這些起兵的東江將領都很確定現在朝廷手中最強大的力量就是關寧軍了，現在既然關寧軍都被他們擊敗，那麽朝廷已經無法繼續阻擋魯軍了，因此魯王孔有德接收了魯軍諸將的意思，他打算直接投入全部的主力軍，集中力量對被擊退的明軍進行追擊，爭取擊潰山東境內的全部明軍主力。“目前朝廷已經把他們在京畿和河北的主力軍全部投入在此，只要我等把他們全部擊潰，那麽朝廷將無法威脅我軍，目前正是天賜良機，不可錯過！”，孔有德信心滿滿的說道，為此他決定要讓魯軍在全線發動進攻，他命令總兵陳光福去攻打逃到黃河口的彭友謨，總兵耿仲明則前去攻打竄入兗州府的陳洪范和劉澤清，他親自率軍攻打流落在濱州和齊東等地的鄧玘，王洪，劉國柱和牟文綬等部明軍。

　　與此同時被前線戰況鼓舞的都元帥李九成親自率領上萬魯軍抵達了前線，身為魯國的二號人物，(甚至一度是理論上的叛軍頭領)孔有德讓他節製在中部的總兵穆裡尼奧和總兵李應元等部，負責攻打退守濟南的關寧軍，此戰孔有德給了李九成很大的權限，畢竟他是東江舊部裡的老大哥，威望僅次於他這個魯王。李九成率領大軍抵達昌邑後讓李應元率部留守昌邑，畢竟李應元是他的兒子，他可不想讓李應元到前線去冒險，所以給了他留守後方的閑職，同時他讓穆裡尼奧負責維護補給線，他這個安排固然有嫉妒穆裡尼奧戰功的存在，但是說到底他是想要獨自率領大軍擊敗關寧軍，畢竟他在東江軍裡的軍事能力不太被信服，他能當上都元帥主要是因為他的資歷和煽動兵變，而如果他擊敗關寧軍那就可以名揚天下，到時候都元帥的位置也能夠徹底穩住了。

　　很快李九成就率領大軍西進，很快他們就拿下了整個青州府，雖然此時青州府的明軍基本上人去樓空，但是不管怎麽說魯軍再次拿下重鎮，這讓魯軍上下的士氣非常高漲，魯軍將士請求李九成乘勝追擊，李九成則判斷關寧軍退守濟南說明他們士氣低落，這確實是他擊潰關寧軍的最佳時機，於是他就率領魯軍直接殺向濟南府。穆裡尼奧見狀趕緊勸告李九成，他表示關寧軍此前損失不大，其實力依然十分的雄厚，所以李九成絕對不應該輕敵，應該采取謹慎的行動，然而李九成認為關寧軍長途奔襲且遭遇斷糧，現在已經是不足為據，他認為關寧軍首戰不利已經耗光了士氣，所以他依然信心十足的率領魯軍殺向濟南府，李九成倒不是猜忌穆裡尼奧這葡萄牙人，而是因為自從起兵以來風頭全都讓孔有德出了，這讓他迫切的想要立下大功去證明自己。

　　就在孔有德在山東東征西討的時候，駐守遼南的後金鑲黃旗將領富查富林阿提出突襲旅順的建議，後金天聰汗皇太極見狀立刻召集文武展開商議。“在下認為富查將軍此計甚好，現在孔有德在山東作亂，還擊潰了彭友謨部水師，聽聞還坐擁西洋巨艦，這讓東江總兵黃龍把大量主力部隊和戰艦投入到遼南諸島，除此之外他還要防備沈世魁，現在旅順反而非常空虛。”，寧完我見狀立刻站出來支持富查。“這富查不是八旗軍中最謹慎的嗎?怎麽會提出如此瘋狂的計劃?”，皇太極提出問題。“啟稟陛下，我認為既然如此，這說明富查將軍已經是胸有成竹，他已經有十成把握拿下旅順。”，范文程見狀說道，“這是天賜良機，我們絕對不能錯過。”

