就在沐劍聲的西路軍捷報連連之時，東線的劉國軒部也有所斬獲，經過一月的苦戰之後，先是拿下了北線的寧都和石城兩縣，掃除了自身側翼的威脅，補充了軍力，擴大了佔區和戰略縱深。隨後又經過連續十多天的血戰，於十月中旬成功拿下於都縣城，從而打開了贛州的東大門，這樣明軍就取得了階段性的勝利，分東西南三線逼近到了贛州城百裡以內，整體戰略態勢已經極為有利。

　　此時贛州附近的清兵，還有八九萬人之多，為了避免被分割包圍，他們采用重點防禦的辦法，主動放棄了外圍較遠的隘口，後退抱團成刺蝟一般，依照贛州城外山水環繞的特點，另外在東面的茅店、南面的大峰山、和西面的鳳崗一帶建立了三個品字型的固守工事，來防守三個方向的明軍。而贛州城的軍隊則可以隨時可以接應這三處關隘，三處關隘也可以互為援助，如同刺蝟一樣龜縮成團，這樣雖然整體兵力不如明軍，可是作戰形勢反而佔優，戰力大漲。

　　此外，希爾根又派水師守護住城北的碼頭，保證河運的暢通，為自家留下後路，防禦策略可謂萬無一失。由於贛州城河流環繞，船隻都被清兵收攏，而明軍的水師卻都在海上和珠江流域，這樣贛南明軍的進退移動都受到了很大的限制，清兵佔得水上的優勢，又面對兵力聚集一團的敵軍，就給攻城的明軍一方造成了很大的困難。

　　面對這種情況，明軍只有兩個辦法，一是長期圍困，等待敵軍糧盡，二是加強水軍力量，然後設法打破僵局，破圍而入，經過研究考慮，沐劍聲決定采用圍困與破局結合的辦法。

　　此時清兵分為五個要點進行防禦，猶江、貢水和贛江把戰場分為了幾大塊。眼下由於江河水勢很盛，沒有水師助戰，明軍的移動受到極大的限制，為了防止被敵軍分割包圍，沐劍聲隻好把主力集結在城南一線，同時把自家在江西的草台水軍的大本營前移到於都，這裡的水面要比會昌附近寬闊加深了許多，可以浮起更大一些的船隻，利於建造更加大一些的船隻。

　　經過前期幾個月的準備發展後，由於明軍軍紀嚴明，深得當地民心，所以很快招攬到了一批當地的老船夫和纖夫。他們對於附近各條大河的水文都十分熟悉，有了這些識途老馬，明軍的水師發展很快，已經成功的搜集到了三十余條小船，又新建了近百艘小船，另外還有木筏竹排等數百隻，水師已經初具規模，人員發展到了兩千余人。

　　不過由於缺少擔當核心戰力的中型船隻，所以還無法形成有效戰鬥力，更無法與駐扎贛州的清兵水師交手，於是沐劍聲隻好繼續加派工匠船夫，開始在於都碼頭建造中型的河運船隻，並且下令繼續拓寬整修陸上大道，進而通過陸路，輾轉從南平將一批中小型的艦炮輾轉運送到於都，準備加裝到新建的船隻上面，提升其戰鬥力，力爭在以後能夠抵擋進而壓製住清兵的水師。

　　經過估算，即便不考慮長久的壽命，省去一些工序，一艘小型的戰艦也需要兩個月時間才能造成，即便同時建造十艘，想要形成規模，也需要二十艘往上。這樣算來，就需要近半年的時間才能完成，再加上後續的適應和練習，恐怕需要近一年的時間，雖然這個過程耗時會比較長，不過沐劍聲認為必須這樣作。因為隨著自家勢力的擴張，未來必然要順江而下，過吉安、南昌、九江，從贛江而入長江，這一路沿江的城池重鎮，都需要水師的援助，才能夠加快攻打的速度。

　　同時，江南山地眾多，地形崎嶇，交通十分落後，因此後勤運輸一直是個很大的問題，水運是最主要的運輸形式，沒有了水師的援助接應護航，單憑陸軍自身，人挑肩扛的將會十分吃力，所以為了保證大軍的後勤，必須要建起一支水師，以及相當規模的船運隊伍，所謂趕早不趕晚，早一天建成贛江水師，就能夠早一天佔據優勢。

　　得知明軍在於都大建船隻、籌建水師的消息，清兵一方的主將多是輕蔑一笑，那作戰的船隻豈是那般容易建成的?除開資金不說，僅僅是其中的繁雜工序，就不是短時間能夠見成果的，明軍想要在這一方面搞事，那就慢慢的來吧，哼，就不信他們能有功夫把那海上的船隻給變到贛江裡面來?等到了明年初援軍到來，自家再設法出擊，搞掉對手在於都的船廠，看他們怎麽辦?不相信對方還會繼續在這方面下功夫，哼哼，其實沒有了水師，這明軍也不是多麽可怕啊。

　　除了大建水師之外，沐劍聲進一步的認識到了輕型火器的重要性。在信豐大戰之中，盡管明軍戰力遠超對手，可是戰損的人馬還是讓他有些呲牙，接近一比三的戰損，實在讓他有些痛心，看來手榴彈和迫擊炮的研發必須要加快了，力爭在下一次大戰中發揮作用。為此沐劍聲派西門雪帶人返回呂宋，詢問相關的研發進度，力爭盡快生產出一批成品，運到江西前線。

　　隨著明軍放緩了進攻的腳步，贛南再次沉寂下來，沿著贛州附近的幾條戰線，明清雙方開始了新一輪的對峙，不時也進行一些小規模的試探性交手，戰局總體上是明軍佔據上風，清兵被壓縮在附近大小五六處要點，幾乎動彈不得。期間清兵也曾試圖發起反擊，不過明軍的防禦陣地太過牢固，清兵損失了一些人馬之後就放棄了這個打算。

　　面對這種被動的局面，希爾根、莽依圖、桑格、尚之孝等韃虜核心人物也十分憂慮，這種被動的局面讓他們很是惱火，可是面對明軍的火器優勢和周密防守，屢次的謀劃都被對手瓦解，這樣就根本無法挽回最終的敗局，除非南昌方面能夠再調派援軍。不過眼下吳三桂也展開了進攻，南昌九江一線也十分吃緊，又怎麽可能再抽調人馬來援?很顯然，贛南的清兵已經陷入到泥潭之中。

　　打仗打得就是後勤，為了保證明軍的戰鬥力，不但整個後勤運輸的作用十分重要，而且交通道路的現狀，則是其中的一個十分重要的決定因素。為了改變南嶺兩側的交通現狀，在肅清了附近的殘兵遊勇，徹底保證了新佔領各縣的安寧後，數萬名閩粵兩地的民夫也隨軍進入江西，匯合明軍和當地的百姓，對幾條主要的乾道進行整修，擴建路面，增修橋梁，縮減路程。這樣經過一年時間的奮戰，在耗費了巨大的人力物力之後，明軍基本完成了這些地區的道路整修工作，基本上能夠保證王府新研製的四輪畜力車全線順利通行。

　　這種新型的四輪畜力鋼架車，最大輪距寬達五尺，廂體長近九尺，其最大載重超過三千斤，日常載重為兩千斤左右，即便是上下陡坡，也可以輕松達到千斤。並且這種車可以在一定的角度裡自由轉向，還安裝有強力的手動刹車系統，來穩固車身，所以能夠輕松的攀爬山路，在投入使用後，使得明軍的運輸力量大大提升，不但達到了之前的三倍有余，除了糧食彈藥之外，而且一些重型物資， 比如普通的火炮和中小型機械等，也可以從廣州運送到江西前線，從而有力的保證了一線明軍的持續戰鬥力。

　　當然，為了實現這個目標，閩粵贛南三地的百姓也付出了艱辛的勞動和汗水，為了修築道路，先後付出了百余人死亡和數百人重傷的代價。當然王府不會讓這些人白費功夫，每位參與工作的勞力，都支付了相應的報酬，其中表現突出的還予以了表彰，獲得了提拔，而死傷者家屬也獲得了豐厚的撫恤金，保障了老百姓的利益。

　　這樣以來，王府雖然耗資甚巨，但是卻獲得了軍事行動上的優勢，也取得了政治上的優勢，徹底收取了當地人心，而隨著這些事情傳開之後，王府更是獲得了廣泛的支持，其意義更加深遠。

　　在明清兩家贛南大戰的同時，吳三桂和清兵在荊州附近展開了二次交手，由於得到了明軍援助的一批簡易的火箭彈和小炮，以及淘汰下來的老式火槍，吳三桂一方的部分水師換裝之後，戰力大大提升，從而取得了一些優勢，經過一番血戰之後，終於擊敗了清兵的荊州水師，成功的控制了附近的江面。此後經過了近月時間，吳三桂在北岸悄悄投放了四萬精銳陸軍，隨後設下伏擊圈，並派出小股人馬為餌，引清軍來圍攻，成功在距離荊州五十裡處的龍洲灘，合圍擊潰了三萬清兵精銳，殺傷甚多，俘敵過萬，成功在江北站穩了腳跟。

　　此戰過後，荊州一線的清兵兵力陷入劣勢，隨後周軍的幾路軍馬進行了合圍，切斷了荊州方面的對外聯系，使之成為一座孤城。