李自成率領二十萬闖軍水陸並進從荊州府殺入了四川，以完成李自成想要割據四川的最終目標，很快闖軍就殺入了四川東部的菱州府和重慶府，闖軍坐著四處征集來的民船就沿著河流去佔領城鎮，其實最開始闖軍上下都有擔心入川難度的心態，畢竟蜀道難的說法根深蒂固，但是很快闖軍就發現，他們在進軍途中根本沒有遭到說的上來的抵抗。

　　此前四川也在關寧軍政變後陷入混亂狀態，但是四川跟中原不同的地方是，四川本來就沒有多少明軍主力和強力政府，結果就是多山的四川很快就變成一盤散沙，四川各地的地方武裝和土司勢力都作威作福裂土封疆，而本地的明軍由於軍費過低導致戰鬥力聊勝於無，他們甚至連衣物都成為問題，而且四川明軍的主力都跟隨總兵方國安效力於左良玉的旗下，在這種情況下剩下的四川明軍甚至就連左良玉這種大軍閥都出不來。

　　因此闖軍所到之處各地州府見狀無不望風而降，甚至連當地的官員都對闖軍沒什麽抵抗的興趣，牛金星，宋獻策，李竟志等人見狀就建議李自成采取與民休息約法三章的政策穩定人心，李自成對此自然是選擇全盤采納，畢竟李自成的眼界是在線的，於是投降李自成的人更多了，當地的明軍軍官和本地官員也紛紛來歸順，很快李自成就輕松的佔領了菱州府和重慶府全境。

　　不過這次李自成也就不打算放棄所佔領土了，於是他讓田見秀鎮守重慶府，劉希堯鎮守菱州府，然後他親自帶領闖軍主力挺進成都，結果他們在潼川州遭遇成建制的抵抗，小半輩子跟農民軍作戰的石柱土司秦良玉集結了由土司兵和忠於大明的兵將組成的軍隊在潼川抵禦闖軍，李竟志見狀直接主動請纓率火器部隊當先鋒，此時李竟志通過在戰場上撿掉落已經拚湊出兩千火繩槍和十五門紅衣大炮，所以這次他想要試試這些新式武器的威力。

　　而最終此戰的結果事實則證明，百戰余生的闖軍雖然打不過洪承疇和孔有德，但是欺負裝備貧瘠缺乏補給的土司兵和四川明軍是綽綽有余，李竟志的兩千火繩槍兵和紅衣大炮直接就壓著秦良玉打，很快就打得此前損失過大而且缺乏見識的石柱土司兵全線崩潰，闖軍各部趁機蜂擁而上展開了追擊，他們已經很久沒有打過這麽順風的仗了，那麽既然如此闖軍各部自然要抓住機會撒氣，最終廉頗老矣的秦良玉被李竟志帶兵生擒。

　　李竟志以秦良玉在四川威望極高的理由勸說李自成善待秦良玉，李自成很快就采納了他的意見，然後他率領闖軍直接開進成都府，隨著秦良玉所部人馬被闖軍徹底擊潰，此時的四川境內已經沒有能抵抗闖軍的力量了，剩下的明軍部隊紛紛選擇向李自成投降，於是很快李自成就輕松的拿下了成都，李自成帶著闖軍開進成都城的時候松了一口氣，他感慨自己征戰半生總算是有了個像樣的根據地了。

　　李自成佔領成都後就開始派人前去去招降四川的各個州府，很快成都府境內的各個縣城全都紛紛歸順了李自成的闖軍，同時李自成還反覆勸說秦良玉歸順自己穩定四川，秦良玉雖然始終不願投降，但是李自成的友好態度還是讓她對李自成的看法有所改觀，同時李自成還派軍隊四處清剿收編當地的土匪搖黃武裝穩定民心，並且李自成還積極的鼓勵民眾恢復生產。

　　但是就在李自成開始想要經營自己控制的四川的時候，明軍就開始準備再次向他去發動進攻了，岐國公洪承疇得知李自成入川後立刻決定出兵四川驅逐他，雖然劉鈺認為明軍連續作戰已經疲憊了，但是洪承疇認為李自成剛剛進入四川立足未穩，現在就是趁機把他消滅掉的最好機會，於是他就命令總兵馬科在漢中集結明軍前來攻打李自成。

　　李自成見狀立刻任命麾下大將劉芳亮擔任主帥，並且讓他統帥李竟志和馬守應等部去抵抗馬科，李自成本人則和劉宗敏和李一過繼續坐鎮成都擴張順軍的勢力，同時也作為作為劉芳亮後面的援兵，按理說劉芳亮所部闖軍兵力遠超馬科， 所以李自成對自己的布置信心十足，他認為洪承疇大意輕敵，他這次沒準可以直接逆境翻盤最終反攻陝西。

　　但是馬科身為老於沙場的明軍宿將是有勇有謀，他憑借著地形和裝備跟劉芳亮打得是難解難分，劉芳亮指揮的闖軍雖然人數眾多，但是由於闖軍此前對陣洪承疇屢戰屢敗，因此闖軍的士氣並不高，而且四川的地形也不能發揮他們的人數優勢，李竟志訓練的新軍在火力上也被明軍壓製，但是劉芳亮好歹也算是穩住了戰線沒有讓馬科繼續南下。

　　通過這次戰鬥李自成無奈的發現洪承疇只需要麾下總兵就能擋住自己的大軍，自己割據四川雖然自保有余但是恐怕無力出兵北伐，這麽看自己恐怕這輩子已經沒有辦法打回老家，對面的洪承疇發現目前李自成的闖軍的戰鬥力還在，他們繼續盤踞蜀道也能擋住自己麾下大軍南下，而如果日後李自成繼續經營四川那麽難度還會變大，洪承疇也意識到自己恐怕還真的滅不了李自成。

　　於是在這種情況下互相廝殺半輩子的李自成和洪承疇都有了停戰的想法，畢竟現在的洪承疇已經不再是當年的大明督師，現在他身為割據陝甘的岐國公，他需要給治下民眾和麾下軍隊負責，而如果他繼續死磕四川那麽勞民傷財還沒有收獲，而李自成現在也不能繼續像當年那樣四處遊走了，他需要足夠的資源和時間去穩定四川內部，如果他繼續在川北跟明軍進行拉鋸戰，那麽這會導致他無法繼續向川南進行擴張並且穩定四川，那麽自己辛辛苦苦拿下的四川恐怕保不住。