兩日後，韓衍等鄉紳在安慶舉行議會，進行投票選舉都督，張文山以三分之二的票當選都督。

　　張文山正式宣布就職大都督，並且在巡撫衙門設立都督府，都督府分為軍務部和民政部兩部分。

　　軍務部分為參謀處，裝備處，後勤處，政治處。參謀處負責收集軍情和策劃謀略。裝備處管理軍工生產和采購軍火。後勤處負責調度儲存物資和管理軍糧軍醫。政治處負責軍紀，選任軍官，政治宣傳。

　　民政部將分為民政廳，財政廳，人事廳，警察廳，教育廳，工商廳，農業廳，司法廳，水利廳，檢查廳。各縣則設立相應的部門。

　　張文山擔任軍務部部長，下設四處，由吳江擔任參謀處主任，王文海當任後勤處主任，田慶擔任裝備處主任，齊月溪任政治處主任。

　　民政部部長韓衍，秘書處秘書長陳獨秀，民政廳廳長李書霖，財政廳洪思亮，警察廳廳長祁耿寰，教育廳長李光炯，工商廳長章炳如，農業廳李文泰。司法廳光明甫，水利廳余力，檢察廳鄧繩候，法院院長李四海。

　　另外安徽議會會長李書霖，副議長齊月溪。議會的三百名議員全部從地方和軍隊中重新進行舉薦。全省議會具有立法和監督行政的大權。

　　按照張文山的設計安徽的軍務應由張文山的親信掌握，但是安徽還有胡萬泰的新軍。張文山只能將安慶城防司令的位置給他。這樣一來，安慶的軍事力量就分成了兩邊對抗的局勢。

　　民政則交給了革命黨和鄉紳名流共同管理。鄉紳的代表李書霖則和張文山的代表齊月溪在議會達成了統一陣營。

　　安徽各方勢力達成了妥協，共同分享安徽的軍政大權。

　　安慶的作戰部隊調整為一個主力師和兩個混成旅，以及警衛團。總兵力38000人。

　　警衛團直屬於都督府，兵員從新軍和皖南革命軍中挑選精兵強將組成，任務是維護安慶的治安，同時保護重要的軍政要員。

　　警衛團長是張文山的親信蔣偉，於誠當任都督衛隊長。下設三個步兵營，一個憲兵隊，一個偵察連，一個機槍連。總人數一千三百人。

　　張文山部改編為安徽第一師，下轄四個步兵團，師屬炮兵營和一個輜重營以及偵查連。另外還有銅陵蕪湖兩地的新兵訓練營。

　　張青擔任師長，參謀長龔振鵬。總教官李天明，一旅旅長管鵬，二旅旅長宋清明。

　　師屬獨立炮營營長王大力，輜重營營長張國棟，偵查連長唐小六。

　　駐省城的62標和61標新軍以及炮營馬隊擴編為安徽第一混成旅，下轄兩個步兵團和一個炮營，一個騎兵營以及工程輜重各一營。

　　胡萬泰任旅長。顧琢塘擔任副旅長。

　　廬州軍分府的8個步兵營，一個衛兵營，一個炮兵營編成安徽第二獨立混成旅，旅長孫萬乘。第九團團長劉文明，第十團團長袁鬥。

　　淮上軍的18個步兵營和2個炮兵營一個馬隊營都被編入柏文蔚的北伐第一軍第一師，正式從安慶的軍政體系中脫離出來，只聽從南京的臨時政府指揮。師長王慶雲，副師長袁家聲，參謀長張匯韜。

　　北伐軍第一師只聽從同盟會孫中山的指揮，軍費開支也都是在地方自籌。安徽都督府根本沒有直接指揮權

　　在張文山看來淮上軍已經尾大不掉，可以說是安徽軍政府統一皖北的障礙，。

　　另外安徽戰鬥力最強的軍隊是胡萬泰的新軍改編的第一獨立混成旅，全旅上下總共一萬人，大部都是多年的老兵，許多人參加過清軍的太湖秋操，各種火炮齊全。這隻部隊也是張文山掌控安慶的絆腳石。

　　“陳兄，如今皖北的王慶軍已經是尾大不掉，胡萬泰天天要餉要軍械，不給就武力威脅。你說如何才能解決這些問題。真正的統一事權。”

　　張文山有些頭疼，這個大都督職位也沒那麽好做。

　　“都督，可以用恩威並施之策，先消去他們的財權，壯大第一師用武力相威脅，再將他們調回安慶擔任高位，他們的部下也要調離原職。不過當務之急是如何去除倪嗣衝的威脅，倪嗣衝盤踞潁州招兵買馬其志不小啊。”

　　陳獨秀對目前的時局也看不透，但他認為張文山掌握省政府，是佔據了大義。

　　“我打算先下令取消各地的軍分府，然後派出稅務官員接管財政。在給王慶雲補充一些槍支彈藥，讓他去和北洋軍較量，最好是兩敗俱傷。上次他敗給了倪嗣衝，這回我幫他報仇的。如果他贏了，我就借機嘉獎將其調到南京去。如果輸了那就別怪我不客氣，奪其軍權。”

　　張文山從書桌裡拿出早已準備好的命令交給陳獨秀。

　　陳獨秀雖然覺得張文山的計策狠毒，但也知道這是最好的辦法。他只能希望安徽的局勢盡快平定。

　　廬州的孫萬乘接到安慶的取消軍分府的命令後，召集廬州的軍政要員商議，張文山佔據了安徽都督的大義名分，又手握重兵虎視眈眈。廬州以一府之地對抗省府，實在是螳螂擋車。

　　況且張文山還未其保留了一個混成旅的番號。

　　當天孫萬乘致電省政府願意取消軍分府獨立，接受安慶的管轄。

　　張文山對於孫萬乘的選擇並不意外，廬州是安徽唯一沒有槍聲就獨立的城市，就是因為孫萬乘並不是堅定的革命者，而是廬州士紳投機者的代表。他不願意自己的家鄉經歷戰火，也沒膽量與安慶對立。

　　張文山當即下令第二獨立混成旅調往蕪湖宣城一代駐扎，允許其修建營房，部隊擴充到5000人，並且下撥半年的軍費。

　　張文山要求全省62縣的縣令長官到安慶述職，由安慶議會進行審核。傾向北洋軍者，貪汙瀆職者一律免職。政績聘用者調往鄰縣任職，避免官員與地方士紳勾結。另外從省政府中通過考試選調官員外放。