隨著闖王李自成離開河南遠走四川，河南境內其他的農民軍別部很快被明軍平定，大量農民軍士兵在窮途末路之下紛紛向明軍投降，有些擔心被明軍報復的則跑到南陽投奔左良玉，畢竟左良玉雖然也是理論上的明軍將領，但是他對前來投奔的農民軍非常歡迎，結果就是左良玉在部隊在戰後規模更大了，當然這基本上已經宣告中原的農民軍被徹底平定。

　　各路明軍此後都向河南運來了大量糧食以便賑濟災民，祖大壽，孔有德，洪承疇在自己的根據地裡非常強調農業生產並且武力收繳很多土地，在這種情況下他們手頭上的糧食相當不少，而且孔有德和祖大壽還可以從西班牙人那邊去購買糧食，在這種情況下很快河南當地的災情很快就得到了控制，當地的民眾也逐漸穩定了下來，而農民軍降兵在獲得糧食後也不想繼續造反了。

　　除此之外各路明軍則開始就地任用官員前去控制地方，他們開始把治下原先的地方官調離河南，然後他們再安排自己的親信前去掌控地方大權，祖大壽也表示不會去追究當地官員不聽號令的舊帳，但是對於那些意圖反抗他們的官員，他們就以貪汙的罪名對這些官員重拳出擊，畢竟事到如今就沒有不貪汙腐敗的官員了，在這種情況下很快他們就徹底控制了河南。

　　而接下來這次出兵河南對抗農民軍的薊國公祖大壽，岐國公洪承疇和魯國公孔有德就開始商討對河南進行佔領的問題，當初祖大壽說服洪承疇和孔有德出兵河南攻打李自成的時候，他就許諾跟他們在戰後直接瓜分河南，而這其中以洪承疇的出力和戰績最大，這次李自成聚集的幾十萬大軍基本上全是被洪承疇的明軍所打垮的，畢竟洪承疇跟李自成已經是老對手了。

　　洪承疇在戰後出兵佔領了河南西部的河南府和汝州府全境，這裡可都是河南最傳統的核心地區，至此洪承疇直接控制了西安和洛陽這兩個古都，其聲望可以說是有了巨大的提升，此外這裡現在已經算是河南境內相較來說民生過得去的地方，洪承疇在戰後就開始布置移民發展農業，而除此之外他還派出總兵白廣恩駐守鄭州城，他又讓總兵劉鈺屯駐許州，可以說基本上控制了開封府的西部。

　　孔有德在驅逐了李自成後就徹底拿下了歸德府和汝寧府，這裡因為跟山東接壤所以孔有德此前就開始在這裡進行滲透，甚至在當地活動的張獻忠義子孫可望部都皈依天主教，這次開戰後孫可望立刻迅速投奔魯軍並且跟隨孔有德屢立戰功，而在戰後孔有德則繼續在當地推廣天主教，並且他還在這些地區拓展貿易路線從而發展商業，此外孔有德還派出總兵李應元，尚可喜，孫可望各自率部前去屯駐陳州，項城，偃城等地控制開封府的南部。

　　關寧軍在此戰中其實並沒有打多少硬仗，但是他們卻趁機拿下很多的地盤，錦衣衛指揮使吳三桂率領麾下人馬佔領了懷慶府，督師南征的薊遼總督祖大樂輕松的佔領了彰德府和衛輝府，其中彰德府已經被此前歸順關寧軍的袁時中率部佔領，而在衛輝府活動的張獻忠義子李定國則主動向明軍投降，而駐守開封城的陳友福也主動歸順了關寧軍。

　　在這種情況下開封府就成了三方存在爭議的敏感地區，開封總兵陳友福雖然此前歸順了關寧軍，但是洪承疇率西北明軍屯駐鄭州縣，孔有德率領魯軍佔領郾城縣，他們都表示這裡是他們曾經大戰過李自成的古戰場，那個意思就是他們絕不會讓出自己已經控制的土地，當然他們的潛台詞就是說他們都是跟李自成大戰過的主力軍，可不會慣著一直在撿桃子的關寧軍。

　　對此祖大壽也不是沒有考慮過通過武力強佔開封府，但是此時關寧軍連續作戰也需要得到休整，更重要的是他意識到自己現在雖然實力強盛，但是也不能跟孔有德和洪承疇兩線開戰，因為他的兵力本來就比不過孔有德和洪承疇的總和，而且他們麾下的軍隊戰鬥力也都不弱，而且如果他們趁機拉來葡萄牙和西班牙助陣，或者皇太極趁機起兵入關，那麽關寧軍就基本上玩完了。

　　所以最終祖大壽決定接受洪承疇和孔有德的提議瓜分開封府，他意識到自己真犯不著為了這幾個飽經戰亂的城池而大動乾戈，於是祖大壽以方便治理的名義把開封府分成鄭州府，陳州府和開封府， 這個轄區其實就是以實際控制范圍設定的，這其中鄭州府在西，陳州府在南，開封府在北，而鄭州府自然是被洪承疇統治，陳州府則成為了魯軍的轄區。

　　至此河南徹底被這三家明軍勢力所正式瓜分，這也就意味著河南基本上成為存在於地理的詞匯，實際上河南各地則要被各個勢力所影響，比如說孔有德在他統治的歸德府，陳州府和汝寧府的轄區裡大力推行天主教以繼續維持他的統治，孔有德對文治方面並不了解也沒有興趣，他主要關心的還得是自己手頭上的收入，不過孔有德還是願意聽讀書人的話進行文治的，而且他很喜歡來錢更快的商業，所以很快河南東部就在孔有德的武力保護下迅速開始發展起來。

　　而洪承疇則成功的開辟了通往東海的商道，洪承疇此前就已經意識到，他可以通過跟歐洲國家的貿易獲得更高的利潤和更好的裝備，但是此前由於中原大亂導致商路斷絕，所以現在他就要跟孔有德合作開發商業路線，而他的這個思路很快就讓河南府，汝州府和鄭州府發展商貿，他得以通過魯國跟西班牙和葡萄牙和其他歐洲國家展開貿易。

　　祖大壽則在他新控制的河南州府裡推行屯田，由於為了跟關外的滿清八旗軍進行對抗，祖大壽就開始多次擴充關寧軍的規模，同時他還對治下的其他軍隊展開訓練，但是他治下的直隸山西全部都是人多地少的人口大省，為了能夠確保有足夠的糧食，祖大壽就開始組織軍民在河南領地去進行屯田，由於此前當地居民因為戰亂逃散殆盡，所以關寧軍的屯田也沒有受到多少阻礙。