最後經過整頓重編，最終留下了一艘二級戰艦鎮海號為旗艦，兩艘三級戰艦平寇號、滅寇號為骨乾，外加三艘四級戰艦，五艘五級戰艦，七艘六級戰艦和二十余艘福船戰艦，以及小型戰艦五十余艘，補給船隻十余艘，以旗艦鎮海號為核心，組成了呂宋分艦隊，由張興海為艦隊主將，羅大柱為副將，全員共有水軍七千余人。

　　同時，因為在呂宋海戰中的突出表現，這支艦隊又特意被命名為烈焰艦隊，艦隊分為兩大部分，其中主力一部有四千余人，常年駐守在蘇州灣，主要擔負著防守天海城和呂宋大島的重任，另外一部則南下進駐三寶顏，繼續對呂宋南部的盤龍群島海域展開巡查，剿滅這片海域的海盜，同時著手收編訓練摩羅人的零散水師，在一邊肅清海疆的同時，繼續緩步擴充自身實力。

　　然後，為了巡防瓊州島各個港口和附近水域，震懾安南，以一艘三級戰艦征寇號為旗艦，下轄一艘四級戰艦，四艘五、六級戰艦，以及二十余艘小型戰艦，水軍共計兩千余人，組建了瓊州巡邏分艦隊，以賀大綱為主將，沐劍聲的義子沐孝為副將，負責瓊州島四周和北部灣海域的安全，兼顧護航過往的商船，同時保證與吳三桂一方的貿易路線的安全，責任也不小。

　　為了維護陪都廣州的安全，沐劍聲下令，參照瓊州分艦隊規模，旗艦為三級戰艦軫寇號，下轄各種戰艦三十余艘，建立了珠江艦隊;同時又以十隻小型戰艦為核心主力，外加一些輔助船隻，建立起了三支珠江分艦隊，各有水軍千余人，分別負責珠江內河水域東面、西面、北面三個方向水路的安全，同時兼代運送各種物資，配合陸軍守護地方，拱衛廣州城外圍安全，整個珠江艦隊人員超過五千人，由高佑民擔任主將，唐古城為副將。

　　另外，又建立了規模稍小的閩江巡航艦隊，主要維護福州至南平段水域的安全，兼顧維護閩北大軍的後路及給養運輸，這隻分艦隊共有大小戰艦三十余艘，共有水軍兩千余人，由去年率部來投的李西華的老泰山戚三江為主將，姚啟聖的兒子姚儀為副將。

　　而王府水師的主力艦隊，依舊由白寒楓為主帥，施琅為副將，瓦羅斯為參將，麾下共一萬三千余人，將駐防在廈門、漳州、金門、澎湖附近海域，主要防護台灣海峽，兼顧接應各方。下轄的艦隻包括旗艦定遠號，這是一艘一級風帆戰艦，這也是王府參照之前俘虜西班牙人旗艦的內部結構和火力配置，然後進行了部分優化之後，所新建的一艘全新的戰艦，全艦載員達八百余人，加裝了王府最新式的艦炮九十余座，戰力基本超過了同級別的戰艦，十分驚人。

　　此外還有兩艘新建的新式二級戰艦平海號、定海號，三艘三級戰艦蕩寇號、靖寇號、討寇號，五艘四級戰艦和二十余艘五、六級戰艦，以及大小福船戰艦五十余艘，其余小型戰艦一百多艘，艨艟走舸三百多艘，補給船隻二十余艘，實力可謂超強。現在全體的水師官兵正緊張的進行操練戰陣，為以後即將進攻的遠征江南作準備。

　　這樣統計下來，目前王府的水師共有三萬六千余人，大小戰艦近千艘，而為了配合這些水師作戰，目前王府在呂宋的天海城、三寶顏、蘇州灣，瓊州的瓊山、崖州、文昌，廣東的廣州、崖山、汕頭，福建廈門、福州、泉州，台灣的台南、淡水等處，在原來的民用海港基礎上，擴建了十余處設施完備的軍用海港，總共駐有地勤人員近三萬人，

為水師提供完善的後勤服務，保證了王府水師取得一次次勝利。　　這次整訓，水師也配發了統一的著裝，其中海上的人員，士兵配發藍白相間的常服兩套，粗布訓練服兩套，白色禮服一套，外加內衣內褲襪子鞋帽若乾，作戰時外加一件皮質應急救生衣。除了服裝之外，每個士兵還配發軍刺一把，火槍一支，武裝帶一副，其它的水壺軍刀打火機等等輔助器具也人手一件，幾乎是武裝到牙齒。

