明和十年(1663)正月，近兩個月沒有下地行走的秀保，終於在孝嚴天皇和皇后的攙扶下，出席了新年慶典，滿朝大臣興奮不已。

但不久後，一場寒潮光顧京都，致使其病情突然加劇，一度昏迷不醒。

二月初，秀保終於恢復神智，卻也知大限將至，便派人去請佑仁來東明殿一見。

佑仁得訊後趕忙來到東明殿，此時周圍已經圍了一圈聞訊趕來的皇族和秀保的親信。

佑仁跪扶在秀保床前，關心道:“您終於醒來了，孫兒這段時間心一直懸著。”

“人固有一死，陛下不必這般擔憂，何況你也算是見慣生死了。”秀保揮揮手，示意眾人先出去。

見房門關上，方才拍了拍孝嚴的肩膀，語氣微妙地說道:“去年那一戰打得出色，聽說琵琶湖畔屍相枕藉，湖水都被染紅了。在朝日山逼死了你的堂兄，還把他們全家流放八丈島，古往今來，還沒有哪代天皇親自做過這種事。”

“祖父，孫兒只是為了維護朝廷的威信，這不是您一直期望的麽?此役過後，定是再也沒有人敢挑戰朝廷的權威了。”佑仁如同孩童般垂首接受秀保訓斥，大氣不敢喘，偶爾看準時機解釋一兩句。

“想立威，當年處置‘江戶騷亂’那一套不行麽，非要兄弟鬩牆，刀兵相向，讓外人看笑話?”秀保憤憤道。

“您當時昏迷不醒，孫兒覺得單憑自己，無法逼降晃仁……”佑仁解釋道。

“你不是小孩，我也不是老糊塗，我知道你怎麽想的，你想借此機會樹立自己的威信，而不想像之前那樣什麽都依靠我。”秀保語氣稍有緩和:“我命不久矣，你不該操之過急，況且還是拿晃仁開刀，毫不顧及你大伯當年所做的努力和犧牲。”

“晃仁本就有不臣之心，祖父您是知道的，況且阪本離京都如此之近，孫兒實在等不及了。”佑仁據理力爭道。

“所以我也沒有過多苛責你，年初的慶典也給足你面子盡力參加了，只是這件事你處理的不甚妥當。”秀保歎了口氣，“你要記住，我們這脈入嗣大統不過三十年，親族是你要依仗的重要力量，可以奪權、削藩，但是不能殺。所謂下克上、父子反目、兄弟相殘這種戰國時代的惡果，決不能出現在皇室，否則跟之前的戰國大名何異?”

“孫兒明白了，回頭便把他們一族召回。”佑仁頗為誠懇地回應道。

“我知道一直有些風言風語，說什麽你父親、還有你，明為天皇，實則無權，甚至有‘政令皆出於東明殿’之說，想必你也是聽不下去，才有此行動吧?”

“絕無此事！”佑仁驚慌道，“孫兒年幼，一切還賴祖父教導。”

“這沒什麽，”秀保有氣無力地擺了擺手，“你沒有經歷過那些大風大浪，是不會理解我的謹慎和擔憂的。如今天下太平，我也正好大限將至，實在是再好不過了。”

“祖父！”聽到這裡，佑仁更是無地自容。

確實，孝明天皇還在世時，類似的風言風語就已興起，如今秀保病重之際，更是甚囂塵上。

當年孝明天皇對這類言論甚為厭惡，相關人員一旦查出必予以嚴懲。

佑仁當時年幼，也被身邊侍從有意無意灌輸了不少流言蜚語，孝明天皇得知後大為光火，下令處死及流放者達百人。

佑仁頗為不解，孝明天皇也是以相同的口氣告訴他:“你小小年紀，沒有經歷幾十年前那個風雨飄搖的年代，

是不會理解祖父的，你要記住，沒有祖父，便沒有現在的我們。” 從那時起，孝明天皇就時不時給佑仁講述秀保當年的事跡，從與德川家康鬥智鬥勇，到出兵朝鮮的九死一生，再到秀吉逝後的臨危受命，最終力挽狂瀾、一戰定乾坤，後來皇籍奉還、入嗣大統更是千年未有之舉，大和豐臣氏搖身一變，成為日本名正言順的主人。

凡此種種，孝明天皇講得眉飛色舞，佑仁卻聽得雲裡霧裡，但父親對祖父的崇拜之情，讓他也不好再說什麽。

其實，佑仁一直有個心結，那便是自己的血統:雖然名義上自己的祖父和外祖父都是“正親町—誠仁”一系，但這是“皇籍奉還”的結果，免不了外人說三道四。

孝明天皇沒得選，只能借助秀保鋪好的路走下去，可自己不一樣，不僅可以走秀保鋪的路，也可以走“正親町—誠仁—後花山”之路，後者顯然更加“堂堂正正”。

加上周遭的流言蜚語，致使他開始刻意疏遠和武家華族的關系， 轉而親近公家華族，秀保雖不以為意，但孝明天皇卻甚為不滿，更為此嚴懲了諸多公卿，這讓佑仁產生了不小的叛逆心理。

即位後，祖孫二人的關系也愈發微妙，秀保開始逐步放手，佑仁也趁機扶植了一些親信，但這些人大多是溜須拍馬、無才無德之輩。

不少朝中重臣對此抱有異議，秀保則認為佑仁年輕氣盛，只要沒出大亂子，就可以做一些新的嘗試。

因此，明和五年(1658)的“江戶騷亂”，便是基本由佑仁自行處理，但中途卻因使者的驕縱跋扈，引發江戶宮的不滿，十余名佑仁近臣被殺，最終還是秀保出面，才平息了眾人怒火、解除了危機。

經過此事，為恢復朝廷的威信，秀保在朝中進行一番清洗，佑仁也開始反思自己之前的衝動，在人員選拔上更加慎重，藤堂高明、那須資成等一些武家華族後起之秀先後被委以重任，處理政務也更加穩重。

但這件事中展現出的秀保的控制力和影響力，仍讓佑仁心存芥蒂。

隨著秀保身體的日益衰弱，佑仁逐漸收回權力，為證明自己的能力、樹立威信，明和九年(1662)他親自制定計策並主持平定了“壬寅之亂”，中間雖有波折，卻終歸取得了預定效果。

雖說借此鞏固了地位，但正如秀保所說，這件事的“副作用”也開始顯現，親族和朝臣多對佑仁關於阪本宮的處置有所怨言，更有人認為他是借機震懾和掃除秀保舊班底。好在這時秀保出席了新年慶典，才使得這種言論偃旗息鼓。