在這種情況下山海關總兵吳襄只能帶著關寧騎兵趕到保定府，與此同時薊鎮總兵鄧玘，天津總兵王洪，保定總兵劉國柱，密雲參將牟文綬，參將彭友謨等部明軍主力也在孔有德的壓力下撤入保定，至此大明在華北地區所能集結的全部野戰部隊都集中在保定府，與此同時崇禎也向他們下達了命令，崇禎要求他們務必死守保定府，絕對不能讓魯軍繼續推進，畢竟保在定府後面可就是京師，並且崇禎皇帝還任命高起潛為監軍統帥各部明軍。崇禎希望明軍能夠在保定擋住葡魯聯軍，然後再他從山西和遼東調兵增援，然後再從中原和南直隸調遣明軍配合北路兩路夾擊，對此孔有德很清楚自己的處境，因此他任命自己的好兄弟總兵耿仲明留守山東，並且讓他統帥總兵李應元和王子登等部魯軍，防備南邊的大明提督陳洪范和義勇副總兵劉澤清等部，由於李九成的陣亡現在的耿仲明就是魯軍二號人物，資歷輕的李應元和沒威望的王子登自然不會反對，此外孔有德也事到如今並不想把事做絕，他到現在還沒有推翻明朝的念頭，他主要是想讓大明主動承認自己佔據山東。

　　然而就在崇禎皇帝盤算著兩路夾擊的時候，穆裡尼奧突然率領葡萄牙軍隊展開了行動，穆裡尼奧沒有率領葡萄牙軍隊配合魯軍攻打保定府，他直接率軍沿著河流北上殺向京師，這個舉動直接震驚了大明朝廷上下，很快葡萄牙軍隊接連攻克香河等地，逃亡的明軍表示葡萄牙士兵青面獠牙火力強大，他們的誇大其詞加劇了朝廷內部對此的恐慌。崇禎見狀立刻命令京營出擊擋住葡萄牙軍隊，結果葡萄牙軍隊交戰的時候先是用火炮狂轟濫炸，然後葡萄牙士兵再用火繩槍去掃射，最後大量揮舞著雙手劍的歐洲傭兵衝向明軍大肆砍殺，結果毫無作戰經驗的京營直接就被葡萄牙軍隊打崩，穆裡尼奧甚至都沒有命令步兵列陣，他通過此前跟魯軍將領的交流，已經大致明白京營都是什麽貨色。

　　結果很快葡萄牙軍隊就這麽輕松的佔領了重鎮通州，通州是大運河的出口，這裡囤積著大量的糧食和貨物，於是眼紅的葡萄牙軍隊在這裡展開了瘋狂的劫掠，這些葡萄牙軍人和歐洲傭兵不遠萬裡來遠東去作戰，他們雖然口頭上都說是來支持天主教的，但他們的主要動力就是搶東方的財富，所以他們進了通州這個京師外圍最重要的運輸港口後個個是欣喜若狂。結果很快通州城裡的瓷器，茶葉，古玩，絲綢和其他奇珍異寶全部被他們洗劫一空了，京師內部的王公顯貴囤積在通州的貨物全被搶光，歐洲的士兵對此自然非常開心，要知道茶葉瓷器這種東西在歐洲非常的珍貴，這次搶掠已經夠他們整個家族在老家過上無比富足的生活了，要不是穆裡尼奧強令士兵們不得無端拆毀建築殺戮百姓，通州城都差點被這些亡命徒夷為平地。

　　穆裡尼奧的葡萄牙遠征軍在通州劫掠的時候京師的明軍只是在作壁上觀，事到如今他們對外面的葡萄牙軍隊非常畏懼，而京城的大明勳貴再次陷入了恐慌之中，然後他們就開始去彈劾朝廷不作為，在這種情況下崇禎只能罷免了眾多官員，然後他任命素來憂國憂民愛討論軍事的楊嗣昌為兵部尚書，崇禎皇帝讓他負責統領京師明軍抵抗葡萄牙軍隊，楊嗣昌見狀只能萬般無奈的上任了。然而此時明軍裡面認為葡萄牙軍隊比己巳之變的後金軍隊還恐怖，因為是因為他們有孔有德作為外援，而且他們有足矣摧毀京師的紅衣大炮，楊嗣昌在這種萬籟俱灰的情況下走馬上任，而與此同時穆裡尼奧一邊組織士兵把搶到的物資運到天津，一邊以通州為中心不斷派出葡萄牙軍隊在四周進行搶劫，那些勳貴的莊園在被後金軍隊搶過後再次遭到了葡萄牙軍隊的洗劫。

　　楊嗣昌意識到當前最好的辦法是跟葡萄牙王國議和，但是他知道崇禎不可能接受這個結果，於是他提議讓關寧軍前來增援，他自認為華北明軍各部集中起來死守保定是可行的，於是楊嗣昌建議讓吳襄帶著關寧軍前來增援京師，然而崇禎對關寧軍實在沒什麽好感，但是在楊嗣昌的好說歹說下還是勉強同意讓關寧軍增援京師。吳襄得到命令後立刻率領關寧軍前往京師，而此時穆裡尼奧的葡萄牙軍隊已經在京師周圍分頭劫掠，一時間周圍莊園的海量的財富被葡萄牙人搶走，除此之外穆裡尼奧還不斷出動火炮轟炸京師製造騷亂，楊嗣昌只能窩在城裡死守並且沒日沒夜的搶修城牆，與此同時很快吳襄就率領關寧軍抵達良鄉，在當地劫掠的葡萄牙軍隊發現來了幾千明軍騎兵就立刻溜號。

　　穆裡尼奧在得到消息後立刻判斷是關寧軍主力抵達良鄉，於是他立刻命令各路葡萄牙軍隊停止劫掠並且全部集結到通州，此時葡萄牙軍隊已經搶的差不多了所以他們就趕緊集結，很快穆裡尼奧就在良鄉集結了自己旗下的兩萬軍隊，他計劃憑借著通州的糧食和城牆跟明軍進行周旋，此外天津那邊有海軍艦隊和水兵進行防禦。其實吳襄本來可以率領關寧軍追擊，但是楊嗣昌卻立刻把他們調到京師，因為他需要關寧軍的威名穩定人心，結果這就給了穆裡尼奧集結軍隊的時間，而與此同時崇禎見葡萄牙軍隊撤軍頓時又找回了信心，他立刻打算讓吳襄帶著關寧軍反攻通州，吳襄見狀頓時腦袋都大了，他之前在山東都打不動穆裡尼奧率領的軍隊，現在穆裡尼奧的軍隊擴張到了整整一倍，還都是葡萄牙正規軍和歐洲傭兵，這讓現實的吳襄更是毫無信心，更不幸的是楊嗣昌認為穆裡尼奧撤軍說明他害怕吳襄的關寧軍，所以他跟崇禎說讓吳襄乘勝追擊也沒什麽問題。