　　於是皇太極就命令富查出兵打旅順，但是同時皇太極也告訴富查，後金的補給無法支撐他打長期戰爭，畢竟後金在大凌河戰役後受降的上萬明軍導致後勤壓力驟然上升，不過富查對此卻表示沒有什麽異議，他此前坐鎮遼南已經很長時間了，在這段時間內他持續不斷的向東江鎮派間諜細作並且拉攏當地軍隊。在這種情況下富查不但明白旅順守衛空虛的情況，還把不少當地缺糧挨凍的明軍拉攏到自己這邊，所以很快富查就集結了五千後金軍秘密進軍旅順，明軍對此是毫無防備，而很快富查還聯絡投靠自己的明軍讓他們打開了外圍關卡，富查趁機率領後金軍火速發動進攻，然而東江總兵黃龍對此幾乎防備，現在他想要集結兵力防守但是為時已晚，更不要說已經有很多明軍投靠後金。

　　結果很快富查就帶領後金軍進旅順，此時黃龍由於之前的兵變身負重傷，這導致他根本無法逃跑到海上，在發現戰局已經無法挽回後，他選擇讓家丁在總兵府裡面放火自焚，最終隨著總兵黃龍葬身火海，其他的明軍各部紛紛選擇投降，至此富查的後金軍徹底佔領了旅順，港口內的明軍軍艦幾乎全部被清軍俘虜。至此富查一戰就拿下了困擾後金多年的旅順，傳到盛京後讓皇太極非常開心，而富查攻佔旅順也導致了更多連鎖反應，此前黃龍讓參將尚可喜帶領艦隊駐長山，結果尚可喜被神出鬼沒的天主教海盜船給纏住導致進退失據，而現在黃龍戰死後東江軍立刻就分裂，駐扎皮島的沈世魁趁機開始興風作浪，尚可喜年紀輕輕本來就是依靠黃龍軍令才能統帥水師，結果現在面對老油條沈世魁的滲透毫無辦法，就這樣尚可喜不但無法威脅繼續孔有德，反而已經自身難保。

　　與此同時都元帥李九成率領魯軍主力浩浩蕩蕩的殺到了濟南城下，吳襄和高起潛見狀就帶著關寧軍出城應戰，雙方在濟南城外展開了激戰，這次吳襄命令千總陸澄率部頂在前面，此時陸澄雖然還是沒得到多少火炮，但是最起碼吳襄給他提供了足夠的火繩槍，並且還允許陸澄把兵力擴充到上千。李九成率領魯軍跟關寧軍交戰之後，就立刻命令對關寧軍陣地狂轟濫炸，在吸收了大量歐洲裝備和傭兵後魯軍在火力上已經有了很大的優勢，所以李九成此戰就是想要用火器開路揚長避短，對此關寧軍已經在陣地上用戰車和圍牆組建了簡易防線，然而這些防線很快被魯軍炸的七零八落，而很快李九成就下達了進攻的命令， 魯軍對關寧軍的陣地展開全線進攻。

　　陸澄見狀趕緊重新集結士兵用火繩槍進行射擊，他麾下的部隊大多是久經沙場的遼兵，所以他們很快就恢復了陣型投入戰鬥，對面的魯軍士兵也用火繩槍展開反擊，但是陸澄所部佔據高地還依托工事，所以跟人多勢眾的魯軍打得難解難分，魯軍見遠射沒多少用就展開了衝鋒。陸澄見狀趕緊拔出指揮刀帶領士兵用馬刀和長矛展開肉搏戰，此時兩翼的關寧騎兵也展開了衝鋒，結果也算是沙場宿將的李九成對此早有準備，他立刻投入在兩翼部署的魯軍騎兵，結果他們成功的擋住了關寧騎兵，就這樣雙方展開了混戰，但是佔上風的很明顯是優勢更大的魯軍，信心十足的李九成見狀非常的高興，他認為現在自己基本上已經贏定了。

　　結果就在此時突然兩路關寧騎兵從側翼殺來，原來之前吳襄在側翼出動的關寧騎兵不過是誘餌，他們就是用來吸引魯軍騎兵，而現在祖大樂和祖大弼統帥的兩千騎兵才是主力，李九成見狀頓時發現自己情況不妙，很快關寧騎兵就衝垮了魯軍的側翼部隊，李九成見狀趕緊命令正面的魯軍主力回撤。結果此時正面的陸澄和祖寬等部趁機發動反擊，這導致魯軍陷入首尾難顧的情況，而祖大樂和祖大弼趁機率領關寧騎兵衝殺，這導致很快魯軍全面崩潰，就是衝著錢來的歐洲傭兵見狀紛紛就開始逃跑，他們基本上都沒有打逆風戰的想法，而很快魯軍各部也紛紛陷入崩潰狀態，而吳襄和高起潛見狀立刻命令關寧軍展開全線追擊，最終李九成死於亂軍之中。