一邊問道。

　　“網絡世界，我們已經進入網絡世界了”，而小霞在一旁則是回答說，而且內心也有點不太確定，畢竟這也是很令人匪夷所思的事件。

　　“現在不是聊天的時候”，而這時小剛則是急匆匆的說道，而小智也才反應過來他們在下落。

　　“啊~，這可怎麽辦”，小智也隨後慌亂的喊道。

　　“不要慌，把3D龍放出來”，小霞則是稍微有點震驚的說道，畢竟在下落，是個人也會害怕的。

　　“哦，3D龍，出來吧”，小智反應過來後立刻就派出了3D龍。

　　“這是……”，而後就看到3D龍開始發出白光，小智吃驚的說道。

　　“是進化”，小剛在一旁也看著說道。

　　“這是3D龍II，假想神奇寶貝，是3D龍的進化型，而且這可是關東地區沒有的神奇寶貝哦”，小霞看到白光散去的3D龍II，隨後變大，接住了她們，這才解釋說。

　　“太好了，3D龍你進化了”，而小智聽完後高興的和3D龍聯絡感情去了，而小剛則是一臉的遲疑，看來已經想到小霞在門口給3D龍帶的升級卡片和現在進化的聯系了，不過他也知道小霞是不會害他們的，而且小霞的秘密也不止這一個，所以也就沒有深問，而小霞當然也不會說自己知道這裡會被傳送，才給3D龍攜帶升級卡片來通信進化的，小智這個已經高興的已經不能再高興的孩子更就不可能問了。

　　“那些就是網絡高速公路，順著這些傳送神奇寶貝的路線，我們就可以找到火箭隊了”，隨後就在3D龍II背上，大家沿著一些路線開始前進，而小剛也說道。

　　“為了防止世界被破壞”，“為了保護世界的和平”，就在小智他們找到火箭隊的時候，他們正在高興的念開場白呢。

　　“喂，火箭隊，就是因為你們神奇寶貝中心才陷入一片混亂的，現在立刻出去”，而小智這時則是大聲喊道。

　　“又是這些家夥喵”，喵喵看到後立刻開始慌亂了。

　　“交給我們吧，去吧，阿柏怪、雙彈瓦斯”，而武藏和小次郎則是立刻派出了阿柏怪和雙彈瓦斯。

　　“在網絡世界了展現你們的勇氣吧喵”，喵喵很有氣勢的喊道，然後阿柏怪和雙彈瓦斯就向這邊衝了過來。

　　“那是什麽?”不過3D龍II立刻放出了一個絕招，就把衝過來的阿柏怪和雙彈瓦斯打了回去，而小智則是不認識這個絕招。

　　“是三角攻擊，普通系的絕招，而且還有幾率是對手灼傷、冰凍或麻痹”，小霞解釋說，她也沒想到3D龍進化後學會了三角攻擊，看來可能是絕招已經都換了。

　　“我們用3D龍來打吧喵”，喵喵這時看著小智他們則是說道，而後武藏就派出了偷來的3D龍零號機。

　　“去吧，3D龍II”，而小智也讓3D龍II上場了，然後就看到3D龍零號機使用了衝擊向這邊撞來，不過3D龍II使用了高速移動躲開了攻擊， 隨後一道藍紫色的射線打向了3D龍，原來是信號光束，而小智也在一旁激動的看著，畢竟3D龍II學會了新的招數。

　　“小剛，我們趁這個時候修一下線路，是神奇寶貝傳送可以正常吧”，小霞知道時間緊迫，要不然可能會被電腦疫苗消滅，所以就和小剛開始修理線路，小智則是和3D龍II拖住火箭隊，就在小霞和小剛修好線路後3D龍II也把3D龍打趴了。

　　“好了，我們趕緊回去吧”，而後小霞就立刻說道，她實在是不想在這裡待下去了，誰知道喬伊小姐會不是使用電腦疫苗呢。

　　“不好了，你們趕緊出來吧，喬伊小姐請來了專家，使用了強力的疫苗，你們在不出來就要被消滅了”，這時從3D龍零號機裡出來了秋原博士的影像，並且說道，而這次因為處理的比較順利，而火箭隊也聽了後非常的害怕，所以和小智他們一起乘著3D龍II立刻就逃出了網絡世界。

　　“你們給我記住，這不是火箭隊的真實實力，但是，今天，謝謝你們……”，火箭隊在出來後撂下這句話就跑了，而小智、小霞和小剛也懶得理他們，就由他們去了。

　　隨後大家回到了神奇寶貝中心，傳送裝置又可以正常運作了，而喬伊小姐他們也不知道小智、小霞和小剛的冒險，而是以為是疫苗的作用。

　　而後小智在小霞的建議下，用3D龍II交換來了小磁怪，而大木博士在接到3D龍II後，立刻就吃驚的說不出話來了，立刻掛斷了電話，看來是去研究3D龍II，隨後大家就踏上了旅途。