　　再說這種新配發的救生衣，采用馬甲形式，用布帶固定，上面在前胸後背縫製了八個皮兜，只需要將八個完成充氣的狹長皮袋氣囊塞進布兜後予以綁定，就可以做到托住人員漂浮在水面的效果，甚至還可以保證人員攜帶少量的物資。這種可以充氣的皮袋，乃是軍工廠的新產品，充氣之後扎緊口部，可以維持四五個時辰，這樣只要對氣囊輪換充氣，理論上可以做到讓士兵永不沉沒。

　　而之所以要研製這種比較原始的救生衣，也是因為在上次的大海戰中，沐劍聲親眼所見，因為缺乏相關的救生設施，許多的戰士在船隻損壞後，因為沒有得到及時的救援，就此白白犧牲，所以隻好親自出手，根據後世的救生衣，設計仿製出了這種產品。除了救生衣外，羊皮筏子和救生艇這些簡單的救生裝備，也被沐劍聲下令在水師的戰艦上面予以適當的配備。這種改進的羊皮筏子，做工更加精致，而且四周加有一圈金屬護欄，方便固定乘員，最大可承載二十余人乘坐，救生艇則是普通木製，與後世的救生艇區別不大。

　　經過這些裝備的配置到位，在以後的歷次大戰中，水師戰士的生還率得以大大提升，可謂功德無量，也間接提升了水軍的戰力，隨後西洋各國也紛紛照抄這種辦法，於是讓大海戰變得相對文明了許多。

　　同時，為了補充和擴大水師，眼下沐王府還有大型造船廠三處，分別位於天海城、三寶顏和崖州，可以同時建造一級戰艦兩艘，二三級戰艦五艘;另有中型造船廠五家，分別位於三寶顏、南蘇州城、瓊山、廣州、泉州，可以同時建造三級至六級戰艦，或者大型商船十艘;此外還有小型船廠十余家，可以同時建造各種小型艦隻三十余艘。正常情況下，累計一年時間，就可以完成新建大中型戰艦近十艘，中小型艦隻數十艘的任務，已經足夠補充艦隻的正常消耗，並可保證適當的擴大王府水師規模所需。

　　這些造船廠共有各種工匠三萬多人，為了提高他們的競爭和積極性，王府施行了技術分級的辦法，按照不同的技術發放不同的薪水。目前已經有高級技術匠師一百多人，普通匠師四百多人，他們經驗豐富，掌握著比較先進的造船技術，待遇優厚，月薪從十余兩到幾十兩高低不等;而其余的普通工匠雖然有所差距，但是相比於普通工人，他們的待遇又算是不錯的，除了享受船廠不錯的福利待遇之外，每月還能夠領取三至五兩的薪資，足夠養家糊口所用了。

　　這樣累計算來，有超過十萬人的龐大隊伍，直接或者間接的服務於沐王府的水上力量，他們為了王府海軍的崛起無私的奉獻著自己的一份力量，而且這個隊伍還將逐年增加，成為王府海軍不斷進步的核心力量，為未來帝國海軍稱霸七海奠定了堅實的基礎。

　　由於王府先後幾次戰役連續獲勝，繳獲的財物累計下來，完全是個天文數字，而這些豐厚的戰爭紅利，加上充足的賦稅，和商會的龐大利潤， 足夠保證王府後續各種計劃實施所需的資金，再加上後續不斷有新建的工廠投入使用，各種產品不但解決了後勤物資供應，而且還提供了海量的稅金收入，從而有效的保證了王府財政的良性循環。現在王府不但有了充足的資金來招募人員，擴充碼頭和建造船隻，另外有了閩粵兩地足夠的人力來征集兵員，這一切都為水師的擴充壯大，客觀上提供了有利的條件。

　　除了水師之外，為了加大王府的民間水上運輸力量，為發展經濟建設打基礎，也可間接輔佐陸軍行動，除了王府下轄開辦的水運公司外，還允許私營的船運公司存在，這就使得一些私人商會也參與到水運事業中來。由於這些人的加入，他們所新建的不少商船也投入運輸，這也間接提升了王府的水上運輸能力，這就使得王府所轄的各個造船廠，現在幾乎都是全力投入運轉，這樣再加上其它一些工廠的陸續投產，以及鋼鐵產業的整頓調整，大批的工廠開始運轉營業，流民乞丐幾乎消失殆盡，到處都是一片熱火朝天的熱鬧景象，王府各方面的的經濟建設蒸蒸日上，人人臉上都洋溢著幸福的笑容，讓前來視察的沐劍聲等王府高層人員十分欣慰。

　　於此同時，為了培養足夠的海上軍事人才，沐王府的崖山軍事學校也在一年前正式開張。建成後的崖山水師學堂，佔地面積十分廣闊，除了有百余畝的核心教學區外，還有同樣面積的住宿生活區，此外還有獅子山區域的倉庫後勤區，和崖門的一處小型造船廠，外加附近海域的巨大海上訓練場，配置十分到